[R-es] Como cambiar el tamaño de los árboles de clasificación

2017-12-15 Por tema Manuel Mendoza
sea más pequeño para que las hojas no queden como simples líneas? Gracias -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID Spain

Re: [R-es] Como cambiar el tamaño de los árboles de clasificación

2017-12-15 Por tema Manuel Mendoza
-tree-mean Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 15 de diciembre de 2017, 9:49, Manuel Mendoza escribió: Muy buenas; mi primera consulta. Utilizo rpart (con as.party) y evtree, para obtener árboles de clasificación. Los represento en una windows() aparte, pero cuando el árbol es un

[R-es] partialPlot en un Randomforest

2018-01-06 Por tema Manuel Mendoza
response (regression) que nos indica como varía la VR en función de la variable considerada, manteniendo el resto de variables fijas. No encuentro lo que es esa VR por ningún sitio (varianza?), ni la explicación de qué son los dos ejes. Gracias, Manuel -- Dr Manuel Mendoza Department of

Re: [R-es] partialPlot en un Randomforest

2018-01-07 Por tema Manuel Mendoza
e que Species sea "versicolor". Y algo parecido para cuando tienes un modelo de "regresión". No sé ese "VR" que comentas en tu duda de dónde sale... Si estás interesado en este tema, mira también el paquete "pdp". Gracias, Carlos Ortega www.qualityexc

[R-es] Random Forests

2018-01-17 Por tema Manuel Mendoza
Buenas tardes a todos. El paquete randomForest tiene la función treesize, que es el nº de nodos. Me dan valores realmente elevados (en torno a 1000), y eso me parece extraño. ¿sabéis si es así? Gracias, Manuel -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum

Re: [R-es] Random Forests

2018-01-20 Por tema Manuel Mendoza
ne un valor de 500. Mira qué valor tiene "ntrees" en tu modelo "randomForest", que seguramente le hayas indicado un valor de 1000... Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 17 de enero de 2018, 14:29, Manuel Mendoza escribió: Buenas tardes a todos. El paquete rando

Re: [R-es] Paquete pdp

2018-01-20 Por tema Manuel Mendoza
de nodos de cada uno de los árboles que hayas indicado en el valor del parámetros "ntrees" de "randomForest". Por defecto "ntrees" tiene un valor de 500. Mira qué valor tiene "ntrees" en tu modelo "randomForest", que seguramente le hayas indicad

Re: [R-es] Paquete pdp

2018-01-20 Por tema Manuel Mendoza
Acabo de encontrar que si sirve para gbm, por lo que no es esa la razón. Aquí: https://journal.r-project.org/archive/2017/RJ-2017-016/RJ-2017-016.pdf Quoting Manuel Mendoza : Buenas. El Paquete pdp es muy fácil de usar, pero cuando se lo aplico a mis datos me da: Error in eval(stats

Re: [R-es] Random Forests

2018-01-20 Por tema Manuel Mendoza
número de nodos que ves en el valor de cada uno de los elementos que igualmente devuelve "treesize(iris.rf)": 7, 10, 13... Gracias, Carlos El 20 de enero de 2018, 10:36, Manuel Mendoza escribió: Gracias Carlos y Javier, ntrees es el nº de árboles y treesize sus respectivos tamaños (nº

Re: [R-es] Random Forests

2018-01-22 Por tema Manuel Mendoza
omplejidad. Gracias, Carlos. El 20 de enero de 2018, 18:17, Manuel Mendoza escribió: Si, Carlos. Yo hago lo mismo, pero esos mismos numeritos salen enormes. treesize(RFfit) [1] 4304 4302 4311 4319 4343 4298 4298 4311 4349 4327 4331 4317 4294 4321 4283 4362 [17] 4300 4330 4266 4331 4308

Re: [R-es] Random Forests

2018-01-22 Por tema Manuel Mendoza
Gracias Jesús, lo haré. Quoting Jesús Para Fernández : Prueba con xgboost tb que funcionan muy bien! De: R-help-es en nombre de Manuel Mendoza Enviado: lunes, 22 de enero de 2018 10:44 Para: Carlos Ortega Cc: r-help-es@r-project.org Asunto: Re: [R-es

[R-es] weighting in gbm.step

2018-02-01 Por tema Manuel Mendoza
de ponerlo sin que me dé error. ¿Sabe alguno de vosotros cómo hacerlo? Gracias Quoting Manuel Mendoza : Muchas gracias Carlos; ¡tu siempre al pié del cañón! (lo puse el día de reyes a la 1.20h y me contestas a las 2.45h) Una cosa más: si el eje y es la probabilidad ¿por qué va de 0 a 10

[R-es] [data[,1]==1, 2]

