Hi Trisanna

the binaries that take mandatory command-line arguments (i.e. without a -- or - in front of them) require all options to be given before the mandatory arguments

cheers
Bruce

On Mon, 20 Jun 2016, Trisanna Sprung-Much wrote:

thanks, Bruce. Yes in the end through trial and error I tried "mri_average 
-noconform input output" and it worked. I was
surprised that I had to put the -noconform first as normally one can put the 
argument anywhere in the command.

Best

Trisanna

--
Ph.D. CandidateMcGill University
Integrated Program in Neuroscience
Psychology


On Mon, Jun 20, 2016 at 9:27 AM, Bruce Fischl <fis...@nmr.mgh.harvard.edu> 
wrote:
      yes, your last file on the command line should be the output file (the 
average)

      cheers
      Bruce

      On Mon, 20 Jun 2016, Trisanna Sprung-Much wrote:

      As a follow-up, here is the mri_info for one of my overlays in the folder
      and the output file that mri_average seems to create (if I don't specify 
an
      output and it re-writes my last file). The dimensions are off:
      Any ideas?

      Trisanna


      
Tgtrisanna@kaplan:/data-01/trisanna/freesurfer/fsaverage/DISPLAY_overlays_fsa
      vee_left/aalf_lh$ mri_info fsaverage_overlay_aalf_icbm-102_left.mgz 
      Volume information for fsaverage_overlay_aalf_icbm-102_left.mgz
                type: MGH
          dimensions: 163842 x 1 x 1
         voxel sizes: 1.0000, 1.0000, 1.0000
                type: FLOAT (3)
                 fov: 163842.000
                 dof: 0
              xstart: -81921.0, xend: 81921.0
              ystart: -0.5, yend: 0.5
              zstart: -0.5, zend: 0.5
                  TR: 0.00 msec, TE: 0.00 msec, TI: 0.00 msec, flip angle: 0.00
      degrees
             nframes: 1
             PhEncDir: UNKNOWN
      ras xform present
          xform info: x_r =   1.0000, y_r =   0.0000, z_r =   0.0000, c_r =    
      0.5000
                    : x_a =   0.0000, y_a =   1.0000, z_a =   0.0000, c_a =  
      -17.5000
                    : x_s =   0.0000, y_s =   0.0000, z_s =   1.0000, c_s =  
       18.5000

      talairach xfm : 
      Orientation   : RAS
      Primary Slice Direction: axial

      voxel to ras transform:
                      1.0000   0.0000   0.0000 -81920.5000
                      0.0000   1.0000   0.0000   -18.0000
                      0.0000   0.0000   1.0000    18.0000
                      0.0000   0.0000   0.0000     1.0000

      voxel-to-ras determinant 1

      ras to voxel transform:
                      1.0000  -0.0000  -0.0000 81920.5000
                     -0.0000   1.0000  -0.0000    18.0000
                     -0.0000  -0.0000   1.0000   -18.0000
                      0.0000   0.0000   0.0000     1.0000


      
trisanna@kaplan:/data-01/trisanna/freesurfer/fsaverage/DISPLAY_overlays_fsa
      verage_left/aalf_lh$ mri_info fsaverage_overlay_aalf_icbm-350_left.mgz 
      Volume information for fsaverage_overlay_aalf_icbm-350_left.mgz
                type: MGH
          dimensions: 256 x 256 x 256
         voxel sizes: 1.0000, 1.0000, 1.0000
                type: FLOAT (3)
                 fov: 256.000
                 dof: 0
              xstart: -128.0, xend: 128.0
              ystart: -128.0, yend: 128.0
              zstart: -128.0, zend: 128.0
                  TR: 0.00 msec, TE: 0.00 msec, TI: 0.00 msec, flip angle: 0.00
      degrees
             nframes: 1
             PhEncDir: UNKNOWN
      ras xform present
          xform info: x_r =  -1.0000, y_r =   0.0000, z_r =   0.0000, c_r =    
      0.5000
                    : x_a =   0.0000, y_a =   0.0000, z_a =   1.0000, c_a =  
      -17.5000
                    : x_s =   0.0000, y_s =  -1.0000, z_s =   0.0000, c_s =  
       18.5000

      talairach xfm : 
      Orientation   : LIA
      Primary Slice Direction: coronal

