Re: [R-br] Recode rotina

[Leonard Assis via R-br]

Eu, particularmente, usaria o recode, mas jogaria em uma outra variável

Leonard

Em 31 de jan de 2018 1:48 PM, "Tiago Fragoso via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

Olá

Você pode usar a função 'mapvalues' do pacote plyr também.  No seu caso,
ficaria

ads <- plyr::mapvalues(ads, from =
c('péssimo','ruim','otimo','bom','regular'), to =
c('Negativa','Negativa','Positiva','Positiva',''))

2018-01-31 13:05 GMT-02:00 Edson Lira via R-br :
> Já resolvi, com a rotina abaixo.
>
> ads <- apply(ads, 2, function(x) {x <- recode(x,"'pessimo'='Negativa';
> 'ruim'='Negativa';
>   'otimo'='Positiva';'bom'='Positiva';'nao
> utilizou o servico'='';'regular'=''"); x})
>
> Se alguém tiver uma solução mais elegante, eu gostaria de saber.
>
> Bom dia a todos!
>
> [  ]'s.
> Prof. Edson Lira, Me
> Estatístico
> Manaus-Amazonas
>
>
> Em Quarta-feira, 31 de Janeiro de 2018 9:45, Edson Lira via R-br
>  escreveu:
>
>
> Bom dia caros amigos, tenho um pequeno problema que ainda não consegui
> encontrar a solução.
>
> É o seguinte: Estou aplicando um questionário para avaliar a satisfação do
> cliente em um hospital público.
>
> Na avaliação dos clientes estou usando uma escala de likert com as
respostas
> para algumas questões.
>
> ótimo, bom, regular, ruim, péssimo e não utilizou o serviço
>
> Gostaria de fazer uma mudança nessas respostas usando uma rotina do R.
>
> Gostaria de mudar da seguinte forma para todo o banco de uma única vez.
>
> otimo e bom receberia o label "positiva" regular e não utilizou o serviço
o
> label " "
> e ruim e péssimo receberia o label  "negativa".
>
> Alguém tem alguma sugestão?
>
> Bom diae muito obrigado!!!
> Prof. Edson Lira, Me
> Estatístico
> Manaus-Amazonas
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c�digo
> m�nimo reproduz�vel.
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código
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Instalar pacote do github

[Leonard Assis via R-br]

devtools::install_github("vqv/ggbiplot", dependencies =T)

Supondo que este link exista e que devtools está instalado, estou
escrevendo isto do celular, não testei

Em 11 de jan de 2018 4:09 PM, "Maurício Lordêlo via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

Caros,
Certa vez eu consegui instalar o pacote "ggbiplot" que considero bem
interessante.
Não sei se pela atualização do R, ou de mudança de versão do Windows, não
mais consigo instalar este pacote.
Pelo que tenho registrado nos meus scripts, eu seguia os passos abaixo:
library(devtools)
install.packages("githubinstall")
library(githubinstall)
install.packages("ggbiplot-master")
library(ggbiplot-master)
install_github("ggbiplot","vqv")

Também fiz estas duas tentativas sem sucesso

install.packages("diretório de trabalho/ggbiplot-master.zip") #aqui eu fiz
o download do arquivo zip e salvei no "diretório de trabalho"
install.packages("https://github.com/vqv/ggbiplot.git;)

Alguém saberia informar como resolver este problema?

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Re: [R-br] Sigularidade backsolve, o que significa?

[Leonard Assis via R-br]

Matriz está (quase) linearmente dependente.

Ou seja: tem parâmetros demais para dados de menos, ou alguma coluna é
combinação linear de outras. Ou os dois



Em 14 de dez de 2017 8:38 PM, "Fernando Souza via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Caros Amigos
>
> o que pode significar essa mensagem em modelos não linear mixto (nlme)?
>
> Error in MEEM(object, conLin, control$niterEM) :
>   Singularity in backsolve at level 0, block 1
> --
> =
> Fernando Souza
> Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal
> Celular: (31)99796-8781 <(31)%2099796-8781> (Vivo)
> E-mail:nandodeso...@gmail.com 
> Lattes: http://lattes.cnpq.br/6519538815038307
> Blog: https://producaoanimalcomr.wordpress.com/
> ==
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Re: [R-br] Sobreposição de BoxPlots

[Leonard Assis via R-br]

Jasmire,
Acredito que faltou uma coisa básica: voce explicar o que você espera obter
como resultado(visualizar) para que alguém possa propor uma solução.

Leonard

Em 1 de dez de 2017 6:34 PM, "Jasmine Moreira via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

Pessoas queridas,

estou encontrando um problema de sobreposição ao utilizar um boxplot com o
parâmetro barwidth (usei alpha=0.6 para mostrar a sobreposição).

Obrigada pela ajuda,
Jasmine


library(ggplot2)
data(mtcars)
ggplot(mtcars, aes(x=factor(cyl), y=mpg)) +
  geom_boxplot(aes(fill=factor(gear)), alpha=0.6, varwidth = TRUE)


Resultado:


Sem o parâmetro barwidth:






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Re: [R-br] Corrigir ausência de dados

[Leonard Assis via R-br]

Olhe teorias sobre missing value imputation.

O R tem o pacote mice (eu utilizo) que corrige por diversos métodos à
escolha do freguês. Mas desconheço forma logica para série temporal

Em 14 de nov de 2017 6:32 PM, "Edson Lira via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Obrigado Elias, mas supondo que houvesse esse problema, como resolvê-lo?
> Pensei em um modelo de regressão, como terei que fazer por estrado, como
> fazer em única rotina?
>
> Prof. Edson Lira, Me
> Estatístico
> Manaus-Amazonas
>
>
> Em Terça-feira, 14 de Novembro de 2017 16:29, Elias T Krainski via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
>
> Acho que você precisa procurar por dados do censo pois 2010 é ano de censo
> e não está incluido em séries de PNADs. Aliás, essas estatísticas são ainda
> mais precisas para esse ano.
> Elias
> On 14/11/17 23:14, Edson Lira via R-br wrote:
>
> Caros amigos, tenho uma série de dados de pea e pnea que têm uma ausência
> de dados no ano de 2010. Como faço para corrigir essa ausência?
>
>
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Re: [R-br] [Wordcloud] Problema com Encoding

[Leonard Assis via R-br]

Max,
Sem uma amostra dos dados que são fonte do erro fica muito dificil de te
ajudar.

Problema de encoding, eu já tive inclusive, ao compilar um .rmd via atalho
no rstudio e não por linha de comando.

Por isto é complicado te ajudar sem ter um exemplo dos dados problemáticos


Em 27 de set de 2017 11:39 PM, "Max via R-br" 
escreveu:

Pessoal, boa noite!

Com base em um exemplo pego na internet, tentei fazer uma nuvem de palavras
de um arquivo notepad (peguei uma pequena matéria na internet e salvei, em
.txt, com o nome SaoBento).
O código tem funcionado quase corretamente. O problema é que eu não tenho
tido sucesso em corrigir o *encoding* do texto.

- Tentei usar encoding = "UTF-8" na linha do readlines, mas sem sucesso.
- Também tentei usar enc2native() na última linha do passo 7, mas ocorre
erro argument is not a character vector.
- Salvei o arquivo SaoBento.txt no Notepad++, usando UTF-8 e, também, a
nuvem final acusou problemas de *encoding*.
- Deixei o arquivo SaoBento.txt salvo sozinho em uma pasta e, também, não
tive sucesso em acertar o *encoding*.

Sendo assim, gostaria de saber se alguém poderia fornecer uma dica de como
posso driblar esse problema.

Agradeço pela atenção.

Saudações,
-Max Lara

PS: A variável "AQUI_ERRO" é onde leio o texto "distorcido".

#==
# WORDCLOUD
#==

*#1) INSTALL REQUIRED PACKAGES*
install.packages("tm") #for text mining
install.packages("SnowballC") #for text stemming
install.packages("wordcloud") #wordcloud generator
install.packages("RColorBrewer")#color palletes

*#2) LOAD REQUIRED PACKAGES*
library("tm")
library("SnowballC")
library("wordcloud")
library("RColorBrewer")

*#3) TEXT MINING*
#LOAD THE TEXT (SAVED LOCALLY)
text <- readLines(file.choose())

*#4) LOAD THE DATA AS A CORPUS*
docs <- Corpus(VectorSource(text))  #VectorSource() function
creates a corpus of character vectors
docs <- tm_map(docs, PlainTextDocument)

*#5) TEXT TRANSFORMATION*
#tm_map() function (to replace, for instance, special characters from the
text).
#Replacing "/", "@" and "|" with space:

toSpace <- content_transformer(function (x , pattern ) gsub(pattern, " ",
x))
docs <- tm_map(docs, toSpace, "/")
docs <- tm_map(docs, toSpace, "@")
docs <- tm_map(docs, toSpace, "\\|")

*#6) TEXT CLEANING*
#tm_map() (remove unnecessary white space, to convert the text to lower
case)
#Removing common stopwords

docs <- tm_map(docs, content_transformer(tolower))#Convert
the text to lower case
docs <- tm_map(docs, removeNumbers)
#Remove numbers
docs <- tm_map(docs, removeWords, stopwords("portuguese"))   #Remove
Portuguese common stopwords
docs <- tm_map(docs, removePunctuation)
#Remove punctuations
docs <- tm_map(docs, stripWhitespace)
#Eliminate extra white spaces
docs <- tm_map(docs, stemDocument)
#Text stemming

*#7) BUILD A TERM-DOCUMENT MATRIX (TDM)*
#TDM is a table containing the frequency of the words.
#Column names are words
#Rown names are documents

dtm <- TermDocumentMatrix(docs)
terms(dtm)
m <- as.matrix(dtm)
v <- sort(rowSums(m),decreasing=TRUE)
d <- data.frame(word = names(v),freq=v)
head(d, 10)
AQUI_ERRO <- d$word

*#8) GENERATE THE WORD CLOUD*
wordcloud(
  words = AQUI_ERRO,
  freq = d$freq,
  min.freq = 1,
  max.words=200,
  random.order=FALSE,
  rot.per=0.35,
  colors=brewer.pal(8, "Dark2"))

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Re: [R-br] Estimar último valor na sequência de 0s e 1s...

[Leonard Assis via R-br]

Existe regra de formação? (Acrefito que não). Portanto, o mais próximo que
você irá chegar é a probabilidade do proximo ser 1 (ou 0), que será dado
por p1 <- mean(seq_0s1s) e p0 <-  1 - p1




Em 7 de set de 2017 4:10 PM, "andrebvs--- via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

Olá colegas, como posso formular uma rotina no R para saber (estimar) qual
seria o próximo valor X no resultado da sequência abaixo?

seq_0s1s <- sample(c(rep(0,20),rep(1,80)),50)

resultado:

0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 1 ... 1 1 1 0 1 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 1 0 X

desde já grato!


*Att. André*

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Re: [R-br] R com rpi3 server linux

[Leonard Assis via R-br]

Tem que olhar também se a arquitetura de rede não está interferindo nisto

Em 6 de set de 2017 3:10 PM, "Elias T. Krainski via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

>
> On 06/09/2017 14:45, Leonardo Ferrão via R-br wrote:
>
> A questão é, existe forma de agilizar esse cálculo?
>
> A função survreg() do pacote 'survival' que reduz o tempo de estimação
> para menos da metade e acho que os resultados são mais estáveis.
> http://www.stat.washington.edu/fritz/DATAFILES498B2008/WeibullBounds.pdf
>
> Elias
>
> ___
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
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Re: [R-br] Erro de memória importando objeto pequeno de SQL

[Leonard Assis via R-br]

O grupo rstats-db hoje desenvolve o DBI,  responsável pelas ligações de
SGBD com o R.
Recomendo uso deste pacote quando for lidar com conexão odbc.

