J'aurais tendance à dire qu'il n'y a pas lieu de s'offusquer trop violemment des limitations actuelles d'apt (l'outil, pas l'écosystème) vu que comme l'a souligné Charles, les auteurs en sont conscients et espèrent les abroger dans le futur, sans -à mon avis- faire preuve de morgue.
Et apt (l'outil) n'est pas a priori destiné à être ce qu'aptitude ambitionnait il fut un temps (universel, interactif et batch, CLI/TUI/GUI, etc...). A priori toujours, de ce que je comprends, le but de départ de la création de l'outil apt était de simplifier l'usage *interactif* en ayant un frontal unique au lieu des commandes séparées apt-*, tout en conservant ces commandes apt-* dont le cahier des charges comprend l'utilisation batch.
Tant que tu peux t'en sortir (tu as les compétences pour) et que les outils ne disparaissent pas (même dselect est encore là), même si tu peux trouver cela irritant, tu trouveras sûrement des sujets de frustration autrement plus ennuyeux et sans solution évidente ni immédiatement applicable, tant dans ta vie de Debianiste que dans ta vie tout court. Même si je te souhaite que ça n'arrive pas.
Allez, c'est un peu tardif mais je t'offre une part de galette des rois virtuelle pour rosifier ton horizon ;-)