      --
Ph.D. CandidateMcGill University
Integrated Program in Neuroscience
Psychology


On Mon, Jun 20, 2016 at 12:32 AM, Trisanna Sprung-Much
<trisanna.sprung-m...@mail.mcgill.ca> wrote:
      Hi Dr. Fischl
I ran the following mri_average and consistently get this message. It
seems to be trying to read my output as one of the input volumes. If I
don't specify an output it re-writes my last file in the input folder
and when I try to open this it doesn't work at all.

What exactly does MRIchangeType mean?



(navigated to folder with all .mgz volumes want to average)
mri_average *.mgz test.mgz --noconform

1 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-102_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
2 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-103_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
3 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-104_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
4 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-105_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
5 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-106_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
6 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-107_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
7 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-108_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
8 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-109_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
9 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-110_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
10 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-111_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
11 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-112_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
12 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-113_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
13 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-114_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
14 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-115_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
15 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-116_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
16 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-117_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
17 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-118_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
18 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-119_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
19 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-120_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
20 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-121_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
21 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-122_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
22 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-123_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
23 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-124_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
24 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-125_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
25 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-126_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
26 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-127_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
27 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-131_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
28 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-133_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
29 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-134_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
30 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-135_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
31 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-137_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
32 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-139_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
33 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-140_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
34 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-141_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
35 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-142_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
36 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-143_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
37 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-144_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
38 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-145_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
39 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-146_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
40 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-150_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
41 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-158_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
42 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-200_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
43 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-201_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
44 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-203_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
45 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-204_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
46 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-205_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
47 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-209_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
48 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-340_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
49 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-347_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
50 of 51: reading fsaverage_overlay_aalf_icbm-350_left.mgz...
embedding and interpolating volume
MRIchangeType: Building histogram 
51 of 51: reading test.mgz...
mghRead(/data-01/trisanna/freesurfer/fsaverage/DISPLAY_overlays_fsaverage_l
eft/aalf_lh/test.mgz, -1): could not open file
mri_average: MRIread(test.mgz) failed


--
Ph.D. CandidateMcGill University
Integrated Program in Neuroscience
Psychology


On Sun, Jun 19, 2016 at 12:46 PM, Bruce Fischl
<fis...@nmr.mgh.harvard.edu> wrote:
      no problem.

      Bruce
      On Sun, 19 Jun 2016, Trisanna Sprung-Much wrote:

            thanks Dr. Fischl - I think sometimes my
            emails don't get sent out on the
            first try and so I resend - don't mean to spam
            everyone.
            Don't know how I missed the mri_average option
            - I think I need vacation
            too.

            thanks and have a lovely Sunday!

            Trisanna

            --
            Ph.D. CandidateMcGill University
            Integrated Program in Neuroscience
            Psychology


            On Sun, Jun 19, 2016 at 11:22 AM, Bruce Fischl
            <fis...@nmr.mgh.harvard.edu>
            wrote:
                  Hi Trisanna

                  Doug is on vacation and his response
            time is likely to be pretty
                  slow. If any emails go unanswered you
            should repost them in a
                  week or two.

                  As for this, if you overlays are mapped
            to fsaverage you can
                  just use mri_average to average them.

                  cheers
                  Bruce



                  On Sun, 19 Jun 2016, Trisanna
            Sprung-Much wrote:

                        Hi Doug

                        So all of my overlays for each
            subject have been
                        registered to fsaverage
                        using mri_surf2surf. I am now
            wondering how I could
                        create an average in
                        "fsaverage space" using these
            overlays - I
                        understand that
                        mris_make_average_surface is an
            option but I cannot
                        seem to find whether
                        this works for overlays and not
            just surfaces
                        (white, pial). I want to take
                        each subject overlay on fsaverage
            and average them
                        to get a probability map.