2018-02-01 Por tema Manuel Mendoza
Algo muy sencillo: ¿cómo leeríais esto [data[,1]==1, 2]? Gracias Quoting Manuel Mendoza : Muchas gracias Carlos; ¡tu siempre al pié del cañón! (lo puse el día de reyes a la 1.20h y me contestas a las 2.45h) Una cosa más: si el eje y es la probabilidad ¿por qué va de 0 a 10? En un RF

Re: [R-es] [data[,1]==1, 2]

2018-02-01 Por tema Manuel Mendoza
ata[,1]==1, 2] [1] 0 1 1 Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 1 de febrero de 2018, 19:04, Manuel Mendoza escribió: Algo muy sencillo: ¿cómo leeríais esto [data[,1]==1, 2]? Gracias Quoting Manuel Mendoza : Muchas gracias Carlos; ¡tu siempre al pié del cañón! (lo puse el día d

Re: [R-es] [data[,1]==1, 2]

2018-02-02 Por tema Manuel Mendoza
= TRUE), +y = sample(c(0,1),10, replace = TRUE) + ) data x y 1 0 1 2 0 1 3 0 0 4 *1 0* 5 *1 1* 6 *1 1* 7 0 0 8 0 1 9 0 1 10 0 1 data[data[,1]==1, 2] [1] 0 1 1 Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 1 de febrero de 2018, 19:04, Manuel Mendoza es

[R-es] gbm.step para clasificación no binaria

2018-02-19 Por tema Manuel Mendoza
Hola erreros, ¿sabéis si gbm.step puede usarse para clasificación no binaria? Gracias -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID Spain

Re: [R-es] gbm.step para clasificación no binaria

2018-02-19 Por tema Manuel Mendoza
es la predictora. No hay otro parámetro donde por otro lado le indiques si es un modelo binario o multinominal... Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es 2018-02-19 14:03 GMT+01:00 Manuel Mendoza : Hola erreros, ¿sabéis si gbm.step puede usarse para clasificación no binaria? Gracia

Re: [R-es] gbm.step para clasificación no binaria

2018-02-19 Por tema Manuel Mendoza
usar la propia función "gbm" del paquete "gbm"?... Gracias, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 19 de febrero de 2018, 18:01, Manuel Mendoza escribió: Gracias Carlos. Hasta donde yo entiendo si las hay: El argumento family puede ser: "gaussian" (for min

Re: [R-es] gbm.step para clasificación no binaria

2018-02-19 Por tema Manuel Mendoza
excellence.es El 19 de febrero de 2018, 18:01, Manuel Mendoza escribió: Gracias Carlos. Hasta donde yo entiendo si las hay: El argumento family puede ser: "gaussian" (for minimizing squared error); por lo que tiene que ser numérica "bernoulli" (logistic regression for 0-1

Re: [R-es] gbm.step para clasificación no binaria

2018-02-19 Por tema Manuel Mendoza
etro "max_depth" que no veo la equivalente en randomForest o ranger de R... Saludos, Carlos Ortega. El 19 de febrero de 2018, 22:02, Manuel Mendoza escribió: Hola de nuevo. Se me olvidaba la principal razón para utilizar gbm.step del paquete dismo. Como sabéis, los boosted si sobreajust

Re: [R-es] gbm.step para clasificación no binaria

2018-02-21 Por tema Manuel Mendoza
Python RandomForestClassifier con el parámetro "max_depth" que no veo la equivalente en randomForest o ranger de R... Saludos, Carlos Ortega. El 19 de febrero de 2018, 22:02, Manuel Mendoza escribió: Hola de nuevo. Se me olvidaba la principal razón para utilizar gbm.step del paq

[R-es] Encontrar el más votado

2018-04-14 Por tema Manuel Mendoza
la categoría más votada de las 6. which.max(table(data[i,])) me da la más votada de la muestra i. Estoy intentando crear el vector con un for y de momento no me sale. ¡ya! es muy fácil, pero no me sale, y estoy seguro de que hay una forma mucho más fácil. Gracias, Manuel -- Dr Manuel

Re: [R-es] Encontrar el más votado

2018-04-14 Por tema Manuel Mendoza
Gracias Carlos J., sale bien, pero me transforma las 6 categorías en números del 1 al 6 ¿sabes cómo evitarlo? Quoting "Carlos J. Gil Bellosta" : apply(data, 1, function(x) which.max(table(x))) El sáb., 14 abr. 2018 a las 19:54, Manuel Mendoza () escribió: Buenas tardes

Re: [R-es] Encontrar el más votado

2018-04-14 Por tema Manuel Mendoza
Funciona, gracias una vez más, Manuel Quoting "Carlos J. Gil Bellosta" : Probaría con apply(data, 1, function(x) names(table(x))[which.max(table(x))]) No sé si he contado los paréntesis bien. El sáb., 14 abr. 2018 a las 20:33, Manuel Mendoza () escribió: Gracias Carlos J.,