On sex, 25 de ago de 2017 11:55 Cesar Rabak <cesar.ra...@gmail.com> wrote:

> Ah. . . a ditadura dos SW proprietários...
>
> Pelo menos resolveu seu problema e pode seguir com a parte que interessa
> que são as análises!
>
> Sucesso.
>
> 2017-08-25 10:33 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
> via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:
>
>> Ei pessoal,
>>
>> Obrigado pelas sugestões de todos. Não sei de onde veio essa informação
>> de que RODBC estaria "deprecated" olhei no r-forge e parece estar ativo. A
>> ultima atualização é do primeiro semestre de 2016.
>>
>> A saida do meu problema foi usando Rclient. Um R disponibilizado no sítio
>> da microsoft, que já vem instalados com uma série de pacotes proprietários
>> da Microsoft para integração com o SQL server 2016/2017. O nome do pacote
>> é RevoScaleR.
>>
>> Ao invés de fazer ...
>>
>> > p <- "SELECT model FROM [tempo_permanencia_models] WHERE id_model =
>> 1022"
>> > mod.teste.peq <- sqlQuery(conn, p) # que retorna o erro de memória!
>>
>> Eu fiz ...
>>
>> mod.teste.peq  <- RxOdbcData(sqlQuery = "SELECT model FROM
>> tempo_permanencia_models WHERE id_model=1018" ,connectionString = dbconn)
>> mod.teste.peq  <- rxReadObject(mod.teste.peq , decompress = "none")
>>
>> Agora dá pra fazer as previsões novamente...
>>
>> Abraço forte a todos,
>>
>>
>>
>> Pedro Brasil
>>
>> Em 2 de agosto de 2017 15:20, Leonard Assis via R-br <
>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>>
>>> RSQLServer não é boa alternativa, não sofre manutenção a tempos e
>>> depende de Java na máquina. Sugiro o pacote odbc.
>>>
>>> SQL Server é mestre em dar problema no R comigo, mas o problema é na
>>> autenticação.
>>>
>>> Em 1 de ago de 2017 9:14 AM, "Zhu Sha Zang via R-br" <
>>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>>>
>>>> Parece que RODBC está "deprecated", tente usar o pacote RSQLServer.
>>>>
>>>>
>>>> Atenciosamente
>>>>
>>>> On 07/31/2017 01:53 PM, Cesar Rabak via R-br wrote:
>>>>
>>>> Correto Pedro!
>>>>
>>>> Contudo, não entendo porque. . .
>>>>
>>>> Minha forma de atacar esse problema seria mandar os dados para o BD por
>>>> outra maneira (que ñ via R) e tentar conectar apenas para puxar os dados:
>>>> aí a gente vê se é na criação do BD via R que ele deixa em aberto um
>>>> tamanho default muito grande ou se é a chamada que por alguma coincidência
>>>> cria um default exigindo tanta memória (embora nos OSs modernos isso não
>>>> deveria gerar problema porque existem os gerenciadores de memória virtual).
>>>>
>>>> HTH
>>>> --
>>>> Cesar Rabak
>>>>
>>>>
>>>> 2017-07-31 10:32 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
>>>> <emmanuel.bra...@gmail.com>:
>>>>
>>>>> Cesar,
>>>>>
>>>>> A função RODBC::sqlQuery não tem exemplo, mas já usei diversas vezes
>>>>> com outros scripts e funciona. Esse problema está acontecendo somente no
>>>>> exemplo dessa conexão em específico. Então estou entendendo a partir de
>>>>> agora que  alguma configuração da conexão está pedindo pra reservar 
>>>>> memória
>>>>> mais do que o a máquina possui.
>>>>>
>>>>> Pedro Brasil
>>>>>
>>>>> Em 29 de julho de 2017 20:45, Cesar Rabak <cesar.ra...@gmail.com>
>>>>> escreveu:
>>>>>
>>>>>> Pedro,
>>>>>>
>>>>>> Calloc é uma chamada "primitiva" para o R, uma função da biblioteca C
>>>>>> e é uma função feita para "alocar" (reservar) memória e zerá-la.
>>>>>>
>>>>>> O estranho, para mim, é a tentativa do aplicativo de reservar *tanta* 
>>>>>> memória
>>>>>> assim na chamada da função do R.
>>>>>>
>>>>>> Essa função sqlQuery() pode ser testada fazendo:
>>>>>>
>>>>>> > example(sqlQuery)
>>>>>>
>>>>>> ?
>>>>>>
>>>>

Re: [R-br] Erro de memória importando objeto pequeno de SQL

[Leonard Assis via R-br]

https://github.com/rstats-db/odbc

Em 25 de ago de 2017 10:38 AM, "Leonard Assis" <assis.leon...@gmail.com>
escreveu:

> O RODBC está sendo substituído pelo pacote odbc
>
> On sex, 25 de ago de 2017 10:34 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do
> Brasil <emmanuel.bra...@gmail.com> wrote:
>
>> Ei pessoal,
>>
>> Obrigado pelas sugestões de todos. Não sei de onde veio essa informação
>> de que RODBC estaria "deprecated" olhei no r-forge e parece estar ativo. A
>> ultima atualização é do primeiro semestre de 2016.
>>
>> A saida do meu problema foi usando Rclient. Um R disponibilizado no sítio
>> da microsoft, que já vem instalados com uma série de pacotes proprietários
>> da Microsoft para integração com o SQL server 2016/2017. O nome do pacote
>> é RevoScaleR.
>>
>> Ao invés de fazer ...
>>
>> > p <- "SELECT model FROM [tempo_permanencia_models] WHERE id_model =
>> 1022"
>> > mod.teste.peq <- sqlQuery(conn, p) # que retorna o erro de memória!
>>
>> Eu fiz ...
>>
>> mod.teste.peq  <- RxOdbcData(sqlQuery = "SELECT model FROM
>> tempo_permanencia_models WHERE id_model=1018" ,connectionString = dbconn)
>> mod.teste.peq  <- rxReadObject(mod.teste.peq , decompress = "none")
>>
>> Agora dá pra fazer as previsões novamente...
>>
>> Abraço forte a todos,
>>
>>
>>
>> Pedro Brasil
>>
>> Em 2 de agosto de 2017 15:20, Leonard Assis via R-br <
>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>>
>>> RSQLServer não é boa alternativa, não sofre manutenção a tempos e
>>> depende de Java na máquina. Sugiro o pacote odbc.
>>>
>>> SQL Server é mestre em dar problema no R comigo, mas o problema é na
>>> autenticação.
>>>
>>> Em 1 de ago de 2017 9:14 AM, "Zhu Sha Zang via R-br" <
>>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>>>
>>>> Parece que RODBC está "deprecated", tente usar o pacote RSQLServer.
>>>>
>>>>
>>>> Atenciosamente
>>>>
>>>> On 07/31/2017 01:53 PM, Cesar Rabak via R-br wrote:
>>>>
>>>> Correto Pedro!
>>>>
>>>> Contudo, não entendo porque. . .
>>>>
>>>> Minha forma de atacar esse problema seria mandar os dados para o BD por
>>>> outra maneira (que ñ via R) e tentar conectar apenas para puxar os dados:
>>>> aí a gente vê se é na criação do BD via R que ele deixa em aberto um
>>>> tamanho default muito grande ou se é a chamada que por alguma coincidência
>>>> cria um default exigindo tanta memória (embora nos OSs modernos isso não
>>>> deveria gerar problema porque existem os gerenciadores de memória virtual).
>>>>
>>>> HTH
>>>> --
>>>> Cesar Rabak
>>>>
>>>>
>>>> 2017-07-31 10:32 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
>>>> <emmanuel.bra...@gmail.com>:
>>>>
>>>>> Cesar,
>>>>>
>>>>> A função RODBC::sqlQuery não tem exemplo, mas já usei diversas vezes
>>>>> com outros scripts e funciona. Esse problema está acontecendo somente no
>>>>> exemplo dessa conexão em específico. Então estou entendendo a partir de
>>>>> agora que  alguma configuração da conexão está pedindo pra reservar 
>>>>> memória
>>>>> mais do que o a máquina possui.
>>>>>
>>>>> Pedro Brasil
>>>>>
>>>>> Em 29 de julho de 2017 20:45, Cesar Rabak <cesar.ra...@gmail.com>
>>>>> escreveu:
>>>>>
>>>>>> Pedro,
>>>>>>
>>>>>> Calloc é uma chamada "primitiva" para o R, uma função da biblioteca C
>>>>>> e é uma função feita para "alocar" (reservar) memória e zerá-la.
>>>>>>
>>>>>> O estranho, para mim, é a tentativa do aplicativo de reservar *tanta* 
>>>>>> memória
>>>>>> assim na chamada da função do R.
>>>>>>
>>>>>> Essa função sqlQuery() pode ser testada fazendo:
>>>>>>
>>>>>> > example(sqlQuery)
>>>>>>
>>>>>> ?
>>>>>>
>>>>>> Se o exemplo do próprio pacote funcionar, aí teremos que fazer uma
>>>>>> busca para ver de onde vem esse comportamento.
>>>>>>
>>>>>> HTH
>>>>&g

Re: [R-br] Erro de memória importando objeto pequeno de SQL

[Leonard Assis via R-br]

O RODBC está sendo substituído pelo pacote odbc

On sex, 25 de ago de 2017 10:34 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do
Brasil <emmanuel.bra...@gmail.com> wrote:

> Ei pessoal,
>
> Obrigado pelas sugestões de todos. Não sei de onde veio essa informação de
> que RODBC estaria "deprecated" olhei no r-forge e parece estar ativo. A
> ultima atualização é do primeiro semestre de 2016.
>
> A saida do meu problema foi usando Rclient. Um R disponibilizado no sítio
> da microsoft, que já vem instalados com uma série de pacotes proprietários
> da Microsoft para integração com o SQL server 2016/2017. O nome do pacote
> é RevoScaleR.
>
> Ao invés de fazer ...
>
> > p <- "SELECT model FROM [tempo_permanencia_models] WHERE id_model = 1022"
> > mod.teste.peq <- sqlQuery(conn, p) # que retorna o erro de memória!
>
> Eu fiz ...
>
> mod.teste.peq  <- RxOdbcData(sqlQuery = "SELECT model FROM
> tempo_permanencia_models WHERE id_model=1018" ,connectionString = dbconn)
> mod.teste.peq  <- rxReadObject(mod.teste.peq , decompress = "none")
>
> Agora dá pra fazer as previsões novamente...
>
> Abraço forte a todos,
>
>
>
> Pedro Brasil
>
> Em 2 de agosto de 2017 15:20, Leonard Assis via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
>> RSQLServer não é boa alternativa, não sofre manutenção a tempos e depende
>> de Java na máquina. Sugiro o pacote odbc.
>>
>> SQL Server é mestre em dar problema no R comigo, mas o problema é na
>> autenticação.
>>
>> Em 1 de ago de 2017 9:14 AM, "Zhu Sha Zang via R-br" <
>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>>
>>> Parece que RODBC está "deprecated", tente usar o pacote RSQLServer.
>>>
>>>
>>> Atenciosamente
>>>
>>> On 07/31/2017 01:53 PM, Cesar Rabak via R-br wrote:
>>>
>>> Correto Pedro!
>>>
>>> Contudo, não entendo porque. . .
>>>
>>> Minha forma de atacar esse problema seria mandar os dados para o BD por
>>> outra maneira (que ñ via R) e tentar conectar apenas para puxar os dados:
>>> aí a gente vê se é na criação do BD via R que ele deixa em aberto um
>>> tamanho default muito grande ou se é a chamada que por alguma coincidência
>>> cria um default exigindo tanta memória (embora nos OSs modernos isso não
>>> deveria gerar problema porque existem os gerenciadores de memória virtual).
>>>
>>> HTH
>>> --
>>> Cesar Rabak
>>>
>>>
>>> 2017-07-31 10:32 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
>>> <emmanuel.bra...@gmail.com>:
>>>
>>>> Cesar,
>>>>
>>>> A função RODBC::sqlQuery não tem exemplo, mas já usei diversas vezes
>>>> com outros scripts e funciona. Esse problema está acontecendo somente no
>>>> exemplo dessa conexão em específico. Então estou entendendo a partir de
>>>> agora que  alguma configuração da conexão está pedindo pra reservar memória
>>>> mais do que o a máquina possui.
>>>>
>>>> Pedro Brasil
>>>>
>>>> Em 29 de julho de 2017 20:45, Cesar Rabak <cesar.ra...@gmail.com>
>>>> escreveu:
>>>>
>>>>> Pedro,
>>>>>
>>>>> Calloc é uma chamada "primitiva" para o R, uma função da biblioteca C
>>>>> e é uma função feita para "alocar" (reservar) memória e zerá-la.
>>>>>
>>>>> O estranho, para mim, é a tentativa do aplicativo de reservar *tanta* 
>>>>> memória
>>>>> assim na chamada da função do R.
>>>>>
>>>>> Essa função sqlQuery() pode ser testada fazendo:
>>>>>
>>>>> > example(sqlQuery)
>>>>>
>>>>> ?
>>>>>
>>>>> Se o exemplo do próprio pacote funcionar, aí teremos que fazer uma
>>>>> busca para ver de onde vem esse comportamento.
>>>>>
>>>>> HTH
>>>>> --
>>>>> Cesar Rabak
>>>>>
>>>>>
>>>>>
>>>>>
>>>>> 2017-07-28 17:12 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do
>>>>> Brasil <emmanuel.bra...@gmail.com>:
>>>>>
>>>>>> Ei Cesar,
>>>>>>
>>>>>> Eu tenho pouco familiaridade com SQL, e o amigo da TI que tem e faz
>>>>>> manutenção do servidor diz que o erro é na minha estação com R. Eu acho 
>>>>>> que
>>>&

Re: [R-br] Dúvidas

[Leonard Assis via R-br]

O que voce entende por "ler no R"?

