I ran into something similar a Mac running High Sierra. I never got a straight update to work. The solution was to first explicitly conda uninstall rdkit, and then reinstall after it had been completely removed.
Best of luck! On Thu, Feb 7, 2019 at 7:38 AM Czodrowski, Paul < paul.czodrow...@tu-dortmund.de> wrote: > Dear Taka, > > > > I’m facing trouble with Python3.6 and RDKit on Mac, see here: > https://sourceforge.net/p/rdkit/mailman/message/36415085/ > > > > Therefore, I’m unfortunately restricted to stick to Python3.5 > > > > I just tried out the conda-forge, but here rdkit is still in the 2018-03 > version: > > rdkit: 2018.03.3.0-py35h04f5b5a_1 rdkit --> > 2018.03.4-py35h557c172_0 conda-forge > > > > > > Cheers, > > Paul > > > > *Von: *Taka Seri <serit...@gmail.com> > *Datum: *Donnerstag, 7. Februar 2019 um 12:43 > *An: *"Czodrowski, Paul" <paul.czodrow...@tu-dortmund.de> > *Cc: *"rdkit-discuss@lists.sourceforge.net" < > rdkit-discuss@lists.sourceforge.net> > *Betreff: *Re: [Rdkit-discuss] conda install rdkit > > > > Dear Paul, > > > > Current version of rdkit is provided for python3.6 and 2.7 from anaconda > "rdkit" and "conda-forge" channel. > > https://anaconda.org/rdkit/rdkit/files?version=2018.09.1.0 > > https://anaconda.org/conda-forge/rdkit/files?version=2018.09.1 > > i recommend you to make python3.6 environment for using newest version of > rdkit if you don't have a specific reason to use python3.5. > > > > Kind regards, > > > > Taka > > > > 2019年2月7日(木) 20:06 Czodrowski, Paul <paul.czodrow...@tu-dortmund.de>: > > Dear RDKitters, > > > > in my python3.5 conda environment on macOS, I’m running rdkit version > 2018.03.3.0. I would like to update it to 2018.09, but simply “conda update > rdkit” or “conda update -c rdkit rdkit” does not help. > > > > Any help/comment would be highly appreciated. > > > > > > Cheers, > > Paul > > *Wichtiger Hinweis: Die Information in dieser E-Mail ist vertraulich. Sie > ist ausschließlich für den Adressaten bestimmt. Sollten Sie nicht der für > diese E-Mail bestimmte Adressat sein, unterrichten Sie bitte den Absender > und vernichten Sie diese Mail. Vielen Dank. * > > > * Unbeschadet der Korrespondenz per E-Mail, sind unsere Erklärungen > ausschließlich final rechtsverbindlich, wenn sie in herkömmlicher > Schriftform (mit eigenhändiger Unterschrift) oder durch Übermittlung eines > solchen Schriftstücks per Telefax erfolgen. Important note: The information > included in this e-mail is confidential. It is solely intended for the > recipient. If you are not the intended recipient of this e-mail please > contact the sender and delete this message. Thank you. Without prejudice of > e-mail correspondence, our statements are only legally binding when they > are made in the conventional written form (with personal signature) or when > such documents are sent by fax. * > > _______________________________________________ > Rdkit-discuss mailing list > Rdkit-discuss@lists.sourceforge.net > https://lists.sourceforge.net/lists/listinfo/rdkit-discuss > > > > > *Wichtiger Hinweis: Die Information in dieser E-Mail ist vertraulich. Sie > ist ausschließlich für den Adressaten bestimmt. Sollten Sie nicht der für > diese E-Mail bestimmte Adressat sein, unterrichten Sie bitte den Absender > und vernichten Sie diese Mail. Vielen Dank. Unbeschadet der Korrespondenz > per E-Mail, sind unsere Erklärungen ausschließlich final rechtsverbindlich, > wenn sie in herkömmlicher Schriftform (mit eigenhändiger Unterschrift) oder > durch Übermittlung eines solchen Schriftstücks per Telefax erfolgen. > Important note: The information included in this e-mail is confidential. It > is solely intended for the recipient. If you are not the intended recipient > of this e-mail please contact the sender and delete this message. Thank > you. Without prejudice of e-mail correspondence, our statements are only > legally binding when they are made in the conventional written form (with > personal signature) or when such documents are sent by fax. * > _______________________________________________ > Rdkit-discuss mailing list > Rdkit-discuss@lists.sourceforge.net > https://lists.sourceforge.net/lists/listinfo/rdkit-discuss >
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