[R-es] Averiguar qué variables tiene el máximo valor

2018-04-14 Por tema Manuel Mendoza
<- apply(df,1,which.max) me funciona, pero nuevamente me da la posición de las variables en vez de sus nombres. Quizás haya otra opción. Gracias nuevamente, Manuel -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (M

[R-es] kappa

2018-04-26 Por tema Manuel Mendoza
Buenas, ¿alguien sabe qué puede ser este error? data es una df y las columnas 23 y 24 son las que quiero comparar; están bien. testK<-kappa2(data[,c(23,24)], "equal") Error in sort.list(y) : 'x' must be atomic for 'sort.list' Have you called 'sort'

Re: [R-es] kappa

2018-04-26 Por tema Manuel Mendoza
Bueno, lo solucioné, era una tontería. Quoting Manuel Mendoza : Buenas, ¿alguien sabe qué puede ser este error? data es una df y las columnas 23 y 24 son las que quiero comparar; están bien. testK<-kappa2(data[,c(23,24)], "equal") Error in sort.list(y) : 'x&#

Re: [R-es] kappa

2018-04-26 Por tema Manuel Mendoza
Quoting "Carlos J. Gil Bellosta" : ¡Pero todos queremos saber la solución! El jue., 26 abr. 2018 a las 17:42, Manuel Mendoza () escribió: Bueno, lo solucioné, era una tontería. Quoting Manuel Mendoza : > Buenas, ¿alguien sabe qué puede ser este error? > > data es una

[R-es] predicciones sobre el OOB de randomForest

2018-05-31 Por tema Manuel Mendoza
Muy buenas, ¿sabe alguien cómo obtener las predicciones sobre el out of bag que hace randomForest? Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C

Re: [R-es] predicciones sobre el OOB de randomForest

2018-05-31 Por tema Manuel Mendoza
les... Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es 2018-05-31 12:56 GMT+02:00 Manuel Mendoza : Muy buenas, ¿sabe alguien cómo obtener las predicciones sobre el out of bag que hace randomForest? Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Gl

Re: [R-es] predicciones sobre el OOB de randomForest

2018-06-01 Por tema Manuel Mendoza
l 31 de mayo de 2018, 13:03, Manuel Mendoza escribió: Gracias Carlos. No uso caret, pero lo miraré. Quoting Carlos Ortega : Hola, Creo que si utilizas "caret" y en la función "trainControl()" defines "oob" como criterio de randomización, puedes luego recuperar de

Re: [R-es] predicciones sobre el OOB de randomForest

2018-06-01 Por tema Manuel Mendoza
). Quoting Carlos Ortega : Y prefieres "randomForest" a "ranger"...??... El 31 de mayo de 2018, 13:03, Manuel Mendoza escribió: Gracias Carlos. No uso caret, pero lo miraré. Quoting Carlos Ortega : Hola, Creo que si utilizas "caret" y en la función "trainCon

[R-es] loop con matriz que cambia de nombre

2018-06-22 Por tema Manuel Mendoza
quot;). Llevo un rato haciendo pruebas pero no me sale. A ver si alguien pudiera ayudarme, gracias, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115

Re: [R-es] loop con matriz que cambia de nombre

2018-06-22 Por tema Manuel Mendoza
aka.ms/ghei36> From: R-help-es on behalf of Manuel Mendoza Sent: Friday, June 22, 2018 10:15:55 AM To: r-help-es@r-project.org Subject: [R-es] loop con matriz que cambia de nombre Buenos días. Quiero hacer un for (j), anidado en otro for (i). En el 2º for, e

Re: [R-es] loop con matriz que cambia de nombre

2018-06-22 Por tema Manuel Mendoza
_ From: R-help-es on behalf of Manuel Mendoza Sent: Friday, June 22, 2018 10:15:55 AM To: r-help-es@r-project.org Subject: [R-es] loop con matriz que cambia de nombre Buenos días. Quiero hacer un for (j), anidado en otro for (i). En el 2º for, en cada iteración ha de c

Re: [R-es] loop con matriz que cambia de nombre

2018-06-23 Por tema Manuel Mendoza
bjetos con nombres raros en tu entorno. Lo que quieres hacer es crear una lista de matrices (o dfs). El consejo anterior te explicaba con detalle cómo dispararte en el pie. Realmente, quieres hacer otra cosa. El vie., 22 jun. 2018 a las 19:53, Manuel Mendoza () escribió: Funciona, me crea una matr

Re: [R-es] loop con matriz que cambia de nombre

2018-06-24 Por tema Manuel Mendoza
Gracias Javier, pero creo que si no consigo que me lo haga todo de una vez con un loop, me merece más la pena hacerlo como hasta ahora, una a una. Manuel Quoting Javier Marcuzzi : Estimado Manuel Mendoza No sería lo ideal, pero de pronto podría ir guardando en json, que es una forma