Em 22 de ago de 2017 8:03 PM, "Rosane Viana via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Prezados Colegas,
>
> Boa noite!
>
>
>
> Para ler no software R um conjunto de dados espaciais que variam no tempo
>  é necessário um comando específico? Caso afirmativo, qual é o comando?
>
>
>
> Desde já agradeço,
>
> Rosane Viana
>
>
>
>
>
>
>
> Enviado do Email  para
> Windows 10
>
>
>
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> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Teste t para amostras independentes

[Leonard Assis via R-br]

Acredito não ser o escopo desta lista, mas:
É meio questão de logica, pois Se eu tenho 2 amostras a ser  comparadas e
uma tem distribuição diferente da outra, não faz sentido algum sequer
comparar um com outro, pois são de naturezas diferentes

Em 22 de ago de 2017 2:02 PM, "ana paula coelho madeira via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Prezados colegas ,
>
>
> Boa tarde! Preciso de uma ajuda no que se refere ao teste de comparação de
> médias de duas amostras.
>
> Tenho duas amostras  independentes.  Sei que para normalidade em ambas as
> amostras posso usar o t e se não for normal, uso não paramétrica.  Mas como
> proceder diante ao fato de uma amostra ter distribuição normal e a outra
> não.
>
> Desde já agradeço
>
> Ana Paula
>
>
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] reshape

[Leonard Assis via R-br]

Antônio,

No subset, onde você informou variable==c("ninfa","pulpa"), tende a dar
muito errado. O que este trecho está falando é "selecione todas as linhas
onde variable seja igual a o conteúdo após o símbolo '=='".

Pelo que eu entendi de seu desejo, é que você está querendo é "selecionar
todas as linhas onde variable contenha 'ninfa' OU 'pulpa'".

Existem varias construções lógicas que retornam de maneira correta, o que
você supostamente deseja. A que menos dá erro de avaliação é a construção
semelhante ao que fazemos quando usamos a instrução 'for', que seria usar
variable %in% c('ninfa','pulpa').

Leonard


Em 16 de ago de 2017 2:12 PM, "Antonio Moita via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

# Suponha o sequinte experimento em blocos ao acaso
# com tamanho da parcela experimental de 4 plantas
# no qual se conta o número pulpas ninfas e ovos.

# GOSTARIA DE OBTER O CONJUNTO DE DADOS QUE FOSSE A SOMA DE PLANTAS POR
CULTIVAR BLOCOS,
# QUANDO USO TODO CONJUNTO DE DADOS FUNCIONA BEM



require(reshape)


x<-factor(LETTERS[1:3])
cultivar<-rep(x, each=6)
bloco<-rep(1:2,each=3)
planta<-rep(1:3)

ninfa<-c(0,0,0,1,1,1,0,0,0,1,2,3,0,1,2,0,0,1)
pulpa<-c(1,0,1,1,0,1,0,0,0,0,0,0,0,2,1,0,0,4)
ovos<-c(2,2,0,3,0,0,0,0,4,0,0,0,0,2,0,0,0,0)

df<-data.frame(cultivar, bloco, planta, ninfa, pulpa, ovos)


df.m<-melt(df, id=c("cultivar","bloco","planta"))
df.m

df.c<-cast(df.m, cultivar + bloco ~ variable,   sum,   na.rm=TRUE )
df.c

# MAS QUANDO SELECIONO SÓ UMA PARTE
#   OS VALORES NÃO BATEM COM O QUADRO ANTERIOR, ALGUEM SABERIA EXPLICAR

df.c1<-cast(df.m, cultivar + bloco ~ variable,
subset=variable==c("ninfa","pulpa"),
sum)
df.c1

# a SOMA DE ninfa e pulpa tambem esta errada
df.c0<-cast(df.m, cultivar + bloco ~ ., subset=variable==c("ninfa","pulpa"),
sum)
df.c0


Att
Antonio W Moita
Embrapa Hortaliças

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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Erro de memória importando objeto pequeno de SQL

[Leonard Assis via R-br]

RSQLServer não é boa alternativa, não sofre manutenção a tempos e depende
de Java na máquina. Sugiro o pacote odbc.

SQL Server é mestre em dar problema no R comigo, mas o problema é na
autenticação.

Em 1 de ago de 2017 9:14 AM, "Zhu Sha Zang via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Parece que RODBC está "deprecated", tente usar o pacote RSQLServer.
>
>
> Atenciosamente
>
> On 07/31/2017 01:53 PM, Cesar Rabak via R-br wrote:
>
> Correto Pedro!
>
> Contudo, não entendo porque. . .
>
> Minha forma de atacar esse problema seria mandar os dados para o BD por
> outra maneira (que ñ via R) e tentar conectar apenas para puxar os dados:
> aí a gente vê se é na criação do BD via R que ele deixa em aberto um
> tamanho default muito grande ou se é a chamada que por alguma coincidência
> cria um default exigindo tanta memória (embora nos OSs modernos isso não
> deveria gerar problema porque existem os gerenciadores de memória virtual).
>
> HTH
> --
> Cesar Rabak
>
>
> 2017-07-31 10:32 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil <
> emmanuel.bra...@gmail.com>:
>
>> Cesar,
>>
>> A função RODBC::sqlQuery não tem exemplo, mas já usei diversas vezes com
>> outros scripts e funciona. Esse problema está acontecendo somente no
>> exemplo dessa conexão em específico. Então estou entendendo a partir de
>> agora que  alguma configuração da conexão está pedindo pra reservar memória
>> mais do que o a máquina possui.
>>
>> Pedro Brasil
>>
>> Em 29 de julho de 2017 20:45, Cesar Rabak 
>> escreveu:
>>
>>> Pedro,
>>>
>>> Calloc é uma chamada "primitiva" para o R, uma função da biblioteca C e
>>> é uma função feita para "alocar" (reservar) memória e zerá-la.
>>>
>>> O estranho, para mim, é a tentativa do aplicativo de reservar *tanta* 
>>> memória
>>> assim na chamada da função do R.
>>>
>>> Essa função sqlQuery() pode ser testada fazendo:
>>>
>>> > example(sqlQuery)
>>>
>>> ?
>>>
>>> Se o exemplo do próprio pacote funcionar, aí teremos que fazer uma busca
>>> para ver de onde vem esse comportamento.
>>>
>>> HTH
>>> --
>>> Cesar Rabak
>>>
>>>
>>>
>>>
>>> 2017-07-28 17:12 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
>>> :
>>>
 Ei Cesar,

 Eu tenho pouco familiaridade com SQL, e o amigo da TI que tem e faz
 manutenção do servidor diz que o erro é na minha estação com R. Eu acho que
 não, mas não tenho certeza porque eu não sei ao certo o que quer dizer esse
 erro. O que seria essa "Calloc"? É uma coisa natural do R?

 Abraço,

 Pedro Brasil

 Em 28 de julho de 2017 16:59, Cesar Rabak 
 escreveu:

> Pedro,
>
> Mesmo sem poder fazer uma tentativa, me parece que o erro é estranho
> demais para não ser notado: a chamada à primitiva da ling. C "calloc" está
> pedindo 200 Gbytes, que falha e me parece algo grande demais para um
> "default" da chamada a sqlQuery().
>
> HTH
>
>
> 2017-07-28 9:42 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
> via R-br :
>
>> Amigos de R,
>>
>> Estou envolvido numa tarefa que importo um banco SQL de um servidor,
>> faço uma modelagem, salvo o modelo no SQL através de uma seriliazação, e
>> depois carrego esse modelo do SQL para fazer previsões em novos dados.
>>
>> Estou seguindo um exemplo disponível nessa página:
>> https://docs.microsoft.com/pt-br/sql/advanced-analytics/tuto
>> rials/walkthrough-deploy-and-use-the-model
>>
>> Sei que esse exemplo não é reproduzível porque depende da conexão com
>> o servidor e credenciais que não posso divulgar. Mas se alguem já passou
>> por esse problema poderia pelo menos indicar aonde está o problema que 
>> não
>> estou sabendo identificar? Acho que muito provavelmente seria uma
>> configuração do SQL no servidor...
>>
>> library(RODBC)
>>
>> # define database connection string
>> dbconn <- 'Driver={SQL Server};Server=BLABLABLA;Datab
>> ase=BLABLABLA;Trusted_Connection=yes;'
>>
>> # define a connection
>> conn <- odbcDriverConnect(connection = dbconn)
>>
>> # Estou fazendo o exemplo com o objeto LETTERS só pra ter certeza que
>> é um objeto pequeno e que não deveria ser um problema de memória do R.
>> > LETTERS
>>  [1] "A" "B" "C" "D" "E" "F" "G" "H" "I" "J" "K" "L" "M" "N" "O" "P"
>> "Q" "R" "S" "T" "U" "V" "W" "X"
>> [25] "Y" "Z"
>> > teste_pequeno <- serialize(LETTERS, connection = NULL)
>> > teste_pequeno <- paste(teste_pequeno, collapse = "")
>>
>> # o EXEC PersistModel faz
>> # insert into [tempo_permanencia_models] (model, [description])
>> values (convert(varbinary(max),@m,2), @description)
>> # insere o modelo e uma descricao
>>
>> > p <- paste("EXEC PersistModel @m='", teste_pequeno,"', @description
>> = 'Teste de serialização objeto pequeno'", sep = 

Re: [R-br] Aggregate com função de dois argumentos

[Leonard Assis via R-br]

Cara, é embaçado resolver isto. Tive um problema uma vez com média
ponderada, resolvi mudando a logica para usar dplyr

Em 26 de jul de 2017 1:54 PM, "Marcelo Santana Camacho via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Bom dia,
>
> Alguém poderia me dar uma dica com esse problema?
>
> Estou tentando agregar um conjunto de dados, calculando o gini (pacote
> reldist), que recebe a variável principal e uma variável de ponderação - 
> gini(x,
> weights=rep(1,length=length(x))).
>
> Minha dificuldade é passar os dois argumentos para a função.
>
>
> library(reldist)
> ineq_df<-read.csv("amostra_input.csv")
> aggregate(c(qtd,renda)~cod_setor,data=ineq_df,gini)
>
>
>
>
> --
>
>
> *__Marcelo Santana Camacho*UNIFESSPA
>
> ___
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> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] tratamento de pontos discrepantes (pesos de bovinos)

[Leonard Assis via R-br]

Leia sobre medidas repetidas e modelos de efeitos mistos

Em 20 de jul de 2017 4:43 PM, "Adriele Giaretta Biase via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

>
> Boa tarde pessoal,
>
>
>
> estou trabalhando com um banco de dados que possuem várias coletas de
> pesos ao longo do tempo de vários bois.
>
> O meu objetivo é deixar um ajuste simples (pode até ser um modelo não-
> linear ao invés de uma regressão simples), porém, preciso remover os
> possíveis pontos discrepantes que atrapalham o ajuste, de forma recursiva
> (automática). O algoritmo será executado em vários momentos, enquanto
> acompanha o crescimento do animal. O mais importante  seria a remoção dos
> *outiliers* do banco de dados.  Eu criei um algoritmo para fazer isso.
>
> Gostaria de saber se alguém possui uma ideia melhor ou sugestão. Segue a
> função  criada.
>
>
> *OBS:* Muitos pontos discrepantes ainda ficam no banco, isso devido a um
> erro operacional da balança que pesa os animais. Precisaria de algo mais
> robusto para remover os pontos destoantes de forma recursiva para todos
> os animais.
>
>
>
>
> DADOS é um data.frame com as seguintes colunas: BRINCO (identificação ou
> numero do animal), DATA (dia da pesagem do peso do animal) e PESO (peso do
> animal correspondente ao dia)
>
>
>
> fit_linear <- function(DADOS){
>
> fit_aux = c()
>
> BRINCO = as.numeric(as.vector(levels( as.factor(DADOS[,"BRINCO"]
>
> pdf(file = "ajuste%03d.pdf")   # salvar os gráficos em pdf
>
> for (i in BRINCO){
>
> dados = subset(DADOS, BRINCO == i, selec =  c( BRINCO, DATA, PESO))
>
> j=1
>
> while (j<=30){
>
> dias =  as.vector(as.numeric(as.factor(dados[,"DATA"])))
>
> pesos = as.numeric(as.vector(dados$PESO))
>
> dad = cbind(dias, pesos)
>
> mod <- lm(pesos~dias)
>
> INFLUENTES = influence.measures(mod)
>
> dados_analise = cbind(INFLUENTES$is.inf, dad)
>
> dados_influentes = as.data.frame(dados_analise)
>
> colnames(dados_influentes) = c("x1", "x2", "x3", "x4", "x5", "x6", "DATA",
> "PESO")
>
> dados = subset(dados_influentes, (x1==FALSE & x2==FALSE & x3==FALSE &
> x4==FALSE & x5==FALSE & x6==FALSE),
>
>selec =  c(x1, x2, x3, x4, x5, x6, DATA, PESO))
>
> j = j+1
>
> }
>
> res <- residuals(mod)
>
> h <- hatvalues(mod)
>
> P = length(mod$coefficient); N=length(peso); P; N; hc<-3*P/N;hc
>
> limt <- list(c(DFB=2/sqrt(N),FDFits=2*sqrt(P/N),cov.r=3*P/N,
>
>  Cook=qf(0.5,2,8, lower.tail = TRUE, log.p = FALSE),hat=3*P/N))
>
> N=length(peso); P=length(mod$coefficient)
>
> rs <- rstudent(mod)
>
> h <- lm.influence(mod)$hat; lc <- 3*P/N
>
> minrs=min(min(rs),-3)
>
> maxrs=max(max(rs),3)
>
> ymin=minrs-.1
>
> ymax=maxrs+.1
>
> maxh=max(max(h),lc)
>
> minh=min(h)
>
> xmin=minh-.1
>
> xmax=maxh+.1
>
> par(mfrow=c(1,1))
>
> plot(c(xmin,xmax),c(ymin,ymax), type="n", xlab="h - leverage",
> ylab="RStudent", main= i)
>
> abline(h=-2.5, col="red")
>
> abline(h=2.5,col="red"); abline(v=lc, col="blue")
>
> points(h,rs)
>
> plot(dad,  main= i)
>
> abline(mod,lty=2)
>
> }
>
> dev.off()
>
> }
>
>
> Agradeço,
>
>
> --
> Adriele Giaretta Biase.
> Mestre em  Estatística e Experimentação Agropecuária - UFLA.
> Doutora em Estatística e Experimentação Agronômica - ESALQ/ USP
> Contato: (19) 98861-0619.
>
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] delineamento vs repetição

[Leonard Assis via R-br]

As mensuracose são repetições da mesma medida ou métricas diferentes?