                        thanks

                        --
                        Ph.D. CandidateMcGill University
                        Integrated Program in Neuroscience
                        Psychology


                        On Fri, Jun 17, 2016 at 5:48 PM,
            Trisanna
                        Sprung-Much
                       
            <trisanna.sprung-m...@mail.mcgill.ca> wrote:
                              Hi Doug

                        So all of my sulci for each
            subject have been
                        registered to fsaverage
                        using mri_surf2surf. I am now
            wondering how I could
                        create an average
                        of a sulcus using these overlays -
            I understand that
                        mris_make_average_surface is an
            option but I cannot
                        seem to find
                        whether this works for overlays
            and not just
                        surfaces (white, pial). I
                        want to take each subject overlay
            on fsaverage and
                        average them to get
                        a probability map for a single
            sulcus.

                        thanks

                        Trisanna

                        --
                        Ph.D. CandidateMcGill University
                        Integrated Program in Neuroscience
                        Psychology


                        On Wed, Jun 15, 2016 at 6:25 PM,
            Trisanna
                        Sprung-Much
                       
            <trisanna.sprung-m...@mail.mcgill.ca> wrote:
                              worked beautifully. Thank
            you!

                        --
                        Ph.D. CandidateMcGill University
                        Integrated Program in Neuroscience
                        Psychology


                        On Wed, Jun 15, 2016 at 4:41 PM,
            Douglas N Greve
                        <gr...@nmr.mgh.harvard.edu> wrote:
                              Try surf2surf with
            --mapmethod nnf

                              On 06/15/2016 04:25 PM,
            Trisanna Sprung-Much
                        wrote:
                              > Hi Doug - yes they do
            actually, I was quite
                              pleased. I did some trials
                              > with other subjects and
            the mri_vol2surf all
                        looks
                              good. Very similar
                              > to what I had in our
            in-house software.
                              >
                              > Would things be better if
            I were to isolate
                        each
                              sulcus as a .label
                              > and then try the
            mri_label2label? Someone
                              suggested perhaps the
                              > colours are overlapping
            with the overlay....
                              >
                              > --
                              > Ph.D. Candidate
                              > McGill University
                              > Integrated Program in
            Neuroscience
                              > Psychology
                              >
                              >
                              > On Wed, Jun 15, 2016 at
            4:10 PM, Douglas N
                        Greve
                              > <gr...@nmr.mgh.harvard.edu
                             
            <mailto:gr...@nmr.mgh.harvard.edu>> wrote:
                              >
                              >     The problem is
            probably that the
                        vol2surf
                              command did not properly
                              >     sample the labels onto
            the surface. Do
                        the
                              labels on subject 00350
                              >     surfaces look ok?
                              >
                              >     On 06/15/2016 04:00
            PM, Trisanna
                        Sprung-Much
                              wrote:
                              >     > thanks Dr. Fischl
                              >     >
                              >     > So the command seems
            to have worked! I
                        have
                              copied what ran in my
                              >     > terminal. When I
            open the test.mgz
                        overlay
                              on the fsaverage pial
                              >     > surface, things look
            ok but a bit
                        funny. I
                              am wondering if there is
                              >     > anything I can do to
            the mri_surf2surf
                              command to improve the
                              >     > registration to
            fsaverage? *See my
                        snapshots
                              attached.*
                              >     >
                              >     > trisanna@kaplan:~$
            mri_surf2surf
                              --srcsubject 00350 --sval
                              >     >
                             
                       
            /data-01/trisanna/freesurfer/00350/surfaceoverlay_left.mgz
                              >     > --trgsubject
            fsaverage --tval test.mgz
                              --hemi lh
                              >     > srcsubject = 00350
                              >     > srcval     =
                              >   
                             