Re: [R-es] loop con matriz que cambia de nombre

2018-06-25 Por tema Manuel Mendoza
uot;i"). - Esto lo puedes hacer utiizando la función "paste()". - No sé si los nombres de las variables, en cada iteración han de seguir algún patrón. Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 22 de junio de 2018, 19:53, Manuel Mendoza escribió: F

Re: [R-es] loop con matriz que cambia de nombre

2018-06-25 Por tema Manuel Mendoza
Marcuzzi El dom., 24 de jun. de 2018 4:23 PM, Manuel Mendoza escribió: Gracias Javier, pero creo que si no consigo que me lo haga todo de una vez con un loop, me merece más la pena hacerlo como hasta ahora, una a una. Manuel Quoting Javier Marcuzzi : > Estimado Manuel Mendoza > > No

[R-es] error en un cmeans

2018-06-27 Por tema Manuel Mendoza
: dim(X) must have a positive length. Estoy harto de usar esa línea de código, con dfs iguales a la de ahora, por lo que no entiendo por qué falla. Gracias, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Mu

Re: [R-es] error en un cmeans

2018-06-27 Por tema Manuel Mendoza
Pues no lo sé. Es algo del código de RandomForest, supongo. Quoting Jesús Para Fernández : U es un dataframe? Obtener Outlook para Android<https://aka.ms/ghei36> From: R-help-es on behalf of Manuel Mendoza Sent: Wednesday, June 27, 2018 12:25

Re: [R-es] error en un cmeans

2018-06-28 Por tema Manuel Mendoza
t; en tu código) valga 1. El 27/06/2018 a las 12:25, Manuel Mendoza escribió: Tuve que dejar, de momento, lo del "loop con matriz que cambia de nombre" por algo más urgente, y me salió otro problema. Hago un cmeans con el paquete e1071;   cl<-cmeans(Data,i,20,verbose=F,method=

Re: [R-es] error en un cmeans

2018-06-28 Por tema Manuel Mendoza
. El El mié, 27 de jun. de 2018 a las 9:33 a. m., Manuel Mendoza < mmend...@mncn.csic.es> escribió: Pues no lo sé. Es algo del código de RandomForest, supongo. Quoting Jesús Para Fernández : > U es un dataframe? > > Obtener Outlook para Android<htt

[R-es] suma del resultado de multiplicar fila x columna

2018-06-28 Por tema Manuel Mendoza
bien: Res <- matrix(nrow=nrow(Abund),ncol=ncol(Dieta)) Res <- as.data.frame(Res) for(i in 1:nrow(Dieta)){ for(j in 1:ncol(Abund)){ a<-as.vector(Dieta[,i]) b<-as.vector(Abund[j,]) sum <- sum(a * b) Res[i,j]<-sum } print(i) } -- Dr Manuel Men

Re: [R-es] suma del resultado de multiplicar fila x columna

2018-06-28 Por tema Manuel Mendoza
Gracias, Marcelino y Carlos. Quoting Marcelino de la Cruz Rot : En concreto, Abund%*%Dieta El 28/06/2018 a las 14:46, Carlos J. Gil Bellosta escribió: Eso que cuentas se llama multiplicación matricial. Usa %*%. El jue., 28 jun. 2018 14:37, Manuel Mendoza escribió: Buenas tardes, tengo

[R-es] matriz de presencias

2018-06-29 Por tema Manuel Mendoza
Buenas tardes erreros. Tengo una df con ceros y valores>0 y necesitaría convertir esos valores>0 en unos (1). Debe de haber una forma sencilla, seguro. ¿Alguno de vosotros lo sabe? Gracias, Manuel . -- Dr Manuel M

Re: [R-es] matriz de presencias

2018-06-30 Por tema Manuel Mendoza
Gracias Marcelino y Javier(es), suponía que tenía que ser algo tan sencillo como eso. Tomaré nota para cuando me haga falta. Manuel Quoting Marcelino de la Cruz Rot : df[df>0]<-1 El 29/06/2018 a las 18:16, Manuel Mendoza escribió: Buenas tardes erreros. Tengo una df con ceros y v

[R-es] subset con los casos presentes en otra df

2018-07-02 Por tema Manuel Mendoza
en data como data2, y usarlo como uso key en el ejemplo de arriba, pero debe haber una forma más sencilla, seguro. Gracias una vez más, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natu

Re: [R-es] subset con los casos presentes en otra df

2018-07-02 Por tema Manuel Mendoza
Manuel Quoting Javier Marcuzzi : Estimado Manuel Mendoza ¿Puede redactarlo de otra forma? Yo le interpreto que usted desea filtrar los que cumplen dos condiciones, por ejemplo que mean mamíferos y pelaje rojo, por lo cuál descarta todos los mamíferos de pelaje negro como los animales rojos que no

