志賀さま、鶴谷さま、たかのさま、中治さま、うちかわさま、いいじまさま
アドバイス、ありがとうございます。 [EMAIL PROTECTED] wrote: | 志賀です。 | が、あくまでも32bitバイナリなので | | > そうなんですけど、大きなデータを扱うので、64bit環境が使いたいので、、、 | | この要求は満たせないと思います。 そうですね、64bitでmuleをコンパイルしないと無理ですね。 主な目的は、塩基配列の解析です。 ACGTと読めなかった部分のNの5つのキャラクターからなる イネの染色体1本分の塩基配列のファイルがあるのですが、 http://rgp.dna.affrc.go.jp/IRGSP/Build4/build4.html 12本の染色体のファイルを1個にまとめると、 イネの一次情報すべてが1個のファイルに納まります。 この中から、互いに似た部分や、回文構造などの特殊な構造を 取り得る配列を抽出しています。 パズルみたいで、なかなか面白いですが、ディスクから読み出すと 時間がかかるので、プログラムを64bitでコンパイルして、 すべてをメモリ上で計算したいわけです。まだ、32bitでも 大丈夫なのですが、そのうち足りなくなりますので、 準備をしているところです。 [EMAIL PROTECTED] wrote: | こんにちは、鶴谷です。 | | libXaw.so.7だけの問題ではない気もしますが... | 本当に何とかでっちあげて使いたいなら、依存するものすべてを用意しないと | いけないでしょうね。 | 少なくとも、XFree86かXorgのライブラリ(例えばx11/xorg-librariesで | インストールされるもの)は、amd64のバイナリと区別するために、 | 別のディレクトリを作ってコピーしないといけないと思います。 | その上で、ldconfigで適切に指定してやれば、動くんじゃないかと思います。 [EMAIL PROTECTED] wrote: | たかのです。こんにちは。 | ＃firefox は 30 個以上のライブラリを必要とします・・。 | | /usr/lib32 にベースシステムの 32bit ライブラリが用意はされてい | るのですが、ports/packages のライブラリが無いので 32bit 版をイン | ストールしようとしても PREFIX が /usr/local とか /usr/X11R6 で | 64bit 版とかぶるので、/usr/local32 とか /usr/X11R632 が欲しいと | か思ってしまいます。 | | rc.conf 的には ldconfig_paths や ldconfig_local32_dirs があっ | たりもするので考えられているのだろうとは思うのですが、いかんせん | インストールしなければならない 32bit packages が多すぎるので非現 | 実的だと思い断念ました。 | | 何か良い手は無いですかねぇ？ そうなんです。libXawを /usr/lib32 にコピーしても次々別のライブラリーが 無いと出て来て、あきらめました。良い仕組みがあるといいのですが。 [EMAIL PROTECTED] wrote: | うちかわです | | 昨日書いて出そうとしたのですがMLの設定が変更されている件に引っかかって | 出し直しです。遅くなってかえってよかったかも。 | | 私は概ね「あるがままに使う派」なので別の流儀で わたしも、あるがまま mule をずっと使って来たのですが、ここに来て 使えなくなりそうなので、焦ったわけです。 .Xresoucesにペーストして、Xを再起動して(正確には、TightVNCを立ち上げ なおして)、emacsを立ち上げると、shinonomeが無いと言って来て 立ち上がりません。shinonomeフォントは入っていますし、mozillaを立ち上げて 設定からfontを見るとshinonomeは確認できます。ただし、xfontselでは 見えません。fixedに書き換えようかと思っているところです。 [EMAIL PROTECTED] wrote: | | 今さら FreeBSD/amd64 で mule を使えるようにしようとしていることが問題 | をややこしくしていると思います。:-) | | FreeBSD/i386のmuleをFreeBSD/amd64で動かすための作業より、FreeBSD/amd64 | でEmacs-21.4をインストールして使えるようにする方が手間は少ないと思いま | す。 そうですね。やっぱり、emacs でしょうね。 [EMAIL PROTECTED] wrote: | いいじまです。 | | Ports の中身をあさってみてもらえばわかりますが、すでに FreeBSD 4.x i386 | の段階でも、mule はソースからのコンパイルは不可能になっています。 | | というのは、mule は crt0.op を使わずに独自のスタートアップルーチンを使う | ので、これが OS のバージョンアップによって変わると、その部分は最初から | 作り直さなければいけなくなるのです。 | | 私自身も mule を愛用していますが、最近は Emacs 21 を使うことも多くなりました。 muleをコンパイルできるようにするのは大変そうですね。 どうも、emacsに移行するしかないかなと思いはじめました。 # いいじまさんのページ、参考にさせていただいています。ありがとうございます。 -- 宮尾安藝雄 博士(農学) 独立行政法人 農業生物資源研究所 分子遺伝研究グループ 遺伝子機能研究チーム イネゲノムリソースセンター 併任 〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2 TEL 029-838-7020 FAX 029-838-7020 mailto:[EMAIL PROTECTED] 居場所 http://tos.nias.affrc.go.jp/cgi-bin/renraku.cgi?id=miyao
