On 07/06/16 09:25, Uģis Lācis wrote:

Thank you for very quick answer!

It fixes the issue, now I have perfectly conforming meshes.

But maybe this is a thought for additional feature? It would be very convenient 
to pass as a command line argument the physical
volume identifier, and have GMSH export corresponding mesh with adjacent 
physical surfaces? The example I sent in was quite
simple, but real cases I am working on contains a lot of surfaces, which I 
suspect could be selected/deselected more efficient
than commenting and un-commenting physical definitions.

Hi,

Something like:

gmsh -string "Physical Volume(50) = {43};" test_conforming.geo -3

could maybe help you ?

And see also the "Boundary" and "CombinedBoundary" commands in 
http://gmsh.info/doc/texinfo/gmsh.html#Transformations

Regards,

Dave

--
David Colignon, Ph.D.
1er Logisticien de Recherche
Université de Liège
ACE - Applied & Computational Electromagnetics
Quartier POLYTECH 1 - Montefiore B28
Allée de la découverte 10
4000 Liège - BELGIQUE
Tél: +32 (0)4 366 37 32
http://www.ulg.ac.be/nic4


Best,
Uģis

On 03/06/16 17:36, Theler German Guillermo wrote:
Hi

Try comenting the definition of one physical volume and exporting one
mesh, then uncomment the first volume and comment the second and export
the second mesh. Make sure Mesh.SaveAll = 0 (see
http://gmsh.info/doc/texinfo/gmsh.html#Mesh-options-list )



--
--
Germán Theler :: CTO Ingeniería & TICs

CITES – Centro de Innovación Tecnológica Empresarial y Social S.A.
Dirección General Sancor Seguros
Grupo Sancor Seguros
tel +54 3493 –428 500 – Int.: 3374
[email protected]
www.cites-gss.com - www.gruposancorseguros.com

On Fri, 2016-06-03 at 09:33 +0200, Uģis Lācis wrote:
Hi everyone,

I am using GMSH to generate a 3D mesh to solve fluid and solid equations
in FreeFem++ in a coupled manner. So far I have generated two different
*.geo files for fluid and solid part, and that has produced reasonable
results for me up till now.

However, when investigating the produced meshes in a close up, it seems
that the generated meshes does not conform exactly... there are some
tiny differences at some points. I would like to get rid of those.

I have generated a single .geo file for both domains (see example
attached), but I am not able to export two separate mesh files - one for
physical volume "50" (and adjacent physical surfaces), and other for
physical volume "51" (and adjacent physical surfaces).

For me the task seems simple. Is there an easy/automatic way to do that
using gmsh?

I could of course write a script, that takes the whole mesh and extracts
the needed elements to other file, but for me it makes sense that such
functionality would be present within GMSH already.

I am using GMSH version 2.12.0.

Best regards,
Ugis
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