Estimado Jimmy Nooo ¿como la cortas?
Entiendo que no sirve más. Creo que el fondo blanco te perjudica. Mi experiencia, realicé una reconstrucción 3d, foto, foto con fotógrafo que eliminó el resto, filmación pasada a fotos. Lo peor, la foto con fotógrafo, la de mejor calidad. Quizás deberías estudiar todo nuevamente, tomar los errores, buscar soluciónes y rehacer el trabajo. Javier Marcuzzi > El 15 ago 2024, a las 2:30 p. m., Jimmy Erney Reyes Velasco > <jimmyreyesvela...@gmail.com> escribió: > > Muchas gracias por todos sus comentarios. > Muy valiosa la información, hay algunas cosas que no entiendo muy bien. Si > tuvieran algunos documentos que pudiera leer les agradecería. > Yo he trabajado con las relaciones entre largo y ancho de la hoja, esas > relaciones son muy precisas, sin embargo, el problema está cuando las hojas > son afectadas, se pierde bastante la estructura. Al yo obtener el área puedo > estimar muy bien la masa seca que tendría esa hoja y comparar con respecto a > lo que se ha defoliado. > Mando unos ejemplos aquí de una hoja sana y otra afectada, la hoja sana está > por la mitad porque la cortamos para poder escanearla > Saludos y muchas gracias > > Jimmy > > > El mié, 14 de ago. de 2024 4:40 p. m., Javier Marcuzzi > <javier.ruben.marcu...@gmail.com <mailto:javier.ruben.marcu...@gmail.com>> > escribió: >> Estimado >> >> Quizás, por lo que dice Carlos Ortega, antes de pasarlo a escala de grises, >> podría pasarlo a escala RGB, jugar un poco, el entrenamiento no distinguirá >> si es escala de gris, como mezcla de negro y blanco, puede intentar rojo y >> blanco, rojo y verde, con la idea de detectar cambios en el color >> relacionado a posibles cambios en la humedad o “madurez” de las hojas, por >> ahí, con muy poco trabajo extra y con los mismos datos encuentra algo que le >> sirve. >> >> Javier Marcuzzi >> >>> El 14 ago 2024, a las 3:16 p. m., Carlos Ortega <c...@qualityexcellence.es >>> <mailto:c...@qualityexcellence.es>> escribió: >>> >>> Hola, >>> >>> ¿Qué tal? >>> El problema que planteas al final es el de determinar el área de una hoja >>> afectada, ya que su superficie nos es regular. >>> Para todos estos análisis puedes hacerlo perfectamente en R, en concreto >>> los paquetes "magick" y "EBImage" (este último del repositorio >>> BioConductor). >>> Lo que tendrás que hacer es procesar las imágenes, pasarlas a tonos de >>> gris, aplicarles filtros para detectar el contorno y estimar la superficie >>> faltante. Estos cálculos no son complicados. También puedes hacer algún >>> tipo de modelo usando el área de las hojas completas y extrapolando estos >>> resultados a las hojas dañadas. >>> Si luego lo que además quieres es hacer algún tipo de modelo, para tener en >>> cuenta el posible daño en los diferentes tipos de hojas, puedes antes de >>> pasar a usar algo más sofisticado como modelos de DeepLearning, usar la >>> información RGB que tienes en tu imagen, seguramente las distribuciones de >>> los colores serán diferentes entre una hoja en buen estado y otra que ha >>> tenido algún daño (estando ambas completas). >>> >>> Gracias, >>> Carlos Ortega >>> www.qualityexcellence.es <http://www.qualityexcellence.es/> >>> >>> El mié, 14 ago 2024 a las 14:54, Javier Marcuzzi >>> (<javier.ruben.marcu...@gmail.com >>> <mailto:javier.ruben.marcu...@gmail.com>>) escribió: >>>> Estimado Jimmy Velasco >>>> >>>> Si puede tener la materia seca, podría realizar algún tipo de regresión, >>>> pero se me crea la duda biológica, ¿que cambio de agua hay y si este >>>> cambio modifica la selección como alimento de ese vegetal? En otras >>>> palabras, ¿hay un punto donde se pierde palatabilidad y prefiere otra >>>> hoja? En ese caso la regresión por materia seca podría no ser adecuado. Yo >>>> se que si modifico un poco la materia seca en bovinos tengo diferencias, >>>> me conviene hacerlo antes que el ganado pastoree. >>>> >>>> En cuanto a R y Python, yo de Fortran pasé a Python y luego a R, para mi >>>> gusto personal, R