Greetings. I'm trying to align the human genome to the gorilla genome. I
run lastz comparing each chromosome of the human genome with each
chromosome of the gorilla genome. I then want to reconstruct the alignments
which are available at

http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/vsGorGor3/axtNet/

but I don't get exactly the same results. Can you please explain me how I
should exactly proceed?

Thank you,

with kind regards.

Alessandro Testori,
PhD student, Torino University (Italy)

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