Re: [R-es] subset con los casos presentes en otra df

2018-07-02 Por tema Manuel Mendoza
alf of Javier Marcuzzi Sent: Monday, July 2, 2018 8:56:51 PM To: Manuel Mendoza Cc: r-help-es Subject: Re: [R-es] subset con los casos presentes en otra df Estimado Manuel Mendoza ¿Puede redactarlo de otra forma? Yo le interpreto que usted desea filtrar los que cumplen dos condiciones, por ejemp

[R-es] ggplot con muchos colores

2018-11-08 Por tema Manuel Mendoza
las mismas, les da distintos colores y no puedo comparar los mapas. Muchas gracias, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID Spain

Re: [R-es] ggplot con muchos colores

2018-11-08 Por tema Manuel Mendoza
| 3000 |   cols<-c("blue", "red", "green")                names (cols)<-c("España", "Francia", "Italia")        ggplot(PAISES, aes(x=factor(Pais), y=Poblacion, fill=Pais))+                geom_col()+scale_fill_manual(va

[R-es] Asignar distancias

2018-11-10 Por tema Manuel Mendoza
categorías, pero no sé cómo seguir. Muchas gracias, como siempre, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006

Re: [R-es] Asignar distancias

2018-11-10 Por tema Manuel Mendoza
(Chema) Mateos || https://rinzewind.org/ ___ R-help-es mailing list R-help-es@r-project.org https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (MNCN

Re: [R-es] Asignar distancias

2018-11-11 Por tema Manuel Mendoza
teos : On Sun, Nov 11, 2018 at 12:43:40AM +0100, Manuel Mendoza wrote: Utilizo la función merge desde hace poco, pero no se me ocurre cómo utilizarla para esto. Yo pienso que se puede hacer con una combinación de ifelse-s pero no sé cómo. Seguro que hay más de una forma ce hacerlo. ¿Sería

[R-es] Los puntos no tapen el mapa hecho ggplot

2018-11-14 Por tema Manuel Mendoza
= "blue",high = "red", midpoint = 175, guide="colourbar",limits=c(0,350))+ labs(title = "Depth of changes")) . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural

Re: [R-es] Los puntos no tapen el mapa hecho ggplot

2018-11-14 Por tema Manuel Mendoza
anel.background=element_blank(), panel.grid.major = element_blank(), panel.grid.minor = element_blank(), axis.text.x=element_blank(), axis.text.y=element_blank(), axis.ticks = element_blank())+ xlab(""

[R-es] Subset dentro de un for

2018-12-12 Por tema Manuel Mendoza
cer el for, y no sale: GT<- c("var1","var2", … ) df2<-subset(df, subset=(GT[1]>0)) Gracias, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural Science (MNCN) Spanish Scientific Council (CS

Re: [R-es] Subset dentro de un for

2018-12-12 Por tema Manuel Mendoza
; [1] 77.34862 [1] "Solar.R" [1] 71.85294 Y otra forma à la dplyr...: library(rlang) for(i in c('Ozone', 'Solar.R')) { + print(i) + res_ult <- airquality %>% + filter(!!sym(i) < 100) %>% + summarize(Media = mean(Temp, na.rm = TRUE)) +

Re: [R-es] Subset dentro de un for

2018-12-12 Por tema Manuel Mendoza
traduciría  en GT["var1"], que, a no ser que GT tenga names , debería dar un error. Yo creo que quieres decir for(i in 1:length(GT)) ... color=get(GT[i]) El 12/12/2018 a las 18:21, Manuel Mendoza escribió: Gracias a los tres, Raúl, Marcelino y Carlos. Lo del "get" de Marceli

Re: [R-es] Subset dentro de un for

2018-12-12 Por tema Manuel Mendoza
numérica (factor o character). El 12/12/2018 a las 19:32, Manuel Mendoza escribió: Gracias Marcelino. Si, (i in 1:length(GT)), lo he utilizado mil veces, pero se me sigue olvidando de una vez a otra. Lo iba a mirar, pero me centré primero en que me hiciera bien el mapa. He probado el for y me da este

[R-es] gradiente de colores con ggplot

2018-12-26 Por tema Manuel Mendoza
ap_data('world'), aes(x=long, y=lat,group=group))+ labs(title = "Esumap 5085")) Gracias, como siempre, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural Sci

[R-es] plot3d con library(rgl)

2019-01-18 Por tema Manuel Mendoza
resente de diferente color. Gracias, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural Science (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MA

Re: [R-es] plot3d con library(rgl)