me parece mejor pero Python tomo mucho de R para la >>>> parte de estadística, como que se alimenta uno de las ideas de otro, y el >>>> otro de las ideas de uno. >>>> >>>> La diferencia no está en el lenguaje, sino en la cantidad de algoritmos >>>> que pueda probar para lo mismo, yo utilizaría varias herramientas, en ese >>>> caso me es “simple” con R, importo un paquete, paso los datos, tomo los >>>> resultados, importo otro paquete para lo mismo pero que internamente >>>> realiza los cálculos de otra forma, tomo los datos, y así varias veces, >>>> tomando al final una comparación para conocer cuál paquete da mejores >>>> resultados para mi trabajo, y esto no sería repetidle. En R sería algo >>>> como sumary(modelo1, modelo2, modelo3, modelo …) >>>> >>>> Javier Rubén Marcuzzi >>>> >>>> > El 13 ago 2024, a las 7:40 p. m., Jimmy Erney Reyes Velasco >>>> > <jimmyreyesvela...@gmail.com <mailto:jimmyreyesvela...@gmail.com>> >>>> > escribió: >>>> > >>>> > Muchas gracias por sus respuestas Manuel y Javier. >>>> > El problema al que me enfrento es que a veces estas afectaciones por >>>> > herbivoría dejan cicatrices que pueden deformar la hoja, a veces se >>>> > pliegan sobre sí mismas y otras veces se pierde bastante la >>>> > configuración de la hoja. Por el momento solo me interesa tratar de >>>> > reconstruir la hoja para poder obtener el área que tendría esa hoja si >>>> > no se hubiese afectado. Cuento con hojas escaneadas de individuos sanos >>>> > y defoliados, por así decirlo, la idea mía es comparar los valores >>>> > predichos de área foliar reconstruida y estimar la pérdida de biomasa, >>>> > aunque la biomasa lo puedo hacer sencillamente, porque tengo las >>>> > relaciones área foliar vs masa seca mediante regresión.en este caso las >>>> > hojas son planas y tienen una forma de elipsoide, sin embargo, para mí >>>> > no es difícil calcular la masa de las hojas afectadas, y que sí es >>>> > dificil es saber cuánto sería su biomasa si no hubiese perdido su área. >>>> > Mi problema va orientado hacia la siguiente pregunta Si lo hago con >>>> > imágenes, ¿qué datos debería ingresar? ¿Con qué paquetes en R podría >>>> > hacerlo? ¿Es mejor en R o en Python? >>>> > Muy relevantes sus aportes y >>>> > muchas gracias por su colaboración, estoy atento >>>> > Saludos >>>> > Jimmy >>>> > >>>> > >>>> > El mar, 13 de ago. de 2024 9:43 a. m., Javier Marcuzzi >>>> > <javier.ruben.marcu...@gmail.com >>>> > <mailto:javier.ruben.marcu...@gmail.com><mailto:javier.ruben.marcu...@gmail.com >>>> > <mailto:javier.ruben.marcu...@gmail.com>>> escribió: >>>> >> Estimado >>>> >> >>>> >> Yo no conozco de morfología vegetal, pero si supongo que la hoja es >>>> >> plana, me refiero que al verla sobre el eje se forma un rectángulo, la >>>> >> altura en cada parte de la hoja es la misma, a una misma densidad, >>>> >> puedo calcular la masa. En ese caso como siguieren, por medio de fotos >>>> >> y entrenar un modelo, se podía “reconstruir” lo perdido. >>>> >> >>>> >> Pero entiendo que las hojas no deben tener esa forma morfológica, tan >>>> >> plana, miro morfología vegetal en wikipedia y no está a simple vista mi >>>> >> duda, pero agrega nervadura, como una complicación más. >>>> >> >>>> >> Aquí hay dos problemas, el cálculo realizado con su error, más el error >>>> >> de no tener la masa original y utilizar la calculada con el error más >>>> >> el error estadístico de su cálculo original. >>>> >> >>>> >> Un agrónomo podría ayudarlo, yo como veterinario se que si corto el >>>> >> forraje a la mañana, tengo diferencias a la tarde, por lo cuál, usted >>>> >> también puede tener diferencias de masa. >>>> >> >>>> >> Posiblemente se “meta” en un gran problema estadístico o matemático por >>>> >> no haber tenido en cuenta la biología, creo que la mejor solución y la >>>> >> más simple, es tomar las mediciones el año que viene o en las próximas >>>> >> hojas. Puede tener demasiado trabajo y al aplicarlo falle por errores >>>> >> de cálculos. >>>> >> >>>> >> > El 13 ago 2024, a las 12:35 a. m., Manuel Mendoza >>>> >> > <mmend...