                       
             /data-01/trisanna/freesurfer/00350/surfaceoverlay_left.mgz
                              >     > srctype    =
                              >     > trgsubject =
            fsaverage
                              >     > trgval     =
            test.mgz
                              >     > trgtype    =
                              >     > srcsurfreg =
            sphere.reg
                              >     > trgsurfreg =
            sphere.reg
                              >     > srchemi    = lh
                              >     > trghemi    = lh
                              >     > frame      = 0
                              >     > fwhm-in    = 0
                              >     > fwhm-out   = 0
                              >     > label-src  = (null)
                              >     > label-trg  = (null)
                              >     > OKToRevFaceOrder  =
            1
                              >     > Reading source
            surface reg
                              >     >
                             
                       
            /data-01/trisanna/freesurfer/00350/surf/lh.sphere.reg
                              >     > Loading source data
                              >     > Reading target
            surface reg
                              >     >
                             
                       
            /data-01/trisanna/freesurfer/fsaverage/surf/lh.sphere.reg
                              >     > Done
                              >     > Mapping Source
            Volume onto Source
                        Subject
                              Surface
                              >     > surf2surf_nnfr:
            building source hash
                              (res=16).
                              >     > Surf2Surf: Forward
            Loop (163842)
                              >     >
                              >     > surf2surf_nnfr:
            building target hash
                              (res=16).
                              >     > Surf2Surf: Reverse
            Loop (166912)
                              >     > Reverse Loop had
            41306 hits
                              >     > Surf2Surf: Dividing
            by number of hits
                              (163842)
                              >     > INFO: nSrcLost = 0
                              >     > nTrg121 = 132490,
            nTrgMulti = 31352,
                              MnTrgMultiHits = 2.31749
                              >     > nSrc121 = 137180,
            nSrcLost = 0,
                        nSrcMulti =
                              29732, MnSrcMultiHits =
                              >     > 2.28602
                              >     > Saving target data
                              >     > Saving to test.mgz
                              >     >
                              >     > best
                              >     >
                              >     > Trisanna
                              >     >
                              >     > --
                              >     > Ph.D. Candidate
                              >     > McGill University
                              >     > Integrated Program
            in Neuroscience
                              >     > Psychology
                              >     >
                              >     >
                              >     > On Wed, Jun 15, 2016
            at 12:13 PM,
                        Bruce
                              Fischl
                              >     >
            <fis...@nmr.mgh.harvard.edu
                             