O que eu chamo de "repetições da mesma medida" é você medir em t=0 é ir
repetindo a medida de tempos em tempos.

Métricas diferentes seria medir coisas diferentes ou, utilizando maneutmras
diferentes de medir.

O primeiro caso é um caso clássico de medidas repetidas. O segundo demanda
melhor entendimento do problema, pois pode ou não se enquadrar em MANOVA

Em 10 de jul de 2017 7:34 AM, "Rafael Tieppo via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

>
> Após consultar algumas referências (livros, apostila, papers, etc), não
> consegui a chegar a uma conclusão.
>
> O que encontrei de caso mais próximo foi uma solução do Walmes, que é o
> que tenho em mente até o momento.
>
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Repeticao-dentro-da-
> parcela-td4661875.html#a4661882
>
> Para acabar com as dúvidas, por favor, se alguém puder ajudar, segue a
> situação:
>
> No planejamento do experimento a ser realizado pretende-se verificar o
> espaçamento entre plantas em função do tipo de dosador de semente.
>
> - Var Dependente: espaçamento entre plantas (quantitativo)
> - Var Independente: tipo de dosador  (qualitativo)
>
> Pretende-se usar DBC. A ideia é utilizar 4 blocos, com 4 tratamentos
> (dosadores). Sendo assim, cada bloco teria quatro parcelas (uma com cada
> tipo de sistema dosador), totalizando 4 repetições.
>
> Contudo, em cada parcela não pretende-se realizar apenas uma mensuração de
> distância entre plantas, deseja-se realizar pelo menos 10.
>
> O que gera minha dúvida são dois casos:
>
> CASO 1
>
> O número de amostras é: 4 blocos * 4 tratamentos * 10 amostras (por
> parcela) = 160
>
>
> CASO 2
>
> Das 10 mensurações realizadas em uma parcela, calcula-se a média para a
> obtenção de uma única amostra por parcela, dessa forma tem-se:
>
> O número de amostras é 4 blocos * 4 tratamentos  1 amostra (por parcela)=
> 16
>
> obs: O CASO 2 é o mais comum em alguns trabalhos, contudo não estou
> convicto que é a melhor opção.
> ###
>
> Perguntas:
> Há algum CASO correto?
> Se sim, em algum dos casos pode-se assumir como DBC ou DQL (quadrado
> latino)?
> Há outro delineamento que se enquadre melhor à situação?
>
> Obrigado.
>  Rafael Tieppo
>
>
> ___
> R-br mailing list
> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
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Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo 
m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Ajuda com BoxPlot

[Leonard Assis via R-br]

Execute normalmente, sem o png(...) É sem o dev.off()
Observe o que acontece.

Acredito que você verá, com isto, o que está acontecendo de errado.

Leonard

Em 10 de jul de 2017 11:17 AM, "Yury Duarte via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Obrigado Walmes.
>
> Esqueci de anexar o arquivo com a base de dados para rodar o script. Acabo
> de anexar nessa mensagem.
> Tentei reproduzir o passo para salvar o arquivo em formato png, mas em
> todos os testes o arquivo saia em branco, com a informação de que é
> impossível de ser reproduzida a imagem.
>
> Mais uma vez, agradeço pela ajuda!
>
> rm(list = ls())
> setwd('C:\\Users\\Yury\\Desktop\\Mestrado\\1_TESE\\
> Model_Data\\Maize\\ENSEMBLE\\Simulacoes\\PA\\50')
>
> a = read.table('sdesiderio.txt', header = T, sep = '\t')
> media = matrix(NA, nrow = 36, ncol = 4)
> colnames(media) = c('Desv.Pad', 'Media', 'M.mais', 'M.menos')
>
> for(i in 1:36){
>   d = sd(a[i,1:(ncol(a)-1)])
>   media[i,1] = d
>   m = rowMeans(a, na.rm = T, dims = 1)
>   media[i,2] = m[i]
>   media[i,3] = media[i,2]+media[i,1]
>   media[i,4] = media[i,2]-media[i,1]
>   ifelse(media[i,]<0, 0, media[i,])
> }
>
> a.box = t(a)
> colnames(a.box) = c('J1','J2','J3','F1','F2','
> F3','M1','M2','M3','A1','A2','A3','M1','M2','M3',
> 'J1','J2','J3','J1','J2','J3',
> 'A1','A2','A3','S1','S2','S3','O1','O2','O3',
> 'N1','N2','N3','D1','D2','D3')
>
> png("grafico-b1.png", width = 1200, height = 900, res = 196)
> b1 = boxplot(a.box, las = 1, xlab = 'Semeadura', ylab = 'kg/ha', cex=0.5,
> pch=16)
> title('Variação de Ya de acordo com a data de semeadura')
> dev.off()
>
> Yury Duarte
> Engenheiro Agrônomo - ESALQ/USP
>
> Em 10 de julho de 2017 10:57, Walmes Zeviani 
> escreveu:
>
>> Prezado,
>>
>> O seu exemplo não é reproduzível. Todavia, se entendi corretamente sua
>> dúvida, o código abaixo indica como usar as funções pdf() e png() para
>> salvar os gráficos na dimensão que você desejar.
>>
>> # Conjunto de dados interno do R.
>> str(iris)
>>
>> pdf("grafico1.pdf", width = 7, height = 6)
>> boxplot(Sepal.Length ~ Species, data = iris)
>> dev.off()
>>
>> png("grafico2.png", width = 1200, height = 900, res = 196)
>> boxplot(Sepal.Length ~ Species, data = iris)
>> dev.off()
>>
>> À disposição.
>> Walmes.
>> ​
>>
>
>
> ___
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> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Duvida estatística com R

[Leonard Assis via R-br]

Não entendi o que você quer fazer.

Em 3 de jul de 2017 12:03 PM, "Fernando Gama via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Pessoal estou com uma duvida, estou com dificuldades de recordar, tenho
> duas amostras A e B, para ilustrar:
>
> A <- length(216) # o tamanho é variável para cada laço for
> B <- length(87)
>
> Suponhamos que eu tenha um sample
>
> sample <- length(15)
>
> Gostaria de obter a proporção de acerto considerando o tamanho das amostra
> B, ou seja:
>
> sample (15) / B (216)  = 0.1724.
>
> Porém, talvez seja interessante (ou correto) levar em consideração o
> tamanho de A já que A varia de tamanho. E eis que surge a minha dúvida, se
> eu considerar o tamanho de A para medir a proporção a formula seria:
>
> sample (15) / A (216) - B(87) = 0.1162.
>
> Correto? Ou teria que considerar apenas a amostra B mesmo?
>
> Agradeço a ajuda.
>
> --
> Att,
>
> | Fernando Gama da Mata |
> | Database Specialist | Master's Degree UFPA |
>
> | Contacts: +55 91 99150 0365 <(91)%2099150-0365> |
> f.fabiogam...@gmail.com |
>
>
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] RES: Dúvida sobre pesos amostrais[Resolvido]

[Leonard Assis via R-br]

Complementando meus colegas:

Uma boa forma de você "extrapolar", dado que todas as recomendações foram
seguidas, seria utilizar o pacote survey e replicar o desenho amostral.

Lembrando que o conceito de desenho amostral é bem similar ao conceito de
"desenho de experimentos". Para se "extrapolar", precisa conhecer bem como
foi todo o processo amostral, assim como conhecer as probabilidades de
inclusão na amostra de cada uma das observações.
Sabendo isto, nada que um as.svydesign é um svytotal não resolvam

Leonard

Em 30 de jun de 2017 10:21 PM, "Carlos Andrade via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Cesar,
>
> Obrigado pelo esclarecimento. A minha dúvida está resolvida.
>
> Em 30 de junho de 2017 21:28, Cesar Rabak via R-br
>  escreveu:
> > Carlos,
> >
> > Essa dúvida não exatamente pertinente ao R, mas sim uma dúvida de
> > Estatística Básica.
> >
> > No seu caso você obteve uma proporção da preferência por uma variedade de
> > serviço.
> >
> > Não existe o conceito de "extrapolação" em amostragem, mas sim a questão
> do
> > intervalo de confiança -- IC dessa estimativa vis a vis com a proporção
> > "real" da população sob estudo¹.
> >
> > Como a sua amostra é relativamente grande com relação à população, o IC
> > (95%) é relativamente estreito (12,0; 19,8). A forma de calcular esse IC
> não
> > é única, razão pela qual pode haver ainda outros ICs dependendo dos
> costumes
> > no domínio do problema da ciência que você está praticando.
> >
> > No caso das suas questões recolocadas, a sua maneira de dizer que 962
> com IC
> > 95% (727 a 1199) da população têm essa opinião.
> >
> > A interpretação do significado desse intervalo e demais questões são
> > extremamente fora de tópico aqui, por isso se você tiver dúvidas
> recomendo
> > que consulte um estatístico na sua instituição, ou encete o resto desta
> > discução via e-mail em privado².
> >
> > Quanto à questão dos pesos ela só entraria em discussão caso a amostragem
> > não for totalmente aleatória em toda a população, tópico esse que
> demandaria
> > também consulta a material mais avançado em Amostragem, ou uma
> consultoria
> > com um estatístico aí na sua instituição.
> >
> > HTH
> > --
> > Cesar Rabak
> >
> >
> > [1] Quando ela é calculada e apresentada seguindo certo formalismos ela é
> > denominada "margem de erro" (sim a famosa dos levantamentos de intenção
> de
> > votos!).
> >
> > [2] Você pode também colocar a sua questão no SE de estatística onde a
> > questão seria mais bem vinda.
> >
> >
> >
> > 2017-06-30 13:15 GMT-03:00 Carlos Andrade via R-br
> > :
> >>
> >> Agradeço a Rodrigo Campos e pjobenil pela colaboração.
> >> Então, considerando as premissas levantadas por vocês, posso
> >> seguramente aplicar o percentual da amostra na população.
> >> Desta forma, 16% (os 51 respondentes) podem ser aplicados aos 6055, e
> >> dizer que são 962 os que têm aquela opinião?
> >>
> >> Em 30 de junho de 2017 11:35, pjobenil--- via R-br
> >>  escreveu:
> >> > Carlos,
> >> >
> >> >
> >> >
> >> > Para os dados apresentados cabe no máximo calcular a margem de erro se
> >> > usou
> >> > alguma técnica probabilística para a seleção da amostra.
> >> >
> >> > Extrapolar os dados para a população ocorreria em dois casos:
> >> >
> >> > Existem segmentos nesta população que você não considerou quando
> >> > selecionou
> >> > os 361;
> >> > Os 6055 indivíduos formam um segmento de uma população maior.
> >> >
> >> > Nos dois casos sim você deve aplicar os pesos destes segmentos para o
> >> > calculo final do estimador.
> >> >
> >> >
> >> >
> >> > Atenciosamente
> >> >
> >> > Jobenil Júnior
> >> >
> >> >
> >> >
> >> >
> >> >
> >> > Enviado do Email para Windows 10
> >> >
> >> >
> >> >
> >> > De: Carlos Andrade via R-br
> >> > Enviado:quinta-feira, 29 de junho de 2017 18:42
> >> > Para: R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> >> > Assunto: [R-br] Dúvida sobre pesos amostrais
> >> >
> >> >
> >> >
> >> > Prezados amigos da lista.
> >> >
> >> >
> >> >
> >> > Desejo obter o esclarecimento de uma dúvida.
> >> >
> >> > De uma população de 6055 indivíduos foi obtida uma amostra de 321
> >> >
> >> > respondentes de um questionário.
> >> >
> >> > Na tabulação de uma das variáveis encontro que 51(15,9%) dos
> >> >
> >> > entrevistados prefere uma variedade de serviço.
> >> >
> >> > Dúvida: como faço para extrapolar este valor amostral para o
> >> >
> >> > correspondente do universo?
> >> >
> >> > É necessário usar pesos amostrais?
> >> >
> >> >
> >> >
> >> > Agradeço antecipadamente qualquer ajuda.
> >> >
> >> > --
> >> >
> >> > Atenciosamente,
> >> >
> >> >
> >> >
> >> > Prof. Carlos A. S. de Andrade
> >> >
> >> > LAPEA - Laboratório de Pesquisa em Economia Aplicada e Engenharia de
> >> > Produção
> >> >
> >> > Universidade Federal de Campina Grande.
> >> >
> >> > Centro de Humanidades
> >> >
> >> > Unidade Acadêmica de Economia
> >> >
> >> > ___
> >> >

Re: [R-br] Somas de Quadrados Tipo III

[Leonard Assis via R-br]

1. Somas de quadrados tipo I, II, III e etc não é terminologia da
Estatistica, sim de um software (SAS)

para calcular estás somas de quadrado, sugiro olhar o pacote "car". É bem
antigo, mas tem muita coisa referente a isto. Se não me engano, é a função
Anova (assim mesmo, com "A" maiusculo.)

