Hola Luis, Pero son tus argumentos correctos? Yo no veo un método "s".
diversitycomp(x, y = NULL, factor1 = NULL ,factor2 = NULL, index=c("Shannon", "Simpson", "inverseSimpson", "Logalpha", "Berger", "richness", "abundance", "Jevenness", "Eevenness", "jack1", "jack2", "chao", "boot"), method=c("pooled", "mean", "sd", "jackknife"), sortit=FALSE, digits=8) El 15 de febrero de 2017, 11:52, Luis E <luisesp...@hotmail.com> escribió: > Estimados, > > Muchas gracias por sua ayuda, ya pude instalar data.table y esta > funcionando. > > Respecto al paquete biodiversityR, no se porque ahora no me corre. El > script esta correcto, pero no se porque me tira error. > > > > > > fase<-diversitycomp(biobsp, y=biopcat,factor1="Fase", > index="richness",method=“s") > Error in diversitycomp(biobsp, y = biopcat, factor1 = "Fase", index = > "richness", : > choose an accepted method, not method: s > > > Gracias a ambos por su ayuda. > > > Saludos, Luis > > > El 15 feb. 2017, a las 12:44, Carlos Ortega <c...@qualityexcellence.es< > mailto:c...@qualityexcellence.es>> escribió: > > Ya... > El problema que pareces tener en tu Mac es que no tienes ninguna librería > de desarrollo instalada y no puedes compilar data.table. > ¿Tienes instalado el Xcode?. > > Es la aplicación de desarrollo (gratuita) para Mac del propio Apple. Esta > aplicación contiene diferentes compiladores que te permitirán compilar el > paquete y otros muchos que necesiten de esta compilación. Para conseguir > "Xcode" tienes que ir a "Actualización de software..." y dentro de > "Comprado" te debiera de aparecer. O vaya en tu acceso al AppStore búscala > e instálala... > > Cuando la instales, la abres y la cierras, de esta forma ya se aplican > todas las variables de configuración, que permitirán ya decir al compilador > de "R" donde buscar los compiladores necesarios. > > Y ya tras hacer esto, podrás compilar data.table... > > Saludos, > Carlos Ortega > > 2017-02-15 16:36 GMT+01:00 Luis E <luisesp...@hotmail.com<mailto: > luisesp...@hotmail.com>>: > Gracias Carlos, > > ya intente instalar varias veces el paquete data.table, pero no se porque > no lo puede instalar > > Aqui mando la salida: > > > > install.packages("data.table") > > There is a binary version available but the source version is later: > binary source needs_compilation > data.table 1.10.0 1.10.4 TRUE > > Do you want to install from sources the package which needs compilation? > y/n: y > installing the source package 'data.table' > > probando la URL 'https://cran.rstudio.com/src/ > contrib/data.table_1.10.4.tar.gz' > Content type 'application/x-gzip' length 3068135 bytes (2.9 MB) > ================================================== > downloaded 2.9 MB > > Durante la inicializaci'on - Warning messages: > 1: Setting LC_CTYPE failed, using "C" > 2: Setting LC_TIME failed, using "C" > 3: Setting LC_MESSAGES failed, using "C" > 4: Setting LC_MONETARY failed, using "C" > * installing *source* package 'data.table' ... > ** package 'data.table' successfully unpacked and MD5 sums checked > ** libs > xcrun: error: invalid active developer path > (/Library/Developer/CommandLineTools), > missing xcrun at: /Library/Developer/CommandLineTools/usr/bin/xcrun > ERROR: compilation failed for package 'data.table' > * removing '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.3/ > Resources/library/data.table' > Warning in install.packages : > installation of package 'data.table' had non-zero exit status > > The downloaded source packages are in > '/private/var/folders/wc/fkdhnf4j27z9h3s2bck8ntxh0000gn > /T/RtmpvGHO4t/downloaded_packages' > > > > El 15 feb. 2017, a las 12:28, Carlos Ortega <c...@qualityexcellence.es< > mailto:c...@qualityexcellence.es>> escribió: > > El error que estás teniendo te dice que lo que te falta es el paquete > "data.table".... > Prueba a instalar este paquete y lánzalo de nuevo. > > Saludos, > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es/> > > El 15 de febrero de 2017, 15:58, Luis E <luisesp...@hotmail.com<mailto: > luisesp...@hotmail.com>> escribió: > > Estimados, > > Soy usuario de Mac y desde que instale la nueva version de R y Rstudio, > no puedo cargar el paquete Rcmdr. Lo miso me pasa con el paquete > BiodiversityR. > > Alguien tiene alguna posible solución? > > Desde ya muchas gracias. > > Saludos, Luis > > > > library(Rcmdr) > Loading required package: RcmdrMisc > Error in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck > = vI[[j]]) : > there is no package called 'data.table' > Error: package 'RcmdrMisc' could not be loaded > > [[alternative HTML version deleted]] > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es@r-project.org<mailto:R-help-es@r-project.org> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > > > -- > Saludos, > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es/> > > > > > -- > Saludos, > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es/> > > > [[alternative HTML version deleted]] > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es@r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es -- *Manuel Spínola, Ph.D.* Instituto Internacional en Conservación y Manejo de Vida Silvestre Universidad Nacional Apartado 1350-3000 Heredia COSTA RICA mspin...@una.cr <mspin...@una.ac.cr> mspinol...@gmail.com Teléfono: (506) 8706 - 4662 Personal website: Lobito de río <https://sites.google.com/site/lobitoderio/> Institutional website: ICOMVIS <http://www.icomvis.una.ac.cr/> [[alternative HTML version deleted]] _______________________________________________ R-help-es mailing list R-help-es@r-project.org https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es