2019-01-18 Por tema Manuel Mendoza
Gracias Marcelino, funcionó, Manuel Quoting Marcelino De La Cruz Rot : Hola Manuel: Por ejemplo así: plot3d(Data$RTLML,Data$JD,Data$SB, col = c("red","blue")[as.numeric(as.factor(Family))]) El 18/01/2019 a las 13:48, Manuel Mendoza escribió: Buenas tardes. ¿Sab

[R-es] crear un vector con las categorías

2019-02-18 Por tema Manuel Mendoza
cias como siempre, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural Science (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID Spain ___ R-help-es

Re: [R-es] crear un vector con las categorías

2019-02-18 Por tema Manuel Mendoza
factor usando, por ejemplo, factor(ecsta, levels = ...) antes de ajustar el modelo. Dale una mirada a ?factor para má detalles. Saludos, Jorge.- El El lun, 18 de feb. de 2019 a las 1:03 p. m., Manuel Mendoza < mmend...@mncn.csic.es> escribió: Buenas tardes, tengo un loop que hace un

Re: [R-es] crear un vector con las categorías

2019-02-19 Por tema Manuel Mendoza
Javier Marcuzzi : Estimado Manuel Mendoza Con sus datos y a modo de curiosidad, ¿que pasa en training <- data[-i, ]? Javier Rubén Marcuzzi El lun., 18 feb. 2019 a las 19:39, Manuel Mendoza () escribió: Gracias Jorge. No entiendo bien; la variable objetivo es ya factor. El árbol me la pred

Re: [R-es] crear un vector con las categorías

2019-02-19 Por tema Manuel Mendoza
Bueno, creo que no contesté tu pregunta. Con training <- data[-i, ] crea una df llamada training, sin la muestra i, que después utiliza para entrenar el algoritmo. Quoting Javier Marcuzzi : Estimado Manuel Mendoza Con sus datos y a modo de curiosidad, ¿que pasa en training <- d

Re: [R-es] crear un vector con las categorías

2019-02-19 Por tema Manuel Mendoza
Hola Carlos ¿sabes tú qué se puede hacer para que añada la categoría en vez del nº al que corresponde? Quoting Carlos Ortega : Es una forma de hacer el LOOV (Leave One Out Validation). Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El mar., 19 feb. 2019 a las 12:45, Manuel Mendoza

[R-es] Calcular una probabilidad asociada a una variable

2019-03-04 Por tema Manuel Mendoza
no doy con la clave. Muchas gracias por vuestro tiempo, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural Science (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006

Re: [R-es] Calcular una probabilidad asociada a una variable

2019-03-04 Por tema Manuel Mendoza
distribución normal de media 0 y des 1.. > > Un saludo, > > Xavier Tibau > > Missatge de Manuel Mendoza del dia dl., 4 de març > 2019 a les 14:59: > >> Buenas tardes erreros. >> Tengo una variable que va de -20 a 40 y quiero crear otra, que vaya de >> 0 a 1

Re: [R-es] Calcular una probabilidad asociada a una variable

2019-03-04 Por tema Manuel Mendoza
Corrijo: BIO1 es la variable, opt=20 dmax=15 d<-abs(Data$BIO1-opt) N.var <-(ifelse(d > dmax , 0, 1-d/dmax)) Quoting Manuel Mendoza : Gracias Xavier y Javier, a partir de vuestros comentarios he llegado a esto, bastante sencillo: BIO1 es la variable, opt=20 dmax=15 d<-a

[R-es] Partial Dependence Plots

2019-03-08 Por tema Manuel Mendoza
randomForest no lo encuentro. Gracias, como siempre, Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural Science (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID Spain

[R-es] gbm predict as character

2019-03-19 Por tema Manuel Mendoza
me la da con el número al que corresponde cada categoría, en vez de con la categoría. Probé a poner la variable objetivo, o el resultado del apply como character, pero sale igual. Gracias, Manuel . -- Dr Manuel

[R-es] problema con ggplot2

2019-06-30 Por tema Manuel Mendoza
ace ‘pkgconfig’ 2.0.1 is being loaded, but >= 2.0.2 is required -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural Science (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID Spain ___ R-h

[R-es] ¿cómo puedo cambiar mi email para esta lista de correo?

2019-06-30 Por tema Manuel Mendoza
¿cómo puedo cambiar mi email para esta lista de correo? -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural Science (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID Spain ___ R-help-es

Re: [R-es] problema con ggplot2

2019-06-30 Por tema Manuel Mendoza
dio error, pero ahora me dice que no está: library(ggplot2) Error in library(ggplot2) : there is no package called ‘ggplot2’ Quoting Manuel Mendoza : Hace tiempo que utilizo ggplot2, pero después de haber instalado varios paquetes nuevos, al cargarlo (library(ggplot2)) me da este error

Re: [R-es] ¿cómo puedo cambiar mi email para esta lista de correo?