Como planejamento de experimentos é algo que atualmente lido com pouca
frequência, é o máximo que posso fazer para te ajudar, sem entrar em um
ambiente que, hoje, precisaria ler um pouco para recapitular.



Em 21 de jun de 2017 4:23 PM, "Eduardo Bearzoti via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Bom dia, pessoal.
>
> Minha dúvida é particularmente sobre o cálculo de somas de quadrados tipo
> III (mas também do tipo II) no R com conjuntos de dados desbalanceados.
>
> Estou ciente da polêmica em torno do uso destas somas de quadrados na
> comunidade estatística, mas gostaria muito de poder calculá-las no R, e, a
> não ser que eu esteja enganado, nem sempre o R as calcula corretamente.
>
> Pesquisando na rede, descobri que em geral são apontadas duas maneiras de
> se calcular somas de quadrados tipo III no R: a) Utilizando a função
> drop1() em modelos ajustados com a especificação de contrastes contr.sum
> (ou contr.helmert), e b) utilizando a função Anova() (com "A" maiúsculo),
> do pacote car.
>
> Abaixo, eu apresento um exemplo simulado de um ensaio fatorial altamente
> desbalanceado, faltando várias combinações entre os níveis dos dois
> fatores. A interação entre eles, por exemplo, apresenta um único grau de
> liberdade, tamanho o desbalanceamento.
>
> dados <- data.frame(y=c(35.44627,43.43353,40.20125,38.1061,39.
> 96211,44.21636,19.78237,23.58636,31.73537,
>  36.49977,38.71573,41.00456,19.6787,16.43436,32.05407,33.
> 3784,18.58266,17.74051),
>  factorA=as.factor(c(2,2,4,4,4,4,6,6,6,6,6,6,8,8,8,8,10,10)),
>  factorB=as.factor(c(2,2,1.5,1.5,2.5,2.5,1,1,2,2,3,3,1.5,1.5,
> 2.5,2.5,2,2)))
>
> Tenho em mente o modelo contendo os fatores A e B, bem como sua interação.
>
> No SAS, utilizando o proc glm, obtenho as seguintes somas de quadrados
> tipo I, tipo II e tipo III:
>
> Source  DF   Type I SS
>
> factorA   4 964.4164933
> factorB   3 500.0771638
> factorA*factorB   1  68.7277880
>
> Source  DF  Type II SS
>
> factorA   3 954.6730970
> factorB   3 500.0771638
> factorA*factorB   1  68.7277880
>
> Source  DF Type III SS
>
> factorA   3 954.6730970
> factorB   3 500.0771638
> factorA*factorB   1  68.7277880
>
> Percebam que neste exemplo as somas de quadrados tipo II e III são iguais,
> pois as "caselas" apresentam o mesmo número de repetições (duas).
>
> No R, tentei reproduzir este resultado seguindo os dois procedimentos
> citados acima:
>
> 1) Utilizando a função drop1()
>
> > mod <- lm(y ~ factorA*factorB,
>   contrasts=list(factorA=contr.sum, factorB=contr.sum),
>   data=dados)
>
> > drop1(mod, ~.,test = "F")
> Single term deletions
>
> Model:
> y ~ factorA * factorB
> Df Sum of Sq RSSAIC F value  Pr(>F)
> 70.841 42.661
> factorA  0 0.000  70.841 42.661
> factorB  0 0.000  70.841 42.661
> factorA:factorB  168.728 139.569 52.867  8.7315 0.01609 *
> ---
> Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
>
> (apenas a soma de quadrados da interação foi calculada)
>
>
> 2) Utilizando car::Anova()
>
> > mod <- lm(y ~ factorA*factorB, data=dados)
> > library(car)
> > Anova(mod,type = "II")
> Anova Table (Type II tests)
>
> Response: y
>  Sum Sq Df F valuePr(>F)
> factorA 1284.10  4 40.7845 8.995e-06 ***
> factorB  500.08  3 21.1774 0.0002047 ***
> factorA:factorB   68.73  1  8.7315 0.0160919 *
> Residuals 70.84  9
> ---
> Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
> > Anova(mod,type = "III")
> Error in Anova.III.lm(mod, error, singular.ok = singular.ok, ...) :
>   there are aliased coefficients in the model
>
> (soma de quadrados tipo II calculada errada para o fator A, e tipo III não
> calculadas)
>
> Ou seja, não consegui reproduzir nem as somas de quadrados tipo III nem as
> do tipo II, por nenhum dos dois procedimentos sugeridos na rede.
>
> Estou utilizando:
> > sessionInfo()
> R version 3.4.0 (2017-04-21)
> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
> Running under: Ubuntu 14.04.5 LTS
> (...)
> other attached packages:
> [1] car_2.1-4
>
>
>
> Eu estaria fazendo alguma coisa equivocada? Qualquer observação, sugestão,
> ou indicação de alguma maneira alternativa para cálculo das somas de
> quadrados tipo III no R será muito bem vinda.
>
> Abs,
>
> Eduardo Bearzoti
> (UFOP)
>
>
>
> ___
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> 

Re: [R-br] erro ao rodar o modelo de regressão logística no R

[Leonard Assis via R-br]

José,

quanto ao seu problema:

é complicado te ajudar apenas com esta mensagem e sem um código que
possamos reproduzir. qualquer coisa que eu responder, baseado apenas no
warning, será um chute.

Quanto ao numero de destinatários:

acho desnecessário expor esta quantidade de gente que você colocou na
conversa. acredito que possa prejudicar até a intenção de respostas.Eu
mesmo recebi esta pergunta em 4 listas diferentes.

Leonard

lmassis  yahoo  com  br
assis.leonard  gmail  com

2017-06-09 5:10 GMT-03:00 Jose Fernandes :

> Olá a todos,
>
> Estou a rodar um modelo de regressão logística no R e obtive o seguinte
> erro.
> There were 11 warnings (use warnings() to see them)
> glm.fit: fitted probabilities numerically 0 or 1 occurred
>
> Bom final de semana a todos,
>
> José Moniz Fernandes
>
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Rstudio - Nova versão

[Leonard Assis via R-br]

Problemas semelhantes a este que já tive com o RStudio só foram referentes
ao aplicativo não achar o R.
Na página do Estúdio tem um macete para resolver isto.

Outro problema "aleatório" que dá é quando eu abro um script muito longo
(tenho Scripts com mais de 2000 linhas) e o editor fica meio lento.
O resto, comportamento normal de um aplicativo feito em Java

Em 31 de mai de 2017 6:51 AM, "Marco Nunes via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Olá André.
>
> Tenho esse problema, mas relacioando ao windows 10 depois que atualizei ...
>
> Uso o ubuntu 16.04 sem problemas.
>
> Marco
>
>
> --
> *De:* R-br  em nome de Andre Oliveira
> via R-br 
> *Enviado:* quarta-feira, 31 de maio de 2017 06:31
> *Para:* a lista Brasileira oficial de discussão do programa R.
> *Assunto:* [R-br] Rstudio - Nova versão
>
> Bom dia,
> algo estranho ocorre por aqui. Desde quando atualizei para  a nova versão
> do Rstudio ocorre um problema para abrir o mesmo, carrega carrega e não
> abri o editor! Alguém passa pelo mesmo problema ou alguém sabe o que pode
> ser? Estou com Ubuntu 14.04!
>
> André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística
> aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito
> Santo.  IFES
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> código mínimo reproduzível.
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Geostatistica

[Leonard Assis via R-br]

Bruce,

Não entendi especificamente qual sua dúvida, nem qual a relação desta
dúvida (cálculo de probabilidades) com o pacote geoR, ou se é uma dúvida
geral, etc.

Em 20 de mai de 2017 1:19 PM, "Bruce Kelly via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

Boa tarde listeiros (as)


Minha duvida vai além do pacote geoR, é mais estatística do software,as
segue as duas perguntas:

Eu tenho o seguinte problema condicional. Onde os quatro eventos não são
independentes.




1) qual script ou código no geoR para solução?

2) solução analítica?


Muito obrigado a todos, bom final de semana.




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mínimo reproduzível.
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Ajuda com Erro em DataFrame

[Leonard Assis via R-br]

Olhe o comando fortify (acho que escreve assim)

Em 13 de mai de 2017 11:11 AM, "Walmes Zeviani via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> O seu banco tem mais linhas do que o vetor de valores ajustados. Se o seu
> banco tem missing nas variáveis envolvidas, a glm() vai remover tais linhas
> e por isso o ajustado tenha tamanho menor, pois vai corresponder apenas aos
> registros caso completo. Uma sugestão é: reduza o banco de dados para o
> banco caso completo (sem NA nas variáveis usadas no modelo) que aí os
> tamanhos serão iguais.
>
> À disposição.
> Walmes.
> ​
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] pacote ribge

[Leonard Assis via R-br]

Telmo,

Ótima iniciativa.
Ainda não baixei o pacote, pois estou iniciando um novo projeto e não
pretendo, por hora, fazer testes. Tão logo esteja em uma fase mais estável
deste projeto, vou começar a testar (e ser chato).

Leonard

Em sex, 17 de fev de 2017 09:30, Leonard Assis 
escreveu:

> Instale o package DBI antes de instalar o pacote sugerido.
>
> Em qui, 16 de fev de 2017 22:39, Mauro Sznelwar via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
>> Não consegui instalar o ribge, veja o que aconteceu abaixo, estou usando
>> o Windows 7 e o R3.3
>>
>> * installing *source* package 'ribge' ...
>> ** R
>> ** data
>> *** moving datasets to lazyload DB
>> ** preparing package for lazy loading
>> Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck =
>> vI[[i]]) :
>>   there is no package called 'DBI'
>> ERROR: lazy loading failed for package 'ribge'
>> * removing 'C:/Users/Mauro/Documents/R/win-library/3.3/ribge'
>> Erro: Command failed (1)
>>
>>
>> Pessoal,
>>
>> Criei um pacote, ribge , para
>> consulta a algumas bases do IBGE.
>>
>> Funcionalidades/consultas atuais:
>>
>> - populacao dos municipios: 2000-2016
>> - pip dos municipíos
>> - area dos municípios
>> - indices de preços: INPC, IPCA, SINAPI, deflator PIB
>> - consulta às series de 
>> - mapeamento dos códigos de municipios IBGE-TSE
>>
>> Espero que possa ser útil a alguns por aqui. Críticas e sugestões (e
>> pull requests) são bem-vindos ;)
>>
>> Att,
>> Telmo
>>
>> ___
>> R-br mailing list
>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>
>
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Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo 
m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] pacote ribge

[Leonard Assis via R-br]

Instale o package DBI antes de instalar o pacote sugerido.

