Re: [R-br] função geom_oint

2022-05-25 Por tôpico R-br
library(tidyverse) library(metan) db <- structure(list(gene = c("ACTB", "ACTG1", "AJUBA"), BE.exp = c(4.006,3.85, 1.185), BE. = c(99.8, 5.9, 5.9), CE_exp = c(3.69, 3.592, 0.972), CE. = c(99.6, 7.1, 7.1),

Re: [R-br] função geom_oint

2022-05-25 Por tôpico R-br
Veja se seria algo assimlibrary(reshape2)library(ggplot2)library(dplyr)t <- read.delim('teste.txt')t1 <- t[,c(1,seq(2,ncol(t),2))] t2 <- t[,c(1,seq(3,ncol(t),2))]t1l <- melt(t1, idvar = 'gene')colnames(t1l)[3] <- 'exprs't2l <- melt(t2, idvar = 'gene')colnames(t2l)[3] <- 'percentage'tl <-

Re: [R-br] função geom_oint

2022-05-25 Por tôpico Cesar Rabak por (R-br)
Acho que reshape, *per se*, não é suficiente. . . É necessário efetuar aglutinações nos dados para que se tenha as nove "linhas" da tabela que gerarão as posições no eixo x do *bubble plot*, etc. Uma busca na documentação por "dplyr aggregate by group" mostrará o caminho a seguir. Se eu entendo

[R-br] Fwd: Anaconda/Jupyter erro :Graphics API version mismatch -

2022-05-25 Por tôpico Fernando Souza por (R-br)
Olá pessoal, Após atualizar para a versão 4.1.3 do R no *Anaconda* passei a receber esta mensagem: "Error in Cairo::Cairo(width, height, tf, "png", pointsize, bg, "transparent", : Graphics API version mismatch Em pesquisa na rede vi que tem a ver com uma mudança na api Cairo do R. Vi sugestões

Re: [R-br] função geom_oint

2022-05-25 Por tôpico R-br
Vc precisa transformar a tabela do formate wide para long. Existem varias formas. Aqui tem um exemplo https://www.datasciencemadesimple.com/reshape-in-r-from-wide-to-long-from-long-to-wide/ daniel >

[R-br] função geom_oint

2022-05-25 Por tôpico Michele Claire Breton por (R-br)
Caríssimos(as) colegas(as), muito bom dia! Espero que todos se encontrem bem. Estou com uma dificuldade. Quero fazer um bubble plot usando as funções ggplot2 e dplyr, onde pretendo plotar no eixo x o gene_ID (são 84 linhas), no y a % de ocorrência da expressão na célula e no color, o valor da