Obrigado pela ajuda Walmes, vou ler a documentação do pacote.
Att.
Tiago. 

Date: Mon, 26 Nov 2012 13:21:03 -0200
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Subject: Re: [R-br] Fatorial com parcelas perdidas

Tanto lm() quanto aov() podem ser usadas com dados desbalanceados. Acontece que 
o usuário deve estar ciente das conseguências do desbalanceamento: (1) 
diferença na precisão dos efeitos e (2) não ortogonalidade entre as fontes de 
variação. Ou seja, não ortogonalidade implica que as somas de quadrado 
sequencial (padrão do R) mudam de acordo com a ordem dos termos no modelo e que 
as médias amostrais não são estimadores livres de efeitos (deve-se usar médias 
ajustadas) e a diferença de precisão implica que você não deve usar métodos 
baseados em diferença mínima significativa única, com LSD, HSD, etc para 
comparar tais médias. Nestes casos é recomendado fazer as comparações de 
interesse e corrigir o p-valor devido à multiplicidade adotando por exemplo a 
correção de Bonferroni ou similar. Muitas opções estão disponíveis no pacote 
multcomp. Para médias ajustadas pode-se usar a doBy::popMeans().


À disposição.
Walmes.
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