Em qui, 16 de fev de 2017 22:39, Mauro Sznelwar via R-br <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Não consegui instalar o ribge, veja o que aconteceu abaixo, estou usando o
> Windows 7 e o R3.3
>
> * installing *source* package 'ribge' ...
> ** R
> ** data
> *** moving datasets to lazyload DB
> ** preparing package for lazy loading
> Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]])
> :
>   there is no package called 'DBI'
> ERROR: lazy loading failed for package 'ribge'
> * removing 'C:/Users/Mauro/Documents/R/win-library/3.3/ribge'
> Erro: Command failed (1)
>
>
> Pessoal,
>
> Criei um pacote, ribge , para
> consulta a algumas bases do IBGE.
>
> Funcionalidades/consultas atuais:
>
> - populacao dos municipios: 2000-2016
> - pip dos municipíos
> - area dos municípios
> - indices de preços: INPC, IPCA, SINAPI, deflator PIB
> - consulta às series de 
> - mapeamento dos códigos de municipios IBGE-TSE
>
> Espero que possa ser útil a alguns por aqui. Críticas e sugestões (e
> pull requests) são bem-vindos ;)
>
> Att,
> Telmo
>
> ___
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> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Fatorial incompleto

[Leonard Assis via R-br]

https://cran.r-project.org/web/packages/AlgDesign/index.html

Em ter, 14 de fev de 2017 22:16, Cesar Rabak <cesar.ra...@gmail.com>
escreveu:

> https://cran.r-project.org/web/views/ExperimentalDesign.html
>
> HTH
> --
> Cesar Rabak
>
> 2017-02-14 19:46 GMT-02:00 Tropidurus Torquatus <t.torqua...@gmail.com>:
>
> Aproveitando a discussão… quais são as principais ferramentas para fazer
> um planejamento fatorial no R?
>
> Em 14 de fev de 2017, à(s) 18:17, Leonard Assis via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
> Lembrando que planejamento de experimento é uma coisa planejada, você
> desenha como vai ser, não espera acontecer para ver onde encaixa.
>
> O mesmo vale para amostragem
>
> Em seg, 13 de fev de 2017 18:29, Cesar Rabak via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
> Fernando,
>
> O conceito de "fatorial incompleto" vem do desenho do experimento não do
> acidente, como é o seu caso.
>
> Outrossim, você tem tão poucos casos para a IDADE==1, que comparar esses
> resultados com as outras idades pode ser pouco producente.
>
> Qual seria a variável de interesse na comparação e qual forma de análise
> você estava contemplando?
>
> --
> Cesar Rabak
>
>
> 2017-02-13 11:52 GMT-02:00 Fernando Antonio de souza via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:
>
> Caros colegas
>
> Possuo um banco de dados de um experimento em que tenho os fatores
> experimentais a linhagem (LG) e Idade (faixa de idade). acontece que não
> possuo todas as combinações dos níveis dos fatores, como vocês podem ver na
> tabela abaixo.
> Isso seria um fatorial incompleto. Eu queria aproveitar os dados que tenho
> das linhagens na idade 1 (L03,L415,L65)  e compará-las com as demais idades
> e linhagens.
> Como eu poderia proceder?
>
> DADOS<-read.csv("
> https://www.dropbox.com/s/yvd9cgz55462yeo/CAMILA.csv?raw=1",head=TRUE)
>
> DADOS<-transform(DADOS,LG=factor(LG),IDADE=factor(IDADE))
>
> ℝ> table(CAMILA[,c(1,4)])
>   IDADE
> LG123
>   L02 0  415 1258
>   L0310  771 1052
>   L27 0   98  184
>   L415   31  181 1038
>   L62 0  163  570
>   L65 8  389 1226
>
>
> --
> =
> Fernando Souza
> Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal
> Celular: (31)99796-8781 (Vivo)
> E-mail:nandodeso...@gmail.com <e-mail%3anandodeso...@gmail.com>
> Lattes: http://lattes.cnpq.br/6519538815038307
> Blog: https://producaoanimalcomr.wordpress.com/
> ==
>
> ___
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Re: [R-br] Fatorial incompleto

[Leonard Assis via R-br]

Lembrando que planejamento de experimento é uma coisa planejada, você
desenha como vai ser, não espera acontecer para ver onde encaixa.

O mesmo vale para amostragem

Em seg, 13 de fev de 2017 18:29, Cesar Rabak via R-br <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Fernando,
>
> O conceito de "fatorial incompleto" vem do desenho do experimento não do
> acidente, como é o seu caso.
>
> Outrossim, você tem tão poucos casos para a IDADE==1, que comparar esses
> resultados com as outras idades pode ser pouco producente.
>
> Qual seria a variável de interesse na comparação e qual forma de análise
> você estava contemplando?
>
> --
> Cesar Rabak
>
>
> 2017-02-13 11:52 GMT-02:00 Fernando Antonio de souza via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:
>
> Caros colegas
>
> Possuo um banco de dados de um experimento em que tenho os fatores
> experimentais a linhagem (LG) e Idade (faixa de idade). acontece que não
> possuo todas as combinações dos níveis dos fatores, como vocês podem ver na
> tabela abaixo.
> Isso seria um fatorial incompleto. Eu queria aproveitar os dados que tenho
> das linhagens na idade 1 (L03,L415,L65)  e compará-las com as demais idades
> e linhagens.
> Como eu poderia proceder?
>
> DADOS<-read.csv("
> https://www.dropbox.com/s/yvd9cgz55462yeo/CAMILA.csv?raw=1",head=TRUE)
>
> DADOS<-transform(DADOS,LG=factor(LG),IDADE=factor(IDADE))
>
> ℝ> table(CAMILA[,c(1,4)])
>   IDADE
> LG123
>   L02 0  415 1258
>   L0310  771 1052
>   L27 0   98  184
>   L415   31  181 1038
>   L62 0  163  570
>   L65 8  389 1226
>
>
> --
> =
> Fernando Souza
> Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal
> Celular: (31)99796-8781 (Vivo)
> E-mail:nandodeso...@gmail.com 
> Lattes: http://lattes.cnpq.br/6519538815038307
> Blog: https://producaoanimalcomr.wordpress.com/
> ==
>
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Distribuição para regressão de resposta binária

[Leonard Assis via R-br]

Tem ruído aí nesta explicação. Na verdade, o que o "epidemiologista"
alegou, não me convenceu.


Em 7 de fev de 2017 9:14 PM, "Marcos Bissoli via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Prezados,
>
> De antemão peço desculpas se desvio o tópico da lista. Mas creio que o
> tema da mensagem é minimamente transversal aos aqui tratados.
>
> Tenho uma variável resposta binária. Como a frequência da resposta é alta
> (38,11%), teóricos da Estatística aplicada à Epidemiologia sugerem que não
> seja usada uma regressão logística. Neste caso (de alta prevalência do
> desfecho), a primeira opção deveria ser uma log-binomial. Mas (e isso não é
> raro de ocorrer), minha log-binomial não apresentou convergência.
>
> Quando não há convergência, os teóricos sugerem uma regressão de Poisson
> com variância robusta. Entretanto, como meus dados sugerem subdispersão,
> optei por um modelo de quasi-poisson. Isso já deu certo em outras análises
> que fiz para terceiros. Inclusive, tenho conseguido adaptar a variância
> robusta ao modelo de quasi-poisson. Mas justamente agora, com os dados de
> minha tese...
>
> O diagnóstico visual está, ao meu ver, péssimo, para ajuste. A imagem
> anexa é do modelo de quasi-poisson. Mas experimentei todos os acima citados
> (logística e Poisson) e o gráfico não diferiu muito.
>
> [image: Imagem inline 1]
>
> A dúvida é... Há alguma outra alternativa de técnica de regressão que eu
> poderia tentar? Minhas variáveis explicativas são diversas, em quantidade e
> tipo (há contínuas, ordinais e binárias). Ou será (embora eu ache pouco
> provável) que este gráfico não significa um grande incômodo?
>
> Fiz o teste de qui-quadrado da deviance residual e estranhamente o valor p
> está resultando em 1, tanto para Poisson quanto para quasi-Poisson. Um
> outro fato estranho é o pseudo R² de Nagelkerke ter acusado 20%: todas as
> outras minhas variáveis resposta não passaram de 12%. Não sei se é correto
> (consultei bibliografia que sugeria isso para a regressão logística), mas
> apliquei um teste de Hosmer e Lemeshow e ele acusou um bom ajuste do
> modelo, também (p = 0,2718). Até uma curva de ROC eu fiz e a área está
> grande no gráfico (mais uma técnica que não sei se deve ser aplicada além
> da regressão logística,).
>
> Seguem alguns resultados, caso possa ajudar em algo.
>
> Desde já agradeço qualquer comentário. E reforço minhas desculpas caso eu
> tenha desviado do tópico além do esperado, e desde já acato qualquer
> negativa em prosseguir o debate. Nesse caso, se possível, aceitaria
> sugestões de boas listas para debates nesse nível onde eu pudesse me
> inscrever.
>
> Há braços,
>
> Marcos Bissoli
> Faculdade de Nutrição
> Unifal-MG
>
> > Mod1 <- glm(Tabagismo~.,data = TabModelagem,family = quasipoisson)> 
> > summary(Mod1)
> Call:
> glm(formula = Tabagismo ~ ., family = quasipoisson, data = TabModelagem)
>
> Deviance Residuals:
> Min   1Q   Median   3Q  Max
> -1.4867  -0.7821  -0.5889   0.5349   1.6624
>
> Coefficients:
>   Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
> (Intercept) -1.245e+00  8.738e-01  -1.424 0.154644
> factor.SexoDic.1 5.800e-01  8.273e-02   7.011 4.11e-12 ***
> factor.Branca.1 -8.332e-01  7.836e-01  -1.063 0.287863
> factor.Negra.1  -8.210e-01  7.987e-01  -1.028 0.304185
> factor.Parda.1  -9.009e-01  7.863e-01  -1.146 0.252163
> factor.Amarela.1-1.089e+00  8.481e-01  -1.284 0.199466
> factor.SemReligiao.1-9.670e-02  1.888e-01  -0.512 0.608566
> factor.Catolica.1   -4.813e-01  1.862e-01  -2.585 0.009863 **
> factor.Espirita.1   -1.235e-01  2.181e-01  -0.566 0.571230
> factor.Evangelica.1 -9.177e-01  2.429e-01  -3.779 0.000166 ***
> factor.AfroBrasileira.1  6.068e-01  4.303e-01   1.410 0.158794
> factor.Turno.1   1.534e-03  1.034e-01   0.015 0.988169
> factor.Aposentado.1 -4.516e-02  1.055e-01  -0.428 0.668597
> factor.OcupaEstDiApenasDesemp.1  7.249e-02  1.411e-01   0.514 0.607474
> factor.ComFamilia.1 -4.323e-01  2.128e-01  -2.031 0.042444 *
> factor.ComOutParentes.1 -5.029e-01  3.517e-01  -1.430 0.153011
> factor.Republica.1   8.985e-03  1.959e-01   0.046 0.963429
> factor.Sozinho.1-2.475e-01  2.236e-01  -1.107 0.268673
> factor.Pensao.1 -8.439e-01  4.000e-01  -2.110 0.035106 *
> factor.OutroMoradia.1   -5.262e-01  3.353e-01  -1.569 0.116880
> factor.RU.1 -1.937e-01  1.059e-01  -1.830 0.067589 .
> factor.praec4.1 -1.583e-01  2.666e-01  -0.594 0.552951
> IdadeA   3.787e-02  9.381e-03   4.037 5.79e-05 ***
> escola   8.576e-02  3.441e-02   2.492 0.012836 *
> RendaPC  4.045e-05  1.313e-05   3.080 0.002119 **
> Dist 2.605e-05  1.296e-04   0.201 

Re: [R-br] Analise fatorial

[Leonard Assis via R-br]

Isso é problema de otimização.
Alguns métodos de otimização se perdem quando utilizam determinados chutes
iniciais.

Eu sofro muito ultimamente com isto usando equações estruturais, pois meus
dados são muito correlacionados (maior que 0.95 na maioria dos casos).

Em 23 de jan de 2017 4:51 PM, "Bruce Kelly via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

>
> Boa tarde Listeiros,
>
>
> Estou aplicando analise fatorial (AF) utilizando a a função 'factanal' do
> package 'stats'. minha duvida é sobre o p-value que esta dando baixo como
> pode ser visto abaixo nos resultados:
>
>
> Loadings:
> Factor1 Factor2 Factor3 Factor4 Factor5 Factor6
> v1   0.899   0.275   0.145   0.136   0.244   0.114
> v2   0.269   0.222   0.902   0.203   0.129
> v3   0.316   0.313   0.847   0.196   0.130   0.159
> v4  -0.205  -0.161
> v5   0.199   0.758   0.337   0.418   0.134
> v6  -0.164   0.406   0.389   0.167  -0.210
> v7   0.140   0.182   0.941
> v8   0.508   0.773   0.177   0.190
> v9   0.116   0.133   0.886
> v10  0.407   0.277   0.203   0.802   0.260
> v11  0.725   0.379   0.103   0.152   0.226
> v12  0.861   0.185   0.123
> v13  0.163   0.117   0.371
> v14  0.309   0.813   0.293   0.245   0.144   0.267
>
>Factor1 Factor2 Factor3 Factor4 Factor5 Factor6
> SS loadings  2.914   2.480   2.073   1.879   0.974   0.516
> Proportion Var   0.208   0.177   0.148   0.134   0.070   0.037
> Cumulative Var   0.208   0.385   0.533   0.668   0.737   0.774
>
> Test of the hypothesis that 6 factors are sufficient.
> The chi square statistic is 61.12 on 22 degrees of freedom.
> *The p-value is 1.52e-05 *
>
> Então tento reduzir o número de fatores, como por exemplo 5, já que 74% da
> variância no modela será  captada, mas qndo rodo a rotina aparece
>
> Error in factanal(dad, factors = 5, scores = c("none"), rotation =
> "varimax") :
>   unable to optimize from this starting value
>
> Desta forma utilizei a package 'rela' onde ele realiza a analise com 4
> fatores.
>
>
> Logo minha duvida é porque no 'factanal' não pode fazer, com esse valor?
> tem alguma coisa que eu possa fazer nos dados (além de padronizar) para ter
> uma melhor resposta no p-value?
>
>
> Muito obrigado a todos(as).
>
>
> Bruce
>
>
>
> ___
> R-br mailing list
> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
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Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo 
m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Lista de blogs brasileiros sobre o R

[Leonard Assis via R-br]

O rseek é uma mão na roda, nas algumas vezes produz resultados estranhos.
Semana passada eu procurei sobre análise fatorial de dados ordinais e ele
me deu resultado de "Bayes factor"

Em 23 de jan de 2017 12:06 PM, "Marcos Vital" 
escreveu:

