Hi Stefan,
For me this sounds like it is not an MITK-related issue but more probably an
ITK, gdcm or wrong image data problem.
I am not aware of any interactive image-header editing in MITK, if that is what
you were asking for.
Two workarounds I use in such cases:
1) If you save the files as .MHD or .NRRD (or NHDR for separate header and
raw) you can manually adapt the header via text-editor.
2) http://lcni.uoregon.edu/~jolinda/MRIConvert/
Regards
Klaus
---
Dr. rer. nat. Klaus H. Fritzsche
Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ) in der Helmholtz-Gemeinschaft
Abteilung Medizinische und Biologische Informatik
Im Neuenheimer Feld 280, D-69120 Heidelberg
Tel: 49-(0)6221-42-3545, Fax: 49-(0)6221-42-2354
E-Mail: [email protected]<mailto:[email protected]>, Web:
www.dkfz.de<http://www.dkfz.de>
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Von: Stefan Dänzer [mailto:[email protected]]
Gesendet: Dienstag, 14. September 2010 20:39
An: [email protected]
Betreff: [mitk-users] Orientation of dicom mri images
Hi all,
I have several dicom mri series of a patient. The series were all created
during one mri session. In some of the series the scan planes get
misinterpretet (transversal is sagital), which causes a misalignment of the
series, which should spatially overlap. Is there a way to define how a dicom
series is aligned with the anatomical planes?
Regards,
Stefan
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