            <mailto:fis...@nmr.mgh.harvard.edu>
                        >   
             <mailto:fis...@nmr.mgh.harvard.edu
                        >   
             <mailto:fis...@nmr.mgh.harvard.edu>>> wrote:
                        >     >
                        >     >     Hi Trisanna
                        >     >
                        >     >     you would only use
            those options of if
                        you
                        were transforming
                        >     a surface
                        >     >     Bruce
                        >     >
                        >     >
                        >     >     On Wed, 15 Jun 2016,
            Trisanna
                        Sprung-Much
                        wrote:
                        >     >
                        >     >         thanks Dr. Fischl
                        >     >
                        >     >         I assume that for
            surface overlays
                        one
                        cannot specify
                        >     >         --sval-xyz and
            --tval-xyz or the
                        command
                        will treat the
                        >     input
                        >     >         as a surface
                        >     >         itself?
                        >     >
                        >     >         best
                        >     >
                        >     >         Trisanna
                        >     >
                        >     >
                        >     >
                        >     >
                        >     >         --
                        >     >         Ph.D.
            CandidateMcGill University
                        >     >         Integrated Program
            in Neuroscience
                        >     >         Psychology
                        >     >
                        >     >
                        >     >         On Wed, Jun 15,
            2016 at 11:11 AM,
                        Bruce
                        Fischl
                        >     >       
             <fis...@nmr.mgh.harvard.edu
                        >   
             <mailto:fis...@nmr.mgh.harvard.edu>
                        >     >       
             <mailto:fis...@nmr.mgh.harvard.edu
                        >   
             <mailto:fis...@nmr.mgh.harvard.edu>>> wrote:
                        >     >               Hi Trisanna
                        >     >
                        >     >               you don't
            need to inflate the
                        overlays. They can just
                        >     >         use the existing
            surface-based
                        (sphere.reg) registration.
                        >     >
                        >     >               cheers
                        >     >               Bruce
                        >     >               On Wed, 15
            Jun 2016, Trisanna
                        Sprung-Much wrote:
                        >     >
                        >     >                     Hi
            there
                        >     >                     So I
            have sulcal labels
                        from
                        another software
                        >     >         (.mnc format) from
            which I am trying
                        to
                        generate some
                        >     >                   
             probability maps. I was
                        able
                        >     >                     to
            convert the .mnc to
                        .mgz
                        surface overlay
                        >     using
                        >     >         mri_vol2surf for
            my MRIs after
                        running all
                        MRIs in
                        >     >                   
             recon-all. So, now I
                        have
                        >     >                     all my
            painted voxels as
                        surface overlays, as I
                        >     >         was instructed to
            do a few months
                        ago.
                        >     >
                        >     >                     I was
            told that the next
                        step
                        would be to use
                        >     >         mri_surf2surf to
            resample the
                        overlays to
                        fsaverage.
                        >     >
                        >     >                     I am a
            bit confused as I
                        would
                        think that
                        >     the next
                        >     >         step would be to
            take the surface
                        overlays
                        and
                        >     >                   
             inflate them before I
                        register
                        >     >                     them
            to fsaverage. I see
                        that
                        when recon-all
                        >     runs,
                        >     >         it computes the
            registration of the
                        MRI
                        surface to
                        >     >                   
             fsaverage and saves it
                        as
                        >     >                   
             sphere.reg. Is there a
                        way I
                        can inflate my
                        >     >         surface overlays
            in a similar manner
                        and
                        then apply this
                        >     >                     same
            registration to my
                        >     >                   
             surface overlays? Or am
                        I
                        missing something?
                        >     >
                        >     >                     thanks
            very much!
                        >     >
                        >     >                   
             Trisanna
                        >     >
                        >     >
                        >     >                     --
                        >     >                     Ph.D.
            CandidateMcGill
                        University
                        >     >                   
             Integrated Program in
                        Neuroscience
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             Psychology
                        >     >
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                        >   
             <mailto:Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu>>
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                        >     >
                        >     >
                        >     >               The
            information in this e-mail
                        is
                        intended only
                        >     for the
                        >     >         person to whom it
            is
                        >     >               addressed.
            If you believe this
                        e-mail was sent to
                        >     you in
                        >     >         error and the
            e-mail
                        >     >               contains
            patient information,
                        please
                        contact the
                        >     >         Partners
            Compliance HelpLine at
                        >     >
            http://www.partners.org/complianceline . If
                        the
                        e-mail was
                        >     >         sent to you in
            error
                        >     >               but does not
            contain patient
                        information, please
                        >     contact
                        >     >         the sender and
            properly
                        >     >               dispose of
            the e-mail.
                        >     >
                        >     >
                        >     >
                        >     >
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            this e-mail is
                        intended
                        only for the
                        >     person to
                        >     >     whom it is
                        >     >     addressed. If you
            believe this e-mail
                        was sent
                        to you in
                        >     error and
                        >     >     the e-mail
                        >     >     contains patient
            information, please
                        contact
                        the Partners
                        >     >     Compliance HelpLine at
                        >     >
            http://www.partners.org/complianceline . If
                        the
                        e-mail was sent to
                        >     >     you in error
                        >     >     but does not contain
            patient
                        information,
                        please contact the
                        >     >     sender and properly
                        >     >     dispose of the e-mail.
                        >     >
                        >     >
                        >     >
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                        >
                        >     --
                        >     Douglas N. Greve, Ph.D.
                        >     MGH-NMR Center
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                        --
                        Douglas N. Greve, Ph.D.
                        MGH-NMR Center
                        gr...@nmr.mgh.harvard.edu
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