2019-06-30 Por tema Manuel Mendoza
Gracias Quoting Carlos Ortega : Tienes que recuperar uno de los correos que te tiene que estar llegando de forma periódica confirmando que estás suscrito. A través de este correo, puedes desactivar tu cuenta, poner otro correo, etc... El dom., 30 jun. 2019 a las 17:00, Manuel Mendoza

Re: [R-es] problema con ggplot2

2019-06-30 Por tema Manuel Mendoza
ya sabrás)... Gracias, Carlos. El dom., 30 jun. 2019 a las 17:10, Manuel Mendoza () escribió: Encontré esta "solución": remove.packages(c("ggplot2", "data.table")) install.packages('Rcpp', dependencies = TRUE) install.packages('ggplot2', dependencie

[R-es] Cambiar el nombre de las variables de forma automática

2019-09-06 Por tema Manuel Mendoza
Buenas tardes. Tengo una base de datos con 3200 variables. El nombre de todas ellas tiene un punto. Por ej., Canis.aureus. ¿Es posible cambiar ese punto por un espacio, en todas ellas, de forma automática? Esa quedaría así: Canis aureus Gracias [[alternative HTML version deleted]] __

[R-es] Cambiar el nombre de las variables de forma automática

2019-09-06 Por tema Manuel Mendoza
Buenas tardes. Tengo una base de datos con 3200 variables. El nombre de todas ellas tiene un punto. Por ej., Canis.aureus. ¿Es posible cambiar ese punto por un espacio, en todas ellas, de forma automática? Esa quedaría así: Canis aureus Manuel, Gracias [[alternative HTML version deleted]]

Re: [R-es] Cambiar el nombre de las variables de forma automática

2019-09-06 Por tema Manuel Mendoza
t;- my_names > > Gracias, > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es > > > El vie., 6 sept. 2019 a las 20:41, Manuel Mendoza (< > mmend...@fulbrightmail.org>) escribió: > >> Buenas tardes. Tengo una base de datos con 3200 variables. El nombre de >> todas ellas tiene un p

[R-es] loop de mapas

2019-09-14 Por tema Manuel Mendoza
Buenas tardes. Intento hacer 6 mapas en un loop, de acuerdo, cada uno de ellos, a una de 6 variables recogidas en el vector GT: GT<-c("IIFd5026","IIFd5045","IIFd5085","IIFd7026","IIFd7045","IIFd7085") for(i in GT) { NCDS <- NCDS[NCDS[[i]] > 0,] windows();print(ggplot(legend=FALSE)+geom_pa

[R-es] ggplot con gradientes complejos

2019-09-19 Por tema Manuel Mendoza
Muy buenas. Quiero hacer un mapa que me pinte en azul los valores negativos y en rojo los positivos. Los negativos llegan hasta -400 y los positivos hasta 200. Si pongo limits=c(-200, 200), me colorea bien los positivos (rojo), pero los negativos por debajo de -200 me los pone gris. Si pongo limi

Re: [R-es] ggplot con gradientes complejos

2019-09-20 Por tema Manuel Mendoza
medio. > > Si esto no lo soluciona intenta pegar el ejemplo con un subconjunto de > datos con el que se pueda reproducir (es fácil con datapasta+reprex: > https://reprex.tidyverse.org/articles/articles/datapasta-reprex.html) > > Un saludo, > Emilio > > > El 19 sept 2

Re: [R-es] ggplot con gradientes complejos

2019-09-20 Por tema Manuel Mendoza
que sea la función "scale_colour_gradient" > la que decida el color... > > Gracias, > Carlos. > > El vie., 20 sept. 2019 a las 10:30, Manuel Mendoza (< > mmend...@fulbrightmail.org>) escribió: > >> Gracias Emilio. Si, son asimétricos porque se mueven e

[R-es] Error in plot.new() : figure margins too large

2019-11-22 Por tema Manuel Mendoza
Hola erreros, a ver si alguien puede ayudarme a resolver este error: Error in plot.new() : figure margins too large. En la red hay un montón de gente con el mismo error, les dan múltiples soluciones, pero a mi no me funciona ninguna 😕 Aquí tenéis el script: library(matrixStats) mat<-data.frame(r

[R-es] Error in plot.new() : figure margins too large.