@fulbrightmail.org >>>> >> > <mailto:mmend...@fulbrightmail.org><mailto:mmend...@fulbrightmail.org >>>> >> > <mailto:mmend...@fulbrightmail.org>>> escribió: >>>> >> > >>>> >> > Hola Jimmy, creo que solo podrías intentarlo con deep learning. Tomas >>>> >> > hojas enteras, las pesas, a algunas de ellas les quitas los márgenes >>>> >> > de >>>> >> > forma similar a las que tienes estropeadas, las digitalizas todas y >>>> >> > utilizas como variable objetivo la masa original. El algoritmo tendrá >>>> >> > que >>>> >> > aprender a inferir la masa a partir del patrón en las nervaduras, si >>>> >> > es >>>> >> > que se relaciona con la masa, que supongo que sí. Le aplicas el >>>> >> > algoritmo a >>>> >> > las estropeadas y tendrás su masa original. Si lo haces todo con hojas >>>> >> > frescas, podrías incluso determinar la masa fresca de las hojas >>>> >> > secas, si >>>> >> > es lo que te interesa. >>>> >> > Keras no es fácil de usar, pero permite hacerlo. >>>> >> > Ya me dirás, >>>> >> > Un saludo, >>>> >> > Manuel >>>> >> > >>>> >> > El mar, 13 ago 2024 a las 0:54, Jimmy Erney Reyes Velasco (< >>>> >> > jimmyreyesvela...@gmail.com <mailto:jimmyreyesvela...@gmail.com> >>>> >> > <mailto:jimmyreyesvela...@gmail.com >>>> >> > <mailto:jimmyreyesvela...@gmail.com>>>) escribió: >>>> >> > >>>> >> >> Buen día, estimados. >>>> >> >> Tengo un problema y me gustaría saber cómo solucionarlo. >>>> >> >> Actualmente me encuentro realizando un estudio estimando la pérdida >>>> >> >> de >>>> >> >> biomasa foliar de una especies de planta, sin embargo, me encuentro >>>> >> >> con el >>>> >> >> siguiente problema: algunas hojas han perdido tanta área foliar que >>>> >> >> han >>>> >> >> perdido también el margen e incluso algunas más de la mitad del área >>>> >> >> de la >>>> >> >> hojas. Mi objetivo es realizar un modelo de reconstrucción del área >>>> >> >> de la >>>> >> >> hoja para así estimar su masa seca en relación con esa área perdida y >>>> >> >> obtener valores de pérdida de biomasa foliar. >>>> >> >> Tengo algunas ideas, pero no sé cómo empezar. >>>> >> >> Una de ellas es usar un algoritmo de machine learning para poder >>>> >> >> obtener un >>>> >> >> modelo que me permita reconstruir el margen de la hoja, pero la >>>> >> >> verdad >>>> >> >> desconozco mucho acerca de si puedo usar este método. >>>> >> >> Les agradecería muchísimo si pudieran colaborarme con información o >>>> >> >> si >>>> >> >> alguien puede darme una idea de cómo abordar este tema. >>>> >> >> Saludos >>>> >> >> Jimmy >>>> >> >> >>>> >> >> [[alternative HTML version deleted]] >>>> >> >> >>>> >> >> _______________________________________________ >>>> >> >> R-help-es mailing list >>>> >> >> R-help-es@r-project.org <mailto:R-help-es@r-project.org> >>>> >> >> <mailto:R-help-es@r-project.org <mailto:R-help-es@r-project.org>> >>>> >> >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es >>>> >> >> >>>> >> > >>>> >> > [[alternative HTML version deleted]] >>>> >> > >>>> >> > _______________________________________________ >>>> >> > R-help-es mailing list >>>> >> > R-help-es@r-project.org <mailto:R-help-es@r-project.org> >>>> >> > <mailto:R-help-es@r-project.org <mailto:R-help-es@r-project.org>> >>>> >> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es >>>> >> >>>> >>>> >>>> [[alternative HTML version deleted]] >>>> >>>> _______________________________________________ >>>> R-help-es mailing list >>>> R-help-es@r-project.org <mailto:R-help-es@r-project.org> >>>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es >>> >>> >>> -- >>> Saludos, >>> Carlos Ortega >>> www.qualityexcellence.es <http://www.qualityexcellence.es/> > <Screenshot_20240815-122420~2.jpg><Screenshot_20240815-122355~2.jpg> [[alternative HTML version deleted]] _______________________________________________ R-help-es mailing list R-help-es@r-project.org https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
