Grigory V.Sapunov <[email protected]> писал(а) в своём письме Sat,
01 Sep 2012 16:28:30 +0300:
А ваши сомнения на чём основаны?
Основаны на том, что для расшифровки RNA написано очень много кода на
Perl
(не только известный bioperl)
и подавляющее большинство иностранных Web-ресурсов (например, NCBI)
использует perl-scripts.
С тем количеством проектов, которое есть в ncbi, я думаю, там вообще
много всего можно найти :)
Думаю, выбор perl здесь не случаен --- основан на особенностях языка,
оптимизированного
для работы с последовательностями символов (RNAseq, proteins, ...)
Это, конечно, да, но хардкорный анализ (типа различных бластов) чаще
реализуется на чём-то более эффективном, типа C. blast+, например, на
плюсах.
Согласен. Тут нужна хорошая скорость вычислений.
Мне кажется, перл здесь больше годится для всякой мелкой работы. Как
клей.
А 'R in a nutshell' Вам довелось прочитать?
--
ANG
--
Moscow.pm mailing list
[email protected] | http://moscow.pm.org
