Dear PETSc Team,
I am trying to understand how to increase the overlap of a matrix.
I wrote the attached petsc4py script where I build a simple matrix and play
with the increaseOverlap method. Unfortunately, before and after the call,
nothing changes in the index set. FYI, I have tried to mimic
src/ksp/ksp/tutorials/ex82.c<https://petsc.org/main/src/ksp/ksp/tutorials/ex82.c.html>
line 72:76.
Here is how I run the script : "mpiexec -n 2 python test_overlap.py"
Could you please indicate what I am missing ?
Regards,
Nicolas
--
Nicolas Tardieu
Ing PhD Computational Mechanics
EDF - R&D Dpt ERMES
PARIS-SACLAY, FRANCE
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import petsc4py
# petsc4py.init(['-info'])
from petsc4py.PETSc import KSP, IS, Mat, Options, Viewer, PC, Vec, NullSpace, MatPartitioning, COMM_SELF
NEQ = 6
# Simple parallel diagonal matrix
M = Mat().create()
M.setSizes([NEQ, NEQ])
M.setType('aij')
M.setUp()
M.setPreallocationNNZ(1)
cs, ce = M.getOwnershipRange()
for row in range(cs, ce):
M.setValue(row, row, row)
M.assemble()
M.view()
ovl=2
# reproduce initial layout
isovl = IS().createStride(ce-cs, cs, 1, comm=COMM_SELF)
loc = isovl.getLocalSize()
print(f"locSize before = {loc}", flush=True)
isovl.view()
# increase overlap
M.increaseOverlap(isovl, ovl)
loc = isovl.getLocalSize()
print(f"locSize after = {loc}", flush=True)
isovl.view()