> Opa, que bacana!
>
> Acho que já tinha esbarrado no Rseek antes, mas nem lembrava que ele
> existia, hehe.
> E com certeza seria fantástico um Rbloggers brasileiro. De repente alguém
> aí da lista toma frente de um projeto assim, seria fantástico.
>
> E na verdade tem a proposta do Sillas, de fazer um bot do Twitter para
> monitoras os blogs: https://github.com/sillasgonzaga/rbloggers-BR
> Acho que é um bom começo neste sentido!
>
> Abraços
>
> Em 23 de janeiro de 2017 09:28, Leonard Mendonça de Assis <
> assis.leon...@gmail.com> escreveu:
>
>> Eu perguntei porque eu geralmente uso como referência, o rseek.org.
>>
>> Minhas opções extras caem no stackoverflow e rbloggers (Via de regra, o
>> rseek cai neles)
>>
>>
>>
>> Uma alternativa pesquisável seria excelente.
>>
>>
>>
>> Leonard
>>
>>
>>
>> *De:* Marcos Vital [mailto:marcosvi...@gmail.com]
>> *Enviada em:* domingo, 22 de janeiro de 2017 21:49
>> *Para:* Leonard Assis 
>> *Cc:* a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <
>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
>> *Assunto:* Re: [R-br] Lista de blogs brasileiros sobre o R
>>
>>
>>
>> Existe uma proposta para monitorar os blogs automaticamente e usar um bot
>> do Twitter para isso, aqui:
>>
>> https://github.com/sillasgonzaga/rbloggers-BR
>>
>>
>>
>> Mas uma mega central feita a R-Bloggers seria fantástica! Pessoalmente,
>> nem sei por onde começar algo assim, por isso encarei a proposta mais
>> simples, de apenas criar uma lista mesmo, hehe.
>>
>>
>>
>> Abraços
>>
>>
>>
>> Em 22 de janeiro de 2017 20:43, Leonard Assis 
>> escreveu:
>>
>> Não teria como criar um mecanismo estilo o R-Bloggers?
>>
>> Ou já existe?
>>
>>
>>
>> Em 22 de jan de 2017 9:03 PM, "Marcos Vital via R-br" <
>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>>
>> Beleza, Thiago, obrigado pelo apoio, e mantenha seu blog vivo, o material
>> por lá parece muito bom!
>>
>> Vou adicionar o seu blog.
>>
>>
>>
>> Abraços!
>>
>>
>>
>> Marcos
>>
>>
>>
>> Em 22 de janeiro de 2017 16:07, Thiago V. dos Santos <
>> thi_vel...@yahoo.com.br> escreveu:
>>
>> Olá Marcos,
>>
>>
>> Eu gostei da iniciativa. Divulgue bastante a sua lista e ela se tornará
>> um importante recurso para aqueles que querem aprender a programar em R.
>>
>> Recentemente eu comecei a postar algumas dicas de R no meu site. Por
>> enquanto as dicas ainda são poucas e tratam principalmente de análise de
>> dados espaciais e de clima. No entanto, eu já tenho rascunho de mais alguns
>> tutoriais e planejo manter uma certa regularidade na adição de novas dicas.
>>
>> Se você julgar como um bom candidato para a sua lista, segue o link:
>> thiagodossantos.com/#blog
>>
>> Greetings,
>>  -- Thiago V. dos Santos
>>
>> PhD student
>> Land and Atmospheric Science
>> University of Minnesota
>>
>>
>>
>> On Saturday, January 21, 2017 7:15 AM, Marcos Vital via R-br <
>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>>
>>
>>
>> Olá, colegas de lista!
>>
>> Peço desculpas para aqueles que estão lá na comunidade de R no facebook,
>> para quem isso será um pouco de cross-posting...
>>
>> Estou construindo uma lista de blogs brasileiros que falem sobre o R.
>> Nada sofisticado, só uma listona mesmo, simples e direta. Acho que será um
>> recurso útil, especialmente para os iniciantes.
>>
>> A lista em construção está aqui: https://github.com/marcosvital
>> /blogs-de-R-no-Brasil
>>
>> Quem quiser contribuir pode responder aqui pela nossa lista de emails, ou
>> fazê-lo diretamente lá pelo github mesmo (via issue ou pull request). Basta
>> me indicar o link para um blog que eu incluo lá.
>>
>> O critério de inclusão é bem frouxo: basta ser um blog (ou página
>> similar) que trate do uso do R, que seja brasileiro e com material em
>> português. Mesmo blogs parados mas que continuam online podem ser
>> adicionados, caso tenham recursos úteis.
>>
>> Desde já agradeço qualquer contribuição!
>>
>> Abraços
>>
>> Marcos
>>
>> --
>>
>> Marcos Vinícius Carneiro Vital
>> Universidade Federal de Alagoas
>> Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde
>> Setor de Biodiversidade e Ecologia
>>
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>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo
>> m�nimo reproduz�vel.
>>
>>
>>
>>
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>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>
>> Leia o guia de postagem 

Re: [R-br] Lista de blogs brasileiros sobre o R

[Leonard Assis via R-br]

Não teria como criar um mecanismo estilo o R-Bloggers?
Ou já existe?

Em 22 de jan de 2017 9:03 PM, "Marcos Vital via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Beleza, Thiago, obrigado pelo apoio, e mantenha seu blog vivo, o material
> por lá parece muito bom!
> Vou adicionar o seu blog.
>
> Abraços!
>
> Marcos
>
> Em 22 de janeiro de 2017 16:07, Thiago V. dos Santos <
> thi_vel...@yahoo.com.br> escreveu:
>
>> Olá Marcos,
>>
>>
>> Eu gostei da iniciativa. Divulgue bastante a sua lista e ela se tornará
>> um importante recurso para aqueles que querem aprender a programar em R.
>>
>> Recentemente eu comecei a postar algumas dicas de R no meu site. Por
>> enquanto as dicas ainda são poucas e tratam principalmente de análise de
>> dados espaciais e de clima. No entanto, eu já tenho rascunho de mais alguns
>> tutoriais e planejo manter uma certa regularidade na adição de novas dicas.
>>
>> Se você julgar como um bom candidato para a sua lista, segue o link:
>> thiagodossantos.com/#blog
>>
>> Greetings,
>>  -- Thiago V. dos Santos
>>
>> PhD student
>> Land and Atmospheric Science
>> University of Minnesota
>>
>>
>> On Saturday, January 21, 2017 7:15 AM, Marcos Vital via R-br <
>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>>
>>
>>
>> Olá, colegas de lista!
>>
>> Peço desculpas para aqueles que estão lá na comunidade de R no facebook,
>> para quem isso será um pouco de cross-posting...
>>
>> Estou construindo uma lista de blogs brasileiros que falem sobre o R.
>> Nada sofisticado, só uma listona mesmo, simples e direta. Acho que será um
>> recurso útil, especialmente para os iniciantes.
>>
>> A lista em construção está aqui: https://github.com/marcosvital
>> /blogs-de-R-no-Brasil
>>
>> Quem quiser contribuir pode responder aqui pela nossa lista de emails, ou
>> fazê-lo diretamente lá pelo github mesmo (via issue ou pull request). Basta
>> me indicar o link para um blog que eu incluo lá.
>>
>> O critério de inclusão é bem frouxo: basta ser um blog (ou página
>> similar) que trate do uso do R, que seja brasileiro e com material em
>> português. Mesmo blogs parados mas que continuam online podem ser
>> adicionados, caso tenham recursos úteis.
>>
>> Desde já agradeço qualquer contribuição!
>>
>> Abraços
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>> Marcos
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Gráfico

[Leonard Assis via R-br]

Ggplot2
Macete: olhe transformação de coordenadas para coordenadas polares

Em 13 de dez de 2016 9:05 AM, "Emerson Cotta Bodevan via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Prezados, bom dia.
>
> Existe algum pacote no R que faz o gráfico em anexo?
>
> Agradeço qualquer ajuda.
>
> Att.,
>
> *Emerson*
>
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Re: [R-br] Erro no RStudio

[Leonard Assis via R-br]

Coincidência ou nao, eu rodei um rmd a pouco e ele tinha acentos, não houve
problema algum.
O problema que encontro algumas vezes é na codificação dos caracteres.
Ainda não identifiquei uma maneira fácil de resolver isto.

Em 19 de set de 2016 20:49, "Fernando Antonio de souza via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Lembro desse erro qdo dei um curso R.  O problema estava ligado ao fato do
> nome do usuário Windows conter acentos , hífen, pontos, etc A solução
> foi criar um nono usuário do sistema com nome sem essas coisas. Há uma
> discussão sobre isso no site do estúdio, vou procurar e lhe mando em breve
>
> Em 19/09/2016 19:35, "Maurício Lordêlo via R-br" 
> escreveu:
>
>> Boa noite!
>> Veja se esta opção resolve seu problema:
>> 1. Na área de trabalho, clica uma vez no ícone do RStudio;
>> 2. Botão direito do mouse: "Executar como Administrador"
>> 3. Na janela "Controle de Conta do Usuário", clique em SIM.
>> Maurício
>>
>> Em 19 de setembro de 2016 18:53, ROSIANA RODRIGUES ALVES via R-br <
>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>>
>>> Olá Boa Noite,
>>>
>>>  Estou precisando de uma solução para um problema que descobri no
>>> RStudio. Todo vez que tento instalar um biblioteca , ou importar um arquivo
>>> de dados pela abas disponíveis no RStudio e o nome de usuário do computador
>>> ou o nome da pasta contém acentos aparece essa mensagem de erro "r code
>>> execution error". A solução que arrumei foi sempre instalar por linhas de
>>> comando, mas a maioria dos meus alunos preferem a forma
>>> "clique-aqui-clique-ali".
>>> Abraços,
>>>
>>> Rosiana Rodrigues Alves
>>> Estatística e Experimentação Agropecuária
>>>
>>> Embrapa Pesca e Aquicultura
>>>
>>> Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
>>> Palmas/TO
>>>
>>> +55 (63) 3229-7805/7800  | Skype: cnpasa.rosiana
>>>
>>> http://cnpasa.sede.embrapa.br  | twitter.com/embrapa
>>> Confira também: www.facebook.com/agrosustentavel
>>>
>>>
>>> 
>>>
>>> 
>>> Aviso de confidencialidade
>>>
>>> Esta mensagem da Empresa  Brasileira de Pesquisa  Agropecuaria  (Embrapa),
>>> empresa publica federal  regida pelo disposto  na Lei Federal no. 5.851,  de
>>> 7 de dezembro de 1972,  e  enviada exclusivamente  a seu destinatario e pode
>>> conter informacoes  confidenciais, protegidas  por sigilo profissional.  Sua
>>> utilizacao desautorizada  e ilegal e  sujeita o infrator as penas da lei. Se
>>> voce  a recebeu indevidamente, queira, por gentileza, reenvia-la ao 
>>> emitente,
>>> esclarecendo o equivoco.
>>>
>>> Confidentiality note
>>>
>>> This message from Empresa  Brasileira de Pesquisa  Agropecuaria  (Embrapa), 
>>> a
>>> government company  established under  Brazilian law  (5.851/72), is 
>>> directed
>>> exclusively to  its addressee  and may contain  confidential data,  
>>> protected
>>> under  professional secrecy  rules. Its unauthorized  use is illegal and  
>>> may
>>> subject the transgressor to the law's penalties. If you are not the 
>>> addressee,
>>> please send it back, elucidating the failure.
>>>
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Re: [R-br] Relação de cidades IBGE x TSE

[Leonard Assis via R-br]

Car, tentei fazer isto uma vez e deu tanto trabalho que desisti. Não
compensava

Em 12 de set de 2016 14:11, "Rodrigo Coster via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Boa tarde,
>
> Alguém teria uma lista relacionando os códigos de cidade IBGE e TSE? Por
> exemplo, enquanto para o IBGE (e a maioria dos outros órgãos), Porto Alegre
> / RS tem o código 431490-2, enquanto para o TSE o código é 88013. Há um
> tempo atrás eu fiz essa relação através do nome das cidades, mas havia
> diferença na grafia de algumas cidades.
>
>
> []'s
>
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Re: [R-br] (sem assunto)

[Leonard Assis via R-br]

Rode ela como rmarkdown e gere um  docx

Em 6 de set de 2016 14:00, "Elias Carvalho via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Boa tarde a todos.
>
> Eu tenho uma matriz, chamada "matrix.results", como resultado de algumas
> análises:
>
>
> ​Consigo imprimir uma tabela no console com o comando:
> kable(head(matrix.results ), format = "rst", align = "r")
>
>
> ​​
> ​Agora eu gostaria de salvar​ uma imagem desta tabela para inserir em um
> documento.
>
> No entanto eu gostaria de salvar como imagem uma tabela mais bem
> formatada, como esta:
>
>
> ​
> Alguém poderia ajudar ?
>
> ​​
>
>
> *In Jesu et Maria*
> *Obrigado*
> *Prof. Elias Carvalho*
>
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Re: [R-br] Leitura de range de aba de arquivo xlsx Excell no R

[Leonard Assis via R-br]

Tem um detalhe referente a Java, odbc e similares no Windows. Se seu R for
x64, estes também devem ser.