2019-11-23 Por tema Manuel Mendoza
Olvidadlo, me había equivocado al hacer la matriz. [[alternative HTML version deleted]] ___ R-help-es mailing list R-help-es@r-project.org https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

[R-es] pawer law

2019-11-23 Por tema Manuel Mendoza
Buenos días erreros, ¿sabe alguien cómo generar una df cuyas variables sigan una ley de potencias? Gracias [[alternative HTML version deleted]] ___ R-help-es mailing list R-help-es@r-project.org https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

[R-es] conocer un elemento a partir de su rowname y colname

2020-03-12 Por tema Manuel Mendoza
Buenos días erreros, tengo una df y necesito extraer un elemento de forma automática de una variable chr, pero no a partir de su posición en la df sino del nombre del caso y de la variable. Gracias, y que el coronavirus os pille bien sanos (pues no hay escapatoria). Manuel [[alternative HT

Re: [R-es] Tasa variación diaria COVID-19

2020-03-25 Por tema Manuel Mendoza
Gracias Ruben, muy interesante. Algo así estuve buscando, por ciudades y a nivel internacional, pero no lo encontré. Me bastaría con el número de fallecimientos por día, de cuantas más ciudades del mundo mejor. Si alguno supiera de algo así, le agradecería que me lo comunicase. Un saludo, Manuel E

[R-es] añadir líneas verticales con ggplot

2020-04-01 Por tema Manuel Mendoza
Buenos días, hago un mapa con ggplot: world<-map_data('world') windows();ggplot(legend=FALSE) + ... geom_point(data=Data,aes(x=lon,y=lat,color=Clst),size=1.25) + scale_color_manual(values=c("grey45","navy","skyblue","gold","green3","darkgreen")) + geom_path( data=world, aes(x=long, y=lat,gro

Re: [R-es] añadir líneas verticales con ggplot

2020-04-01 Por tema Manuel Mendoza
> > > Buenas, como os decía, hago un mapa con ggplot (pongamos este más > sencillo): > > pyt<-ggplot(data, aes(x = longitud, y = latitud)) + geom_point(aes(color = factor(ptyrup))) windows(); pyt dentro del loop incluyo: pyt + geom_vline(xintercept = i), pero entonces me borra la linea anterior,

[R-es] Fwd: añadir líneas verticales con ggplot

2020-04-01 Por tema Manuel Mendoza
Creía haberlo solucionado con: pyt<-ggplot(data, aes(x = longitud, y = latitud)) + geom_point(aes(color = factor(ptyrup))) windows();pyt e incluyendo en el loop: pyt<-pyt+ geom_vline(xintercept = i) pyt Pero no. Es extraño, pues sale bien si hago yo las iteraciones, una a una, pero cuan

[R-es] ¿puede alguien leerme esto?

2020-04-14 Por tema Manuel Mendoza
Buenas tardes, ¿puede alguien leerme esto? es de un ejemplo de forestFloor X = data[-1:-50,!names(data) %in% "ptyrup"] Y = iris[-1:-50,"Species"] Gracias [[alternative HTML version deleted]] ___ R-help-es mailing list R-help-es@r-project.org h

[R-es] ¿puede alguien leerme esto?

2020-04-14 Por tema Manuel Mendoza
Perdonad, os mandé lo que yo estaba haciendo. Es esto: X = iris[-1:-50,!names(iris) %in% "Species"] Y = iris[-1:-50,"Species"] [[alternative HTML version deleted]] ___ R-help-es mailing list R-help-es@r-project.org https://stat.ethz.ch/mailman

[R-es] (sin asunto)

2020-04-14 Por tema Manuel Mendoza
Hola de nuevo, hago un mapa con ggplot: pyt<-ggplot(data, aes(x = longitud, y = latitud)) + geom_point(aes(color = factor(ptyrup))) windows();pyt y después hago un loop con for. En vez de print(i), que me indica por dónde va el loop, me gustaría que me fuera añadiendo una línea vertical al mapa

[R-es] problemas al cambiar el nombre de una variable

2020-04-25 Por tema Manuel Mendoza
Buenos días, al final de un loop añado 3 variables que acabo de crear, a una df, y les pongo un nombre. Las variables son Max, Min y Mean. Las añado a BData7085: BData7085$Max<-Max BData7085$Min<-Min BData7085$Meann<-Mean (hasta aquí bien) Para ponerles su nombre final: colnames(BData70

[R-es] eliminar outliers para un tapply

2020-04-25 Por tema Manuel Mendoza
Hola de nuevo. Algo para lo que tampoco encuentro la solución en la red: Hago un loop en el que se calcula, para cada una de 9 variables (4 a 12) el máximo para cada una de las categorías de la variable Clst, y funciona perfectamente. for(j in 4:12){ max<-as.data.frame(tapply(Data[,j], Data$Cls

[R-es] Implementación paquete ilm

2020-04-27 Por tema Manuel Mendoza
Buenos días, estoy intentando reproducir el script de este github: http://uc-r.github.io/iml-pkg#interactions Todo iba bien hasta que en el 6º panel me encuentro esto: For any given loss function do 1: compute loss function for original model 2: for variable i in {1,...,p} do | randomize va

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