こんにちは。下保です。 1行パッチですが，x11-drivers/xf86-input-mouse/files に， patch-src-mouse.c として置いておくと意図通りになりませんか。 新しいxorg-serverで副作用が無いかは確認していません。
--- src/mouse.c.orig 2011-06-25 14:26:47.000000000 +0900
+++ src/mouse.c 2012-08-31 11:01:42.000000000 +0900
@@ -871,6 +871,7 @@
pInfo->close_proc = NULL;
pInfo->private_flags = 0;
pInfo->always_core_feedback = NULL;
+ pInfo->options = dev->commonOptions;
if (NewMousePreInit(drv, pInfo, flags) == Success)
{
--
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