Please, google "pymol iterate objects" 3rd in the hit list: [PyMOL] iterating over list of objects for i in *cmd.get_object_list()*: cmd.align( i, reference )
On Mon, Jan 27, 2025 at 9:56 AM Csongor MATYAS via PyMOL-users < pymol-users@lists.sourceforge.net> wrote: > I am trying to iterate over lots of distances that I can generate with > cmd.distance(name = 'distA_B', selection1 = 'selA', selection2 = 'selB', > cutoff = 3.6, mode = 2) for example. My only problem is that I don't know > how to iterate over them. How can one iterate over objects that are not > selection of atoms? > (I'm doing this from python using the pymol-bundle, but even in pymol I > can't find a way to save these into a file or print them or save them in a > variable somehow) > > Kind regards, > Csongor > > DISCLAIMER > > Prezentul mesaj și orice documente atașate pot conține informații > confidențiale sau sensibile care aparțin Universității Babeș-Bolyai din > Cluj-Napoca. Conținutul mesajului nu poate fi dezvăluit sau utilizat de > către altcineva decât destinatarul, persoană fizică sau juridică. Dacă ați > primit acest mesaj dintr-o eroare, vă rugăm să ne anunțati imediat, ca > răspuns la mesajul de față, și să ștergeți apoi din sistemul dvs. mesajul > fără a-l copia sau deschide. Prin prezenta vi se notifică faptul că orice > dezvaluire, copiere, distribuire sau inițierea/omiterea unor acțiuni pe > baza prezentelor informații sunt strict interzise și atrag răspunderea > civilă și/sau penală (art. 302 Noul Cod Penal). UBB nu este răspunzătoare > pentru modificările care pot fi aduse prezentului mesaj și nici pentru > întârzierile care pot surveni în recepționarea acestuia. De asemenea, nu > putem garanta integritatea mesajului și nici că acesta este lipsit de > viruși, interceptări sau interferențe de orice natură. ================= > The contents of this email message and any attachments may contain > confidential and/or privileged information belonging to Babeș-Bolyai > University of Cluj-Napoca. This information is intended solely for the > addressee, natural or legal person, and is legally protected from > disclosure and may not be used by anyone other than the intended recipient. > If you are not the intended recipient of this message, or if this message > has been addressed to you in error, please immediately alert the sender by > reply email and then delete this message and any attachments. You are > hereby notified that any use, dissemination, copying, or storage of this > message or its attachments as well as taking any action in reliance on the > contents of this information is strictly prohibited and entails civil > and/or criminal liability (under Art. 302 of the New Criminal Code). UBB > accepts no liability for any errors or omissions in the contents of this > message. Email transmission cannot be guaranteed to be secure or > error-free, as information could be intercepted, corrupted, lost, > destroyed, arrive late or incomplete, or contain viruses. > UBBCLUJ <https://www.ubbcluj.ro/ro/politici/> > > _______________________________________________ > PyMOL-users mailing list > Archives: http://www.mail-archive.com/pymol-users@lists.sourceforge.net > Unsubscribe: > https://sourceforge.net/projects/pymol/lists/pymol-users/unsubscribe >
_______________________________________________ PyMOL-users mailing list Archives: http://www.mail-archive.com/pymol-users@lists.sourceforge.net Unsubscribe: https://sourceforge.net/projects/pymol/lists/pymol-users/unsubscribe
