> Gracias por tu ayuda. Ya revise con mayor cuidado el archivo dna.xyz > y si en efecto son coordenadas las que se manejan.
Bien. > Tengo algunas otras dudas, exist alguna forma de distinguir en la molecula de adn que se forma, si las bases > son guaninas, timinas, citosinas o adeninas? Como puedes ver, el formato .xyz not tiene mucha informacion. El formato .pdb es mucho mejor para macromoleculas. Tiene mucho mas informacion sobre la estructura de cadenas en proteinas y dna/rna. Vete a http://www.rcsb.org/pdb puedes hacer unas busqueda para 1D66. Este modelo molecular tiene unas cadenas de ADN y una proteina. No soy biochemico, sino informatico. Y no tengo mucha experiencia con el PDB. > y otra pregunta �Existe alg�n > patr�n de incremento entre esas coordenadas?, Si. La estructura es muy regular. Pero no he estudiado este asunto y se los detailles. > porque yo no lo logro visualizar. > Te envio el archivo adjunto dna.xyz. y ojal� pudieras ayudarme > con estas dudas. Gracias y espero tu respuesta Desgraciadamente, no puedo ayudarte mas. Mira, estas preguntas son complicadas y no tienen respuestas faciles. Creo que cada pregunta es unos meses de estudios. Jmol es un programa para la visualization de modelos moleculares. Puedo auydarte con preguntas sobre el programa, pero no sobre bioquimicos o bioinformatica. Adios, Miguel > Atte. > > Xavier Bueno Rom�n > 375783 > > > > > >>From: "Miguel" <[EMAIL PROTECTED]> >>To: [EMAIL PROTECTED] >>CC: [EMAIL PROTECTED] >>Subject: Re: [Jmol-users] Help using JMOL >>Date: Sun, 18 Apr 2004 15:58:39 +0200 (CEST) >> >>Xavier wrote: >> > I am using JMOL because I need do a project in my university. However, >> I >> > have a problem because I don�t know how to use or create my .xyz file >> . >>I >> > am >> > using DNA.xyz example, but I need modify DNA.xyz to create my own DNA >> > Molecule Structure. >> > >> > I thank you help and I hope your early answer. >> >>Xavier, >> >>I'm not sure exactly what type of information you are looking for. >> >>The format of an .xyz file is very simple. >> line 1 = atom count >> line 2 = optional molecule name >> following lines - atom definitions >> >>each atom location is: >> atomic-symbol x-coordinate y-coordinate z-coordinate >> >>The coordinates are in angstroms. Spacing between columns is not >> important. >> >>--- >> >>Xavier, >> >>No se exactamente que tipo de informacion necesitas. >> >>El formato de un archivo .xyz es muy facil. >> linea 1 - la cuenta de atomos >> linea 2 - nombre de la molecula (opcional) >> lineas siguientes - definiciones de los atomos >> >>cada atomo es: >> simbolo-atomico coordinada-x coordinada-y coordinada-z >> >>Las coodinadas son en Angstroms. El numbero de espacios entre las >> columnas >>no es importante. >> >> >>Miguel >> >> > > _________________________________________________________________ > Charla con tus amigos en l�nea mediante MSN Messenger: > http://messenger.microsoft.com/es > ------------------------------------------------------- This SF.Net email is sponsored by: IBM Linux Tutorials Free Linux tutorial presented by Daniel Robbins, President and CEO of GenToo technologies. Learn everything from fundamentals to system administration.http://ads.osdn.com/?ad_id70&alloc_id638&op=click _______________________________________________ Jmol-users mailing list [EMAIL PROTECTED] https://lists.sourceforge.net/lists/listinfo/jmol-users