Em 31 de ago de 2016 11:03, "Thiago V. dos Santos via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Mauricio,
>
>
> Eu também enfrento esse problema sempre que atualizo a VM do Java no meu
> Mac. O problema parece acontecer porque o RStudio não consegue encontrar a
> biblioteca do Java aonde ela deveria estar no OS X El Capitan. O que
> funciona pra mim nesse caso é criar um link simbólico, digitando o seguinte
> comando no terminal:
>
> sudo ln -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib
> /usr/local/lib
>
>
> Em seguida, vale a pena reconfigurar o java no R (também em linha de
> comando):
>
> sudo R CMD javareconf -n
>
>
> Finalmente, eu recomendo que você remova o pacote XLConnectJars e
> reinstale-o usando o código fonte:
>
> install.packages("XLConnectJars", type='source')
>
> Deve funcionar.
>  Greetings,
>  -- Thiago V. dos Santos
>
> PhD student
> Land and Atmospheric Science
> University of Minnesota
>
>
> On Tuesday, August 30, 2016 10:48 PM, Jônatan via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>
>
>
> Maurício,
> sugiro testar a função excel_sheets() do pacote readxl que não tem
> dependências externas. Para ler arquivos xls ou xlsx read_excel().
> Att.
>
>
>
>
>
> On Tue, Aug 30, 2016 at 9:45 PM, Maurício Cunha via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>
> Bom dia Pessoal,
> >
> >
> >Estou tentando ler dados de uma planilha Excel com muitas abas,
> trabalhando com RStudio no Mac.
> >
> >
> >Dei os seguintes comandos:
> >
> >
> >
> >>
> >> install.packages("XLConnect")
> >>trying URL 'https://cran.rstudio.com/bin/ macosx/mavericks/contrib/3.3/
> XLConnect_0.2-12.tgz'
> >>Content type 'application/x-gzip' length 5546911 bytes (5.3 MB)
> >>== 
> >>downloaded 5.3 MB
> >>
> >>
> >>tar: Failed to set default locale
> >>The downloaded binary packages are in
> >>/var/folders/_4/f5_ n3z0x24nc08f5whq81nl8gn/T/
> /RtmpxbUYbW/downloaded_ packages
> >>
> >>
> >>> library(XLConnect)
> >>Loading required package: XLConnectJars
> >>JavaVM: requested Java version ((null)) not available. Using Java at ""
> instead.
> >>JavaVM: Failed to load JVM: /bundle/Libraries/libserver. dylib
> >>JavaVM FATAL: Failed to load the jvm library.
> >>Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'XLConnectJars', details:
> >>  call: .jinit()
> >>  error: JNI_GetCreatedJavaVMs returned -1
> >>
> >>
> >>Error: package 'XLConnectJars' could not be loaded
> >>
> >>
> >Ou seja o XLConnect instala mas a library dá problema.Alguém teria alguma
> orientação?
> >
> >
> >Obrigado,
> >
> >
> >Maurício
> >__ _
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> código mínimo reproduzível.
> >
>
>
> --
>
> ###
> ##  Jônatan Dupont Tatsch
> ##  Professor do Departamento de Física
> ##  Centro de Ciências Exatas e Naturais (CCNE)
>
> ##  Universidade Federal de Santa Maria - UFSM
> ##  Faixa de Camobi, Prédio 13 - Campus UFSM - Santa Maria, RS, Brasil -
> 97105-900
>
> ##  Telefone: +55(55)33012083
>
> ##  www.ufsm.br/meteorologia
> ###
>
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne� c�igo
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Re: [R-br] Markdown

[Leonard Assis via R-br]

Eu tive um.problema deste uma vez. Era problema do pacote, que não era
muito compatível com o markdown. Agora não lembro ao certo qual figura era,
suponho que seja alguma representação de rede neural.

Leonard

Em 9 de ago de 2016 14:06, "Andre Oliveira via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Boa tarde, deu tudo certo. Obrigado pela dicas!
> Ao rodar para gerar o HTML está tudo certo,  mas para rodar para obter o
> .pdf não insere as figuras! Alguma dica de como contornar este ponto?
> obg
>
>
> Estrutura ...
>
> ---
> title: "Material R"
> author: "André Oliveira Souza"
> date: "3 de maio de 2016"
> output: pdf_document
> number_sections: yes
> ---
>
>
> ```{r,fig=T}
> Dados<-scale(dad)
> hc<-hclust(dist(dad),method="ward.D")
> par(las=2) # Gira título do eixo
> plot(as.dendrogram(hc),horiz = F,main = "Agrupamentos dos Tratamentos")
> abline(h=6,lty=3, col="red")
> ```
>
> André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística
> aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito
> Santo.  IFES
>
>
> Em Domingo, 7 de Agosto de 2016 20:36, Andre Oliveira via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
>
> obrigado!
>
> André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística
> aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito
> Santo.  IFES
>
>
> Em Domingo, 7 de Agosto de 2016 13:36, Marcos Silva via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
>
> Tente
> supressMessages()
>
> Em 7 de ago de 2016 11:21 AM, "Felipe via R-br" 
> escreveu:
>
> Tentou assim:
>
> ```{r,message=FALSE}
> require(gdata)
> ```
>
>
>
> Em 07-08-2016 11:04, Andre Oliveira via R-br escreveu:
>
>
> boa dia,
> como esconder estes avisos no R Markdown? Já pesquisei e não consegui
> resolver, quando carrego a gdata,  ficam estes estes avisos no texto.
> Minhas configurações no documento são:
>
> ```{r,include=F}
> # Configuração global
> require(knitr)
> opts_chunk$set(echo = F,comment="",message=" ")
> ```
> ```{r}
> require(gdata, quietly = TRUE)
> gdata: read.xls support for 'XLS' (Excel 97-2004) files ENABLED.
> gdata: read.xls support for 'XLSX' (Excel 2007+) files ENABLED.
> Attaching package: ‘gdata’
> The following object is masked from ‘package:stats’:
> nobs
> The following object is masked from ‘package:utils’:
> object.size
> The following object is masked from ‘package:base’:
> startsWith
> ```
>
>
> Obrigado!
>
> André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística
> aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito
> Santo.  IFES
>
>
> __ _
> R-br mailing listr...@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/ 
> cgi-bin/mailman/listinfo/r-br 
> 
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br- guia 
> ) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
>
>
> --
> Atenciosamente
> Felipe E. Barletta Mendes
> Estatístico(UFPR) - Conre3 9766-A
> Mestrando em Bioestatística(UEM)+55 (41)-92077191+55 (41)-33287216
>
>
> __ _
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> https://listas.inf.ufpr.br/ cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> 
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br- guia
> ) e forneça código mínimo reproduzível.
>
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne� c�igo
> m�imo reproduz�el.
>
>
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Re: [R-br] Compatibilidade de pacote Linux x Windows

[Leonard Assis via R-br]

Você tem que ter o rtools instalado no windows

Em 20 de jul de 2016 22:32, "Elias Carvalho via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Boa Noite a todos
>
> Criei um pacote no Ubuntu 14.04, com RStudio Version 0.99.896 e R 3.3.0,
> gerei o tar.gz, copiei em um pendrive e tentei instalar no RStudio mesma
> versão do Windows 7.
>
> A linha de comando que o RStudio do Windows 7 usou para instalar o pacote
> foi: install.packages("MY_PACKAGE_1.0.tar.gz", repos=NULL, type="source").
>
> No entanto a linha é executada e nenhuma mensagem aparece e
> consequentementeo o pacote não é instalado.
>
> Existem algum passo diferente para instalar um pacote criado no ubuntu
> para o windows ? Ou checar o que está acontecendo ?
>
> --
>
>
> *In Jesu et Maria*
> *Obrigado*
> *Prof. Elias Carvalho*
>
> ___
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
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R-br mailing list
R-br@listas.c3sl.ufpr.br
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo 
m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] RES: RES: [Dúvida] Microsoft R Open

[Leonard Assis via R-br]

Sem o mkl, única vantagem é o mran. Com o mkl, muita coisa executa muito
mais rápido sem mexer no código.

Em 15 de jul de 2016 9:38 PM, "Benilton Carvalho via R-br" <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Então tire a parte "foreach/do*".
>
> On Fri, Jul 15, 2016 at 10:36 PM Cristofer Weber <
> cristofer.we...@neogrid.com> wrote:
>
>> Desculpe, eu me referia ao R Open em relação ao CRAN R. Você listou
>> packages muito importantes como foreach, que foi um diferencial para ganho
>> de desempenho em ambiente multicore, mas ela funciona também com o CRAN R.
>> As demais eu posso estar enganado, mas a meu ver são comerciais e
>> proprietárias, não fazem parte do R Open.
>>
>> Sent from my iPhone
>>
>> On 15 de jul de 2016, at 22:30, Benilton Carvalho <
>> beniltoncarva...@gmail.com> wrote:
>>
>> Reescrita de códigos-base; ScaleR; integração com Azure;  integração com
>> SQL Server; Azure ML; Azure HDInsight; suporte Teradata e Hadoop; em cima
>> de tudo isso, vem MKL e todas as coisinhas *a la *foreach/do* da época
>> da Revolution R.
>>
>> Obviamente, vc pode gastar todo um tempo pra configurar e ajustar o
>> funcionamento similar usando o "R padrão", mas no corporativo vc não tem
>> habitualmente esse tipo de disponibilidade.
>>
>> On Fri, Jul 15, 2016 at 1:07 PM Cristofer Weber via R-br <
>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>>
>>> Benilton, você pode nos apontar quais outras melhoras existem no
>>> Revolution R / Microsoft R além das já discutidas? Essa é uma das
>>> principais questões dessa thread, e tua contribuição ajudará bastante!
>>>
>>>
>>>
>>> []’s
>>>
>>> Cristofer
>>>
>>>
>>>
>>> *De:* Benilton Carvalho [mailto:beniltoncarva...@gmail.com]
>>> *Enviada em:* Friday, July 15, 2016 12:56
>>> *Para:* Cristofer Weber ; a lista
>>> Brasileira oficial de discussão do programa R. >> >
>>> *Assunto:* Re: [R-br] RES: [Dúvida] Microsoft R Open
>>>
>>>
>>>
>>> FYI: o MRO é o Revolutions R e, sim, eles estão dispostos a cooperar. A
>>> melhora não é apenas via MKL.
>>>
>>>
>>>
>>> On Thu, Jul 14, 2016 at 6:19 PM Cristofer Weber via R-br <
>>> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>>>
>>> Esclarecendo a questão da licença da lib MKL:
>>>
>>>
>>>
>>> https://software.intel.com/en-us/articles/free-mkl
>>>
>>>
>>>
>>> “The Intel® Math Kernel Library (Intel® MKL),
>>>  the high performance math
>>> library for x86 and x86-64, is available, on Windows*, Linux*, or OS X* for
>>> free for everyone (click here now to register and download
>>> ).
>>> Purchasing is only necessary if you want access to Intel® Premier Support
>>> (direct 1:1 private support from Intel), older versions of the library or
>>> access to other tools in Intel®
>>> Parallel Studio XE.
>>>  Intel
>>> continues to actively develop and support this very powerful library - and
>>> everyone can benefit from that!”
>>>
>>>
>>>
>>> Não há restrição para uso comercial. O licenciamento só é necessário se
>>> você quiser suporte.
>>>
>>>
>>>
>>> O R Open (antigo Revolution, agora MS) é uma distribuição do CRAN R Open
>>> Source pré-compilado para uso da MKL e configurado para outro repositório
>>> do CRAN gerenciado pela MS, com versões estáticas dos pacotes. É a MS quem
>>> escolhe a versão de cada pacote neste repositório. O repositório fica
>>> vinculado à versão do R Open, ou seja, você só terá acesso a versões mais
>>> recentes dos pacotes quando atualizar a versão do R Open (
>>> https://mran.revolutionanalytics.com/rro/#repos).
>>>
>>>
>>>
>>> Outra diferença mais sutil é que o R Open já traz consigo alguns pacotes
>>> a mais que o CRAN R (https://mran.revolutionanalytics.com/rro/installed/)
>>>
>>>
>>>
>>>
>>> Utilizamos o R Open desde os tempos da Revolution. As operações
>>> matriciais da MKL são mais eficientes mesmo em modo single-thread. Tenha em
>>> mente que tanto single-thread quanto multithread você só terá benefício
>>> onde as primitivas de álgebra matricial forem aplicadas. Não há melhoria no
>>> desempenho da linguagem em si, que é bastante limitado devido ao modelo de
>>> memória baseado em listas encadeadas, Garbage Collector deficiente e
>>> passagem de parâmetros por cópia, entre outros.
>>>
>>>
>>>
>>> Sobre a performance da linguagem, a Tibco possui uma versão proprietária
>>> mais eficiente (eles compraram o S-Plus, versão comercial da linguagem S,
>>> “pai” do R) e a Oracle também mantém uma versão proprietária (a qual ainda
>>> não avaliei).
>>>
>>>
>>>
>>> Além disso, a Oracle está trabalhando numa implementação chamada FastR (
>>> https://github.com/graalvm/fastr), compatível com o CRAN R mas
>>> compilada para a JVM (Java Virtual Machine), com otimizações em tempo de
>>> compilação e por tabela com todas as otimizações da JVM para uso eficiente
>>